147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0145 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0140  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
369 aa  761    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
369 aa  761    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3032  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.25 
 
 
369 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1622  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.97 
 
 
374 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5443  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.83 
 
 
369 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1693  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.77 
 
 
396 aa  431  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.37 
 
 
369 aa  422  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0559  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.4 
 
 
372 aa  374  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0160035  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.29 
 
 
367 aa  328  6e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.78 
 
 
383 aa  326  4.0000000000000003e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1981  WbjC  41.19 
 
 
373 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3802  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.86 
 
 
375 aa  305  7e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.05 
 
 
372 aa  305  7e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.31 
 
 
372 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0951736  normal  0.0534111 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18630  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.73 
 
 
381 aa  233  5e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.66 
 
 
372 aa  231  1e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.15 
 
 
364 aa  202  7e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1677  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.31 
 
 
315 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4525  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.52 
 
 
338 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0892  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.42 
 
 
324 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.28 
 
 
367 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3129  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.69 
 
 
321 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1809  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.98 
 
 
302 aa  56.2  0.0000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.53 
 
 
281 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
315 aa  55.8  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.76 
 
 
308 aa  55.5  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.69 
 
 
321 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.69 
 
 
321 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.69 
 
 
321 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.69 
 
 
321 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.69 
 
 
321 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.61 
 
 
305 aa  54.3  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.54 
 
 
350 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.32246 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.77 
 
 
331 aa  53.9  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  23.29 
 
 
321 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0304  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.31 
 
 
317 aa  53.5  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23780  UDP-glucose 4-epimerase  25.87 
 
 
308 aa  53.1  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00097023  normal  0.178512 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.14 
 
 
313 aa  53.1  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101003  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.15 
 
 
320 aa  53.1  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 
336 aa  53.1  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111318  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.83 
 
 
303 aa  52  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.46 
 
 
318 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.82 
 
 
331 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0648845  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.74 
 
 
321 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1844  UDP-glucose 4-epimerase  26.32 
 
 
309 aa  51.2  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2249  hypothetical protein  25.39 
 
 
307 aa  51.2  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.939616  hitchhiker  0.00832772 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.48 
 
 
306 aa  50.8  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.91 
 
 
309 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0023317 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.11 
 
 
331 aa  50.8  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.633416 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.37 
 
 
331 aa  50.4  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  28.18 
 
 
318 aa  50.1  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3975  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.56 
 
 
324 aa  50.1  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0827  hypothetical protein  23.05 
 
 
318 aa  49.7  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  22.52 
 
 
324 aa  49.3  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein/3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  25.11 
 
 
330 aa  49.3  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.46 
 
 
321 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.46 
 
 
321 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0328  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.29 
 
 
278 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.55 
 
 
322 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.638871  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.05 
 
 
322 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.96 
 
 
310 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.38 
 
 
348 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0212169 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2215  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  26.72 
 
 
181 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0025  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.41 
 
 
338 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.730827  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.43 
 
 
307 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1873  putative UDP-glucose 4-epimerase  26.15 
 
 
306 aa  47.8  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 
333 aa  48.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
308 aa  47.8  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.56373  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.66 
 
 
309 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.56 
 
 
329 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33900  UDP-glucose 4-epimerase  23.74 
 
 
313 aa  47  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14581  hypothetical protein  24.89 
 
 
278 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.03 
 
 
311 aa  47  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.87 
 
 
309 aa  47  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5661  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 
329 aa  47  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6506  UDP-glucose 4-epimerase  24.79 
 
 
326 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.96 
 
 
310 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  25.76 
 
 
332 aa  47  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0055  hypothetical protein  31.25 
 
 
298 aa  46.6  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.62 
 
 
316 aa  47  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.96 
 
 
310 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.87 
 
 
309 aa  47  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.46 
 
 
337 aa  46.6  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2769  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.81 
 
 
318 aa  46.6  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.7 
 
 
308 aa  46.6  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1815  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.08 
 
 
311 aa  46.2  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.437537  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.18 
 
 
304 aa  46.2  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0539  hypothetical protein  25.46 
 
 
328 aa  46.2  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.66 
 
 
321 aa  46.6  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.966324  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0542  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.05 
 
 
337 aa  45.4  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2558  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.68 
 
 
335 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.36 
 
 
313 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000855956  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0165  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase related  24.59 
 
 
151 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2863  hypothetical protein  27.93 
 
 
134 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.949512  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0323  UDP-glucose 4-epimerase  21.38 
 
 
315 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.428855  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.78 
 
 
320 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0473  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.05 
 
 
337 aa  45.4  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1471  nucleotide sugar epimerase  24.18 
 
 
323 aa  45.4  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0796  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.15 
 
 
344 aa  45.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0308  UDP-glucose 4-epimerase  22.78 
 
 
314 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>