63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45515 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_45515  predicted protein  100 
 
 		 314 aa  619  1e-176  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.219674  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29850  predicted protein  40.97 
 
 		 162 aa  101  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.14 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3457  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.27 
 
 		 508 aa  51.6  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.291016  normal  0.0152952 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2136  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.69 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1259  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  36.28 
 
 		 310 aa  50.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.32 
 
 		 301 aa  50.1  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.98 
 
 		 306 aa  49.7  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1372  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.42 
 
 		 376 aa  49.3  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44260  NAD dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.11 
 
 		 306 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.665439  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4134  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:NmrA-like  28.4 
 
 		 320 aa  47.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1368  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.42 
 
 		 349 aa  47.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 318 aa  47.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  27.07 
 
 		 297 aa  47.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.49 
 
 		 296 aa  47  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1448  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.15 
 
 		 213 aa  45.8  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000730135  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1264  hypothetical protein  25.31 
 
 		 432 aa  46.2  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.45 
 
 		 309 aa  45.8  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1265  hypothetical protein  25.31 
 
 		 432 aa  45.8  0.0009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.3 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.824049  hitchhiker  0.00256302 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0107  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.15 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.83 
 
 		 298 aa  45.8  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1606  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.04 
 
 		 482 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.57 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.989614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.7 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0110  NADH dehydrogenase  29.19 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02802  hypothetical protein  24.04 
 
 		 304 aa  43.9  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000121739  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02852  conserved hypothetical protein  24.04 
 
 		 304 aa  43.9  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000137618  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.04 
 
 		 304 aa  43.9  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.4 
 
 		 331 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.65 
 
 		 312 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0661585  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.87 
 
 		 291 aa  43.9  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2605  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.04 
 
 		 338 aa  43.9  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3711  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.47 
 
 		 429 aa  43.5  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.712619  normal  0.892725 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.38 
 
 		 299 aa  43.5  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.932671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3156  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  25.56 
 
 		 304 aa  43.1  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7867  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.76 
 
 		 207 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0390  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 		 320 aa  43.1  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18610  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.56 
 
 		 307 aa  42.7  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.967608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4096  ADP-L-glycero-D-mannoheptose-6-epimerase  38.46 
 
 		 310 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4107  NmrA family protein  37.5 
 
 		 269 aa  43.1  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.824515 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.13 
 
 		 296 aa  42.7  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.527248  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3261  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  25 
 
 		 304 aa  42.7  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03427  hypothetical protein  38.46 
 
 		 310 aa  42.7  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000445441  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4992  ADP-L-glycero-D-mannoheptose-6-epimerase  38.46 
 
 		 310 aa  42.7  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000131178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3928  ADP-L-glycero-D-mannoheptose-6-epimerase  38.46 
 
 		 310 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3909  ADP-L-glycero-D-mannoheptose-6-epimerase  38.46 
 
 		 310 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0733959 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4035  ADP-L-glycero-D-mannoheptose-6-epimerase  38.46 
 
 		 310 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3990  ADP-L-glycero-D-mannoheptose-6-epimerase  38.46 
 
 		 310 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.413285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0171  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.15 
 
 		 330 aa  42.7  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4122  ADP-L-glycero-D-mannoheptose-6-epimerase  38.46 
 
 		 310 aa  42.7  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.114529  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3443  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  25.56 
 
 		 304 aa  42.7  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.81 
 
 		 319 aa  42.7  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0086  ADP-L-glycero-D-manno-heptose-6-epimerase  38.46 
 
 		 310 aa  42.7  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000290393  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03476  ADP-L-glycero-D-mannoheptose-6-epimerase, NAD(P)-binding  38.46 
 
 		 310 aa  42.7  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000780688  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2776  NADH dehydrogenase  25.22 
 
 		 328 aa  42.7  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.424947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3527  C factor cell-cell signaling protein  31.71 
 
 		 236 aa  42.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3686  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  33.33 
 
 		 307 aa  42.7  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.38956  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.47 
 
 		 294 aa  42.4  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>