More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3029 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
383 aa  798    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3802  NAD-dependent epimerase/dehydratase  77.48 
 
 
375 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.08 
 
 
372 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1981  WbjC  62.2 
 
 
373 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.5 
 
 
367 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1693  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.94 
 
 
396 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1622  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.66 
 
 
374 aa  363  3e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3032  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.11 
 
 
369 aa  359  5e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.57 
 
 
369 aa  343  2e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5443  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.2 
 
 
369 aa  342  9e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.78 
 
 
369 aa  326  4.0000000000000003e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0140  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.78 
 
 
369 aa  326  4.0000000000000003e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0559  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.55 
 
 
372 aa  324  2e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0160035  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.08 
 
 
372 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0951736  normal  0.0534111 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18630  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.86 
 
 
381 aa  190  2.9999999999999997e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.68 
 
 
372 aa  191  2.9999999999999997e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.31 
 
 
364 aa  162  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
336 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111318  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0160  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.41 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.47 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.25 
 
 
315 aa  66.2  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0171245  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1873  putative UDP-glucose 4-epimerase  28.99 
 
 
306 aa  65.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 
313 aa  65.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000549333 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0129  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.23 
 
 
322 aa  64.3  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0225  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein/3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  27.55 
 
 
330 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  31.78 
 
 
324 aa  63.9  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
329 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.98 
 
 
319 aa  63.2  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.75 
 
 
310 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 
331 aa  62.8  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.72 
 
 
348 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0212169 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
320 aa  62  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.75 
 
 
310 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.35 
 
 
320 aa  61.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.579578  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5784  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.08 
 
 
319 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.667939  normal  0.0304013 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2558  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.09 
 
 
335 aa  60.8  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.55 
 
 
330 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000230956 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.75 
 
 
310 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.83 
 
 
320 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.18 
 
 
313 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.26 
 
 
318 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
324 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4509  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.96 
 
 
325 aa  58.9  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0162  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.18 
 
 
313 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.54 
 
 
330 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46913  normal  0.0352982 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 
323 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.82 
 
 
341 aa  58.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 
328 aa  58.9  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.26 
 
 
313 aa  58.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210062  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.15 
 
 
331 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1803  UDP-sugar epimerase  30.4 
 
 
323 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.198516  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.96 
 
 
313 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.376158  normal  0.0242286 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.44 
 
 
321 aa  57.8  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000270425 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 
318 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1677  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.22 
 
 
315 aa  57.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.03 
 
 
307 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  29.35 
 
 
318 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.69 
 
 
331 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.633416 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.83 
 
 
327 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.84 
 
 
342 aa  57  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2769  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.23 
 
 
318 aa  56.6  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.48 
 
 
309 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0782  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.83 
 
 
316 aa  56.2  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.182086  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1165  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.37 
 
 
320 aa  55.8  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0499982  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein/3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  28.97 
 
 
330 aa  55.8  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.37 
 
 
307 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.03 
 
 
307 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.42 
 
 
320 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.2 
 
 
308 aa  55.5  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26091  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  32.58 
 
 
313 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.91787 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.65 
 
 
317 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.74 
 
 
318 aa  54.7  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954538 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 
333 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1844  UDP-glucose 4-epimerase  27.1 
 
 
309 aa  55.5  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3060  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.63 
 
 
331 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0392933  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2220  Male sterility-like protein  31.55 
 
 
306 aa  55.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589015  normal  0.345847 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5610  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.18 
 
 
330 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.38 
 
 
341 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298599  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 
324 aa  55.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43376  predicted protein  27.04 
 
 
326 aa  54.3  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412352  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0764  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 
332 aa  54.3  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0221  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.94 
 
 
319 aa  54.3  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.45 
 
 
316 aa  54.7  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301245  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4054  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.84 
 
 
320 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856106  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.08 
 
 
303 aa  54.3  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44260  NAD dependent epimerase/dehydratase  29.95 
 
 
303 aa  53.9  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3556  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.23 
 
 
321 aa  53.9  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 
315 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.4 
 
 
321 aa  53.5  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.96 
 
 
309 aa  53.1  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.28 
 
 
321 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0390  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.13 
 
 
320 aa  52.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0189  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  27.9 
 
 
316 aa  52.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.496773  decreased coverage  0.00806939 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.28 
 
 
321 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4020  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.71 
 
 
318 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.81 
 
 
306 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.28 
 
 
321 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.28 
 
 
321 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.83 
 
 
319 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.62 
 
 
348 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.120111  normal  0.224068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>