More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3571 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
321 aa  662    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0455537  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0895  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.19 
 
 
338 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000813821  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1172  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.94 
 
 
331 aa  383  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.97 
 
 
332 aa  351  1e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5604  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.4 
 
 
332 aa  347  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.31 
 
 
333 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8814  normal  0.864818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4499  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.31 
 
 
333 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.181285 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4358  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.61 
 
 
327 aa  327  1.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18701  predicted protein  48.43 
 
 
376 aa  317  2e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00776601 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45434  nad-dependent epimerase/dehydratase  47.5 
 
 
364 aa  296  4e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.172272  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3678  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.99 
 
 
329 aa  273  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1677  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.42 
 
 
336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.12 
 
 
318 aa  142  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4843  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.11 
 
 
341 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.714533  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4020  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 
318 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.11 
 
 
318 aa  138  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2307  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.21 
 
 
311 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124145  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2127  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.14 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1182  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.63 
 
 
322 aa  132  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.14 
 
 
313 aa  132  9e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794715  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.75 
 
 
319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3228  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.46 
 
 
316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 
312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.144888  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0473  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.52 
 
 
337 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0542  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.52 
 
 
337 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0900  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.62 
 
 
326 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.425817  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3393  dTDP-glucose 4,6-dehydratase, NAD-dependent epimerase/dehydratase-related protein  28.62 
 
 
326 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.229105  normal  0.0838562 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.44 
 
 
330 aa  129  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.46 
 
 
311 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.62 
 
 
323 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.059052  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4619  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.62 
 
 
323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000781919 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4620  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 
312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000717233 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 
337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4108  putative nucleotide di-P-sugar epimerase or dehydratase  30.06 
 
 
320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353388  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.79 
 
 
313 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000855956  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.76 
 
 
316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.577574  normal  0.786667 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5517  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.64 
 
 
315 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1294  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.58 
 
 
360 aa  127  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26434  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1794  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.82 
 
 
345 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.381286  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.75 
 
 
324 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0160  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.82 
 
 
345 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.177339  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.366265  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.73 
 
 
314 aa  125  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.74 
 
 
327 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1178  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 
317 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0253268  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.96 
 
 
310 aa  125  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1611  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.34 
 
 
313 aa  124  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.709629  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0778  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.59 
 
 
316 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00475764  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2234  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 
313 aa  124  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43376  predicted protein  29.75 
 
 
326 aa  124  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412352  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.67 
 
 
310 aa  124  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.453654  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.87 
 
 
311 aa  124  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.35 
 
 
346 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.544479  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.84 
 
 
314 aa  123  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.467345  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.04 
 
 
316 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301245  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1815  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.03 
 
 
311 aa  123  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.437537  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.75 
 
 
336 aa  122  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14221  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.64 
 
 
311 aa  122  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.84912  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.52 
 
 
317 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.05 
 
 
316 aa  122  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5784  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.56 
 
 
319 aa  122  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.667939  normal  0.0304013 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.19 
 
 
319 aa  122  9e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 
318 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2802  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 
317 aa  121  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.27 
 
 
347 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.131148 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.81 
 
 
317 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1331  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.82 
 
 
345 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4588  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.48 
 
 
311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0254  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.34 
 
 
329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0408  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.253997 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1140  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.52 
 
 
312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193248  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.141904 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 
328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0261  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.09 
 
 
311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.370218  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1147  GDP-L-fucose synthetase  29.69 
 
 
322 aa  120  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3791  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.17 
 
 
313 aa  120  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0464  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.96 
 
 
325 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3924  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.44 
 
 
329 aa  120  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.0226045 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3614  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.44 
 
 
329 aa  120  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.34994  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 
348 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0212169 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.85 
 
 
318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.7 
 
 
313 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 
320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.579578  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.03 
 
 
348 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0857049  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.03 
 
 
348 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.47827  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1288  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.03 
 
 
348 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2263  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.03 
 
 
348 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.171141  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0024  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.28 
 
 
326 aa  119  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235622  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0035  GDP-fucose synthetase  27.91 
 
 
312 aa  119  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0178713 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1378  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.03 
 
 
348 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280113  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.37 
 
 
333 aa  119  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.37 
 
 
333 aa  119  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1542  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 
335 aa  119  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.920861  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3158  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.03 
 
 
348 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0477125  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3029  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.03 
 
 
348 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.965327  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2077  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.58 
 
 
314 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3862  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  31.33 
 
 
319 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5160  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 
312 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195142  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.38 
 
 
321 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33309  predicted protein  30.41 
 
 
340 aa  119  7.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>