More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2816 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
322 aa  639    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.06 
 
 
334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.225556  normal  0.379661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.12 
 
 
323 aa  143  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.473487  normal  0.360955 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4083  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 
336 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.83 
 
 
330 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46913  normal  0.0352982 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 
313 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794715  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.29 
 
 
312 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14221  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.75 
 
 
311 aa  133  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.84912  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3722  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 
335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 
334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.73 
 
 
313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101003  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0707  nucleotide sugar epimerase  30.03 
 
 
323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.15214  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3245  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.1 
 
 
331 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.221391 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0464  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.7 
 
 
325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.95 
 
 
299 aa  130  3e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
318 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.31 
 
 
330 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000230956 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.82 
 
 
327 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4859  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.18 
 
 
336 aa  129  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.417628  normal  0.311096 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.74 
 
 
330 aa  129  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.746716  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6506  UDP-glucose 4-epimerase  34.07 
 
 
326 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.87 
 
 
321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  34.25 
 
 
298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1149  dTDP-glucose 46-dehydratase  32.12 
 
 
325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.985297 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.55 
 
 
322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11280  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.8 
 
 
329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883785  normal  0.146231 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1924  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.65 
 
 
312 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0395145  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2009  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.65 
 
 
312 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1970  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.89 
 
 
326 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.11 
 
 
318 aa  127  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.63 
 
 
328 aa  126  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.73 
 
 
316 aa  126  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.88 
 
 
309 aa  125  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1178  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.63 
 
 
317 aa  125  8.000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0253268  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41531  nad-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 
514 aa  125  8.000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.01 
 
 
312 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0684106  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.55 
 
 
328 aa  125  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.94 
 
 
332 aa  124  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.81 
 
 
346 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.794763  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13818  dTDP-glucose-4,6-dehydratase  30.94 
 
 
326 aa  124  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.53 
 
 
308 aa  124  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.04 
 
 
314 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43376  predicted protein  30.03 
 
 
326 aa  123  4e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412352  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.45 
 
 
329 aa  123  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.463092  decreased coverage  0.00350753 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.18 
 
 
346 aa  122  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218972  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1858  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.21 
 
 
318 aa  122  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.31 
 
 
328 aa  122  8e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 
334 aa  122  8e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232422 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.19 
 
 
323 aa  122  9e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.82 
 
 
327 aa  122  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2636  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.95 
 
 
329 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.37 
 
 
310 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1294  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.31 
 
 
360 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26434  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.72 
 
 
335 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.61 
 
 
353 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.21 
 
 
367 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 
337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3108  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.64 
 
 
328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0900  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.45 
 
 
326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.425817  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3393  dTDP-glucose 4,6-dehydratase, NAD-dependent epimerase/dehydratase-related protein  29.45 
 
 
326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.229105  normal  0.0838562 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.51 
 
 
319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  29.97 
 
 
307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02955  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.22 
 
 
339 aa  120  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  31.48 
 
 
336 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.89 
 
 
315 aa  120  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.42 
 
 
319 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4509  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
325 aa  120  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.94 
 
 
311 aa  120  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 
324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.43 
 
 
316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1505  dTDP-glucose 4-6-dehydratase  31.21 
 
 
331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14111  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.22 
 
 
335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0611432  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.26 
 
 
326 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.476272  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0370  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.26 
 
 
326 aa  119  6e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.84 
 
 
318 aa  119  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.66 
 
 
310 aa  119  7e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.08 
 
 
330 aa  119  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02926  nucleotide sugar epimerase  32.92 
 
 
321 aa  119  9e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0408  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.62 
 
 
326 aa  119  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.253997 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.21 
 
 
335 aa  118  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5517  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 
315 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3228  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.57 
 
 
316 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.92 
 
 
347 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1975  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.15 
 
 
336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1513  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.36 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0919  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.33 
 
 
308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0917118  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0514  dTDP-glucose 4,6-dehydratase protein  33.75 
 
 
337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.45 
 
 
308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.89 
 
 
322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.02 
 
 
313 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.186347 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.6 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.109872  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.34 
 
 
310 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0394  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.44 
 
 
323 aa  117  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.286083  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.63 
 
 
335 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.984482  normal  0.365956 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.97 
 
 
316 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.556452  hitchhiker  0.000650625 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2234  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.45 
 
 
313 aa  117  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.9 
 
 
306 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33900  UDP-glucose 4-epimerase  33 
 
 
313 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0893  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.33 
 
 
308 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33309  predicted protein  30.48 
 
 
340 aa  117  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>