17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2863 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2863  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  270  5.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.949512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0559  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.17 
 
 		 372 aa  54.3  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0160035  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1693  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 		 396 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3032  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.14 
 
 		 369 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1622  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.73 
 
 		 374 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.14 
 
 		 369 aa  47.4  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5443  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.09 
 
 		 369 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0140  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.93 
 
 		 369 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.93 
 
 		 369 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2403  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5 epimerase  27.5 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.930193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.36 
 
 		 372 aa  45.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0951736  normal  0.0534111 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1754  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase and related enzymes-like protein  28.95 
 
 		 162 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.45 
 
 		 364 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2463  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase and related enzymes-like protein  28.95 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0126691  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2861  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase and related enzymes-like protein  30.28 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000254374  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18630  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.21 
 
 		 381 aa  40.8  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0185  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  24.17 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>