232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1481 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
367 aa  768    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.7 
 
 
372 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506617 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3802  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.53 
 
 
375 aa  436  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.5 
 
 
383 aa  434  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1981  WbjC  54.5 
 
 
373 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3032  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.67 
 
 
369 aa  352  7e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.98 
 
 
369 aa  348  1e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5443  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.93 
 
 
369 aa  341  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1622  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.78 
 
 
374 aa  339  4e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1693  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.69 
 
 
396 aa  339  4e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0140  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.29 
 
 
369 aa  328  6e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.29 
 
 
369 aa  328  6e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0559  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.94 
 
 
372 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0160035  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.69 
 
 
372 aa  200  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0951736  normal  0.0534111 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.61 
 
 
372 aa  194  2e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18630  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.89 
 
 
381 aa  192  6e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.78 
 
 
364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.1 
 
 
321 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3129  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.1 
 
 
321 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.1 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  25.1 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.1 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.1 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.1 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  26.15 
 
 
332 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.43 
 
 
320 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.73 
 
 
321 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 
285 aa  59.7  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.63 
 
 
303 aa  59.3  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.51 
 
 
305 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.66 
 
 
287 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.23 
 
 
318 aa  57  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.57 
 
 
318 aa  57  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  24.62 
 
 
318 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1873  putative UDP-glucose 4-epimerase  28.18 
 
 
306 aa  56.2  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.31 
 
 
321 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.17 
 
 
302 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.107355  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  26.74 
 
 
324 aa  55.1  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.12 
 
 
281 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.2 
 
 
321 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.62 
 
 
327 aa  55.5  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.2 
 
 
321 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.49 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.88 
 
 
321 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.966324  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.27 
 
 
367 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1677  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.83 
 
 
315 aa  53.9  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01011  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.7 
 
 
324 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0798  hypothetical protein  25.51 
 
 
318 aa  53.5  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2048  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.74 
 
 
304 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
328 aa  53.1  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.869195 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18610  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  22.86 
 
 
307 aa  53.1  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.967608  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6265  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.07 
 
 
379 aa  52.8  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.83 
 
 
304 aa  52.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.47 
 
 
320 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.43 
 
 
331 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2558  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.23 
 
 
335 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0837  hypothetical protein  27.43 
 
 
308 aa  52.4  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2307  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.09 
 
 
311 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124145  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1815  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.72 
 
 
311 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.437537  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.32 
 
 
315 aa  51.6  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0171245  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0185  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  28.69 
 
 
158 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
285 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5446  UDP-glucose 4-epimerase  26.44 
 
 
290 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.26 
 
 
307 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein/3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  26.98 
 
 
330 aa  51.2  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.82 
 
 
307 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.22 
 
 
313 aa  51.2  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000549333 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.51 
 
 
333 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.51 
 
 
333 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2403  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5 epimerase  27.87 
 
 
158 aa  50.8  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.930193  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23780  UDP-glucose 4-epimerase  23.38 
 
 
308 aa  50.8  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00097023  normal  0.178512 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 
324 aa  50.8  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.5 
 
 
306 aa  50.4  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.31 
 
 
313 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101003  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.62 
 
 
301 aa  50.1  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0360193  hitchhiker  0.000175953 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0225  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein/3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  24.81 
 
 
330 aa  50.1  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.86 
 
 
264 aa  50.1  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.112246  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5517  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.1 
 
 
315 aa  50.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1844  UDP-glucose 4-epimerase  26.61 
 
 
309 aa  50.1  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20890  ADP-L-glycero-D-mannoheptose 6-epimerase  30.37 
 
 
332 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.26 
 
 
304 aa  49.7  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1793  ADP-L-glycero-D-mannoheptose 6-epimerase  29.17 
 
 
330 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0728  ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase precursor  28.07 
 
 
331 aa  49.7  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.471131  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0827  hypothetical protein  25.41 
 
 
318 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0169  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase (UDP-glucose 4-epimerase)  24.68 
 
 
319 aa  48.9  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.58 
 
 
327 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0173  ADP-L-glycero-D-mannoheptose-6-epimerase  28.65 
 
 
310 aa  48.9  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.184185  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2220  Male sterility-like protein  25.37 
 
 
306 aa  49.3  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589015  normal  0.345847 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44260  NAD dependent epimerase/dehydratase  25.62 
 
 
303 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.54 
 
 
348 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0212169 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.79 
 
 
336 aa  48.5  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111318  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0086  polysaccharide biosynthesis protein CapD  24.77 
 
 
645 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.94 
 
 
329 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1706  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.22 
 
 
309 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4054  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.36 
 
 
320 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856106  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3686  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.36 
 
 
307 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.38956  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.37 
 
 
308 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.58 
 
 
320 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.95 
 
 
321 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0455537  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5596  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.02 
 
 
405 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>