More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_18610 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_18610  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  100 
 
 		 307 aa  608  1e-173  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.967608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2316  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.92 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0781595 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1041  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  31.1 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0980  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase  31.1 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.27 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.01 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0195727  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.86 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.75 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.75 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0827  hypothetical protein  27.73 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1873  putative UDP-glucose 4-epimerase  31.58 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.78 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111318  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3711  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.38 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.712619  normal  0.892725 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.76 
 
 		 310 aa  57  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.5 
 
 		 294 aa  57  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1844  UDP-glucose 4-epimerase  28.46 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.63 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.42 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.33 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14431  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  26.04 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.71 
 
 		 326 aa  55.8  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.67 
 
 		 326 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0232  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.42 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0488037  normal  0.41258 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.28 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0798  hypothetical protein  28.31 
 
 		 318 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0575  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.43 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.34 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.69 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3802  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.02 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.813564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.28 
 
 		 299 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3910  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.17 
 
 		 318 aa  53.9  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.835741  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.96 
 
 		 292 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.56 
 
 		 306 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.33 
 
 		 301 aa  53.5  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0360193  hitchhiker  0.000175953 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 		 309 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  31.94 
 
 		 318 aa  53.5  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.19 
 
 		 309 aa  53.9  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.67 
 
 		 331 aa  53.9  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.633416 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.86 
 
 		 367 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3355  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.86 
 
 		 296 aa  53.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.909711  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.47 
 
 		 327 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 		 336 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.14 
 
 		 348 aa  53.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0186538  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.82 
 
 		 321 aa  53.1  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5177  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 		 336 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5468  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 		 336 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.47 
 
 		 320 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1167  ADP-L-glycero-D-manno-heptose-6-epimerase  26.58 
 
 		 338 aa  52.8  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000000444503  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0055  hypothetical protein  32.33 
 
 		 298 aa  52.4  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.28 
 
 		 324 aa  51.6  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6346  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.4 
 
 		 296 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.191715  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2077  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.9 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2011  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.9 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.73104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2734  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.86 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 		 328 aa  52  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.10173 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.97 
 
 		 332 aa  52  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.39 
 
 		 312 aa  52.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.17 
 
 		 318 aa  51.6  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.826321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.72 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1741  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.95 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein/3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  31.72 
 
 		 330 aa  51.2  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.25 
 
 		 429 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1344  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.71 
 
 		 293 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1724  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.59 
 
 		 296 aa  51.2  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00037704  normal  0.832838 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.64 
 
 		 381 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1580  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.51 
 
 		 278 aa  51.6  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.94 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.26 
 
 		 341 aa  50.8  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4147  hypothetical protein  31.55 
 
 		 366 aa  50.4  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.6 
 
 		 322 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.94 
 
 		 310 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0447  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.07 
 
 		 316 aa  50.8  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00302715  hitchhiker  0.000000109049 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.8 
 
 		 349 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1815  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.74 
 
 		 349 aa  50.4  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.6 
 
 		 307 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.73 
 
 		 295 aa  50.4  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.87 
 
 		 286 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.73 
 
 		 295 aa  50.4  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3073  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.6 
 
 		 282 aa  50.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.419885  normal  0.223963 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.96 
 
 		 296 aa  50.4  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4165  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.03 
 
 		 296 aa  50.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.187685  normal  0.0599581 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 		 350 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.87 
 
 		 349 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.12 
 
 		 333 aa  50.1  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.59 
 
 		 310 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3106  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.48 
 
 		 278 aa  50.1  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2109  putative UDP-glucose 4-epimerase  31.29 
 
 		 323 aa  50.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.947732 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0478  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.86 
 
 		 296 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1198  UDP-glucose 4-epimerase  34.19 
 
 		 318 aa  49.3  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.573437  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2231  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  22.94 
 
 		 261 aa  49.3  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 306 aa  49.7  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.88 
 
 		 320 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0435  epimerase/dehydratase family protein, putative  27.87 
 
 		 353 aa  49.3  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0291791  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3173  UDP-galactose 4-epimerase, putative  26.44 
 
 		 309 aa  49.3  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  31.55 
 
 		 329 aa  49.3  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0713  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.88 
 
 		 304 aa  48.9  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0538  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.18 
 
 		 292 aa  49.3  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.503847  normal  0.0356517 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.76 
 
 		 318 aa  49.3  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0278  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.37 
 
 		 317 aa  49.3  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.572641  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>