More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1748 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
328 aa  679    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.10173 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1916  NAD-dependent epimerase/dehydratase  84.36 
 
 
330 aa  578  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.215962 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  78.22 
 
 
330 aa  535  1e-151  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1020  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  65.85 
 
 
331 aa  437  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.280879  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2976  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  65.85 
 
 
331 aa  437  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000873093  hitchhiker  0.00000190147 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.85 
 
 
331 aa  437  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979048  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1190  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  65.85 
 
 
331 aa  436  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.380145  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.91 
 
 
319 aa  298  8e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1439  epimerase/dehydratase, putative  48.19 
 
 
329 aa  287  2e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2896  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.52 
 
 
318 aa  281  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.77 
 
 
353 aa  196  7e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.87 
 
 
319 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0589  sugar epimerase family protein  25.98 
 
 
321 aa  102  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.84 
 
 
298 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
307 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000104829  normal  0.0341268 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.44 
 
 
331 aa  98.2  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.478693  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1873  putative UDP-glucose 4-epimerase  27.24 
 
 
306 aa  95.9  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.03 
 
 
308 aa  95.5  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0827  hypothetical protein  25.54 
 
 
318 aa  94.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.05 
 
 
315 aa  94  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0171245  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  26.22 
 
 
324 aa  93.2  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  25.69 
 
 
318 aa  92.8  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0634  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 
346 aa  92.8  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133207  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
318 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1754  UDP-glucose 4-epimerase, putative  24.19 
 
 
326 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0706021  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0798  hypothetical protein  23.91 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23450  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  26.63 
 
 
317 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292756  hitchhiker  0.00536132 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  26.89 
 
 
332 aa  85.9  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.01 
 
 
328 aa  85.9  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.54 
 
 
315 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.23 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.31 
 
 
321 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.38 
 
 
314 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2639  UDP-glucose 4-epimerase  24.15 
 
 
323 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.05 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.3 
 
 
321 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.824049  hitchhiker  0.00256302 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0568  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.61 
 
 
322 aa  82  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000335133  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.57 
 
 
324 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.18 
 
 
322 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.175759 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.15 
 
 
293 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.31 
 
 
319 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  35.42 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1335  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.22 
 
 
338 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0357756 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.03 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.74 
 
 
320 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0253949  normal  0.427643 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.77 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.77 
 
 
321 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.966324  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.24 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000549333 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.98 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.39 
 
 
349 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4054  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 
320 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856106  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.16 
 
 
321 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.91 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.91 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1844  UDP-glucose 4-epimerase  26.83 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.04 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3457  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.62 
 
 
508 aa  77  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.291016  normal  0.0152952 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3638  UDP-glucose 4-epimerase, putative  24.71 
 
 
326 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein/3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  25.53 
 
 
330 aa  76.6  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0260  UDP-glucose 4-epimerase  29.52 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.115261  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  32.45 
 
 
337 aa  75.9  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.84 
 
 
315 aa  75.9  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3069  UDP-galactose-4-epimerase  28.26 
 
 
339 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1803  UDP-sugar epimerase  26.67 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.198516  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1984  UDP-glucose 4-epimerase  23.26 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.22 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.46 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0935797  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.09 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0715  epimerase/dehydratase family protein, putative  25.94 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186861  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.28 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.28 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.28 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.28 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.28 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1781  hopanoid-associated sugar epimerase  25.51 
 
 
329 aa  73.6  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.889296  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.18 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.667307 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1265  UDP-galactose-4-epimerase  27.62 
 
 
339 aa  73.6  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3129  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.28 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1559  UDP-glucose 4-epimerase  29.77 
 
 
338 aa  73.6  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0142095  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2122  hypothetical protein  25.51 
 
 
329 aa  73.6  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.744824  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  28.28 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0713  UDP-glucose 4-epimerase  30 
 
 
339 aa  73.2  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.56 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3173  UDP-galactose 4-epimerase, putative  23.91 
 
 
309 aa  72  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71224  Sterol-4-alpha-carboxylate 3-dehydrogenase, decarboxylating  25.65 
 
 
349 aa  72  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.12365 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00460  C-3 sterol dehydrogenase (C-4 sterol decarboxylase), putative  30.67 
 
 
448 aa  71.2  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.257092  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2149  UDP-glucose 4-epimerase  30.99 
 
 
335 aa  71.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  29.38 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000122092 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.62 
 
 
318 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.64 
 
 
320 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.78 
 
 
324 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.64 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.17 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  29.72 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.55 
 
 
331 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.633416 
 
 
-
 
NC_004310  BR1066  UDP-glucose 4-epimerase  29.72 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0920176  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1236  UDP-galactose 4-epimerase  28.57 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3310  UDP-glucose 4-epimerase  26.47 
 
 
340 aa  70.5  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138688  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  31.87 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>