More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3646 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3646  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
284 aa  541  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.701865  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.87 
 
 
316 aa  125  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0445125  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3528  CDP-abequose synthase  23.75 
 
 
319 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1703  CDP-abequose synthase  23.92 
 
 
319 aa  112  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000035805 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.84 
 
 
309 aa  106  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5104  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.03 
 
 
664 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.18 
 
 
309 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.1 
 
 
306 aa  99.8  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.77 
 
 
317 aa  99  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.15 
 
 
308 aa  96.3  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3399  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.86 
 
 
287 aa  95.5  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12941  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  22.64 
 
 
307 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0139899  normal  0.0320984 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1895  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 
311 aa  93.6  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.9 
 
 
303 aa  93.6  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.54 
 
 
328 aa  93.2  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4920  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.79 
 
 
331 aa  92  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46785  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.64 
 
 
312 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.12 
 
 
281 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  27.39 
 
 
302 aa  90.5  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.43 
 
 
326 aa  89.7  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.25 
 
 
318 aa  88.2  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 
309 aa  87.8  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4693  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.2 
 
 
317 aa  87  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.85 
 
 
313 aa  87  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0739  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.45 
 
 
326 aa  86.7  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.109872  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 
309 aa  86.7  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1178  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.43 
 
 
317 aa  85.9  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0253268  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.87 
 
 
298 aa  85.9  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.260305  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33900  UDP-glucose 4-epimerase  30.77 
 
 
313 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  28.1 
 
 
330 aa  85.5  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  28.1 
 
 
330 aa  85.5  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
309 aa  84  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1901  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.7 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.747333  normal  0.141884 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0568  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.28 
 
 
315 aa  84  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.973707  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.94 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1700  GDP-fucose synthetase NAD dependent epimerase/dehydratase  28.99 
 
 
314 aa  82.8  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231068  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 
323 aa  82.8  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5600  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.08 
 
 
340 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23780  UDP-glucose 4-epimerase  30.84 
 
 
308 aa  82  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00097023  normal  0.178512 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05730  UDP-galactose 4-epimerase  30.1 
 
 
333 aa  81.6  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.805791  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2010  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.55 
 
 
310 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2900  GDP-fucose synthetase NAD dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 
311 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.9 
 
 
322 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2730  GDP-L-fucose synthetase  30.63 
 
 
326 aa  81.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.78 
 
 
312 aa  81.3  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.109872  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.22 
 
 
317 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5023  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4859  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.56 
 
 
336 aa  80.5  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.417628  normal  0.311096 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1234  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.21 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.32 
 
 
345 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.06 
 
 
314 aa  80.1  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.660712  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6347  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.42 
 
 
330 aa  80.1  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.43 
 
 
334 aa  80.1  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  27.73 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1147  GDP-L-fucose synthetase  29.71 
 
 
322 aa  79.7  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.52 
 
 
317 aa  79.7  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.89 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1925  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.9 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0260  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.01 
 
 
327 aa  79.7  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.27 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.43 
 
 
327 aa  79.3  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1236  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.95 
 
 
344 aa  79  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.443821  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  25.24 
 
 
327 aa  78.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1954  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5711  GDP-4-dehydro-6-deoxy-D-mannose epimerase /GDP-4-dehydro-6-L-deoxygalactose reductase  30.82 
 
 
316 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.53 
 
 
308 aa  78.6  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0956  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.12 
 
 
344 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.92 
 
 
308 aa  78.6  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1850  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.33 
 
 
325 aa  78.6  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0128954  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1513  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  22.95 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8322  UDP-glucose 4-epimerase  31.94 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.05 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0794985  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1091  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 
309 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.76 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
367 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.3 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.1 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.1 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.32 
 
 
335 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
316 aa  77.4  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.32 
 
 
324 aa  77  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.721722  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1728  UDP-glucose 4-epimerase  23.95 
 
 
338 aa  77.4  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.87625  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33990  UDP-galactose 4-epimerase  29.69 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.107891  normal  0.629756 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.48 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 
310 aa  77  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  27.62 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.05 
 
 
311 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 
328 aa  76.3  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.53 
 
 
330 aa  75.9  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409004  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
338 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6713  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.77 
 
 
314 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0954433  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 
324 aa  75.9  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0249986  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.5 
 
 
331 aa  75.5  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0648845  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0394  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  22.62 
 
 
323 aa  75.5  0.0000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.286083  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0035  GDP-fucose synthetase  25.74 
 
 
312 aa  75.1  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0178713 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0745  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.18 
 
 
308 aa  75.5  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.409564  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0689  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.22 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.91 
 
 
322 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.67 
 
 
318 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>