More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A5443 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A5443  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
369 aa  767    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.87 
 
 
369 aa  502  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3032  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.79 
 
 
369 aa  500  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1693  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.22 
 
 
396 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1622  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.52 
 
 
374 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.83 
 
 
369 aa  439  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0140  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.83 
 
 
369 aa  439  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0559  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.47 
 
 
372 aa  374  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0160035  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.8 
 
 
372 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1981  WbjC  45.26 
 
 
373 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.2 
 
 
383 aa  342  9e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.93 
 
 
367 aa  341  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3802  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.67 
 
 
375 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.19 
 
 
372 aa  247  3e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.77 
 
 
372 aa  234  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0951736  normal  0.0534111 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18630  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.09 
 
 
381 aa  195  9e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.06 
 
 
364 aa  192  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 
331 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1677  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
315 aa  66.2  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4588  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.5 
 
 
311 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.39 
 
 
331 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.633416 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3556  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27 
 
 
321 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.85 
 
 
281 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 
324 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2558  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.18 
 
 
335 aa  63.9  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.07 
 
 
310 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3614  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.78 
 
 
329 aa  62.8  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.34994  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3924  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.78 
 
 
329 aa  62.8  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.0226045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.07 
 
 
310 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0893  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.27 
 
 
308 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0919  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.27 
 
 
308 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0917118  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.29 
 
 
336 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111318  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 
303 aa  62  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.44 
 
 
342 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.07 
 
 
310 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1182  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.18 
 
 
322 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0422  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  26.04 
 
 
321 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.56 
 
 
317 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.04 
 
 
321 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0418  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  26.04 
 
 
321 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0507  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.04 
 
 
321 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4330  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
340 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000000594661  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0488  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.04 
 
 
321 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6713  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
314 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0954433  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.52 
 
 
330 aa  60.1  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46913  normal  0.0352982 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.77 
 
 
340 aa  59.7  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152029  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0563  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.66 
 
 
321 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.11 
 
 
306 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_002978  WD0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.38 
 
 
319 aa  59.3  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00880027  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1706  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.67 
 
 
309 aa  59.3  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.92 
 
 
304 aa  59.3  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0624037  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.43 
 
 
329 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1566  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.89 
 
 
319 aa  59.3  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13324  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0764  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.83 
 
 
332 aa  59.3  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.24 
 
 
318 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.21 
 
 
309 aa  58.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.14 
 
 
337 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162103  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0542  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.02 
 
 
337 aa  58.5  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0024  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.03 
 
 
326 aa  58.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235622  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.05 
 
 
331 aa  58.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.39 
 
 
321 aa  58.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000491095  unclonable  4.61706e-23 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1809  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.97 
 
 
302 aa  58.2  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0473  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.02 
 
 
337 aa  58.5  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13818  dTDP-glucose-4,6-dehydratase  23.95 
 
 
326 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.43 
 
 
327 aa  57.8  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02560  UDP-glucuronic acid decarboxylase Uxs1p  25.45 
 
 
410 aa  57.8  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4813  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.04 
 
 
321 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0228  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.19 
 
 
310 aa  57.4  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.194906  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.04 
 
 
321 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.12 
 
 
313 aa  57.4  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000855956  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.81 
 
 
328 aa  57.4  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.869195 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23 
 
 
337 aa  57  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.586684 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.3 
 
 
309 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0568  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
315 aa  57  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.973707  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.09 
 
 
308 aa  57  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.65 
 
 
321 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3788  putative transmembrane oxidoreductase protein  27.43 
 
 
312 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.754913  normal  0.999241 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5517  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.88 
 
 
315 aa  57  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.36 
 
 
308 aa  56.6  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0561  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.62 
 
 
321 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.69 
 
 
335 aa  56.6  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.32 
 
 
337 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.550526 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0221  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25 
 
 
319 aa  56.6  0.0000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0129  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.56 
 
 
322 aa  56.6  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26091  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  25.99 
 
 
313 aa  56.2  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.91787 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.95 
 
 
348 aa  56.2  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0212169 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.9 
 
 
314 aa  56.2  0.0000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.167111  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1505  dTDP-glucose 4-6-dehydratase  25.93 
 
 
331 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4509  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.42 
 
 
325 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.38 
 
 
318 aa  56.2  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954538 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.65 
 
 
349 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.43701  normal  0.257537 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.93 
 
 
310 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.14 
 
 
311 aa  55.8  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0900  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.89 
 
 
326 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.425817  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2802  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.5 
 
 
317 aa  55.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.65 
 
 
349 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0782  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.91 
 
 
316 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.182086  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3646  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.47 
 
 
284 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.701865  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.72 
 
 
343 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0230856  normal  0.593918 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 
323 aa  55.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.362508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>