More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1236 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1236  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  100 
 
 		 344 aa  706    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.443821  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2035  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.65 
 
 		 378 aa  391  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08571  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  53.94 
 
 		 358 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000591053 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0634  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.49 
 
 		 375 aa  385  1e-106  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.75247  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01181  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  52.66 
 
 		 364 aa  374  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.683798 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2100  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.53 
 
 		 357 aa  357  1.9999999999999998e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2106  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.02 
 
 		 350 aa  347  2e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0474818  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1081  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.55 
 
 		 357 aa  346  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4019  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.64 
 
 		 352 aa  341  1e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5507  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.81 
 
 		 349 aa  340  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3306  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.42 
 
 		 356 aa  340  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.310142  normal  0.339449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4335  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.5 
 
 		 349 aa  340  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.796314  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01521  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  49.55 
 
 		 357 aa  340  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3167  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.2 
 
 		 343 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4058  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.76 
 
 		 358 aa  338  9e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1397  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.46 
 
 		 358 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3017  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.97 
 
 		 340 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0758664 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5836  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.9 
 
 		 350 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1986  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.26 
 
 		 352 aa  336  3.9999999999999995e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2711  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.53 
 
 		 356 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0050  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.5 
 
 		 351 aa  335  5e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3054  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.95 
 
 		 350 aa  335  5e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1272  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.4 
 
 		 351 aa  335  7e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.447034 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0624  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.67 
 
 		 365 aa  335  7e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0728968 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0614  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.97 
 
 		 356 aa  334  1e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0278686  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3935  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.87 
 
 		 358 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.259992 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1491  dTDP-D-glucose-46-dehydratase  44.95 
 
 		 352 aa  334  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4289  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.2 
 
 		 353 aa  334  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.337575 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1183  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.4 
 
 		 351 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.769877  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2593  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.96 
 
 		 362 aa  333  3e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1571  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.97 
 
 		 353 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.285914 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3843  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.72 
 
 		 346 aa  333  4e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0209  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.83 
 
 		 350 aa  332  4e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2121  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.72 
 
 		 345 aa  333  4e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2352  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.2 
 
 		 352 aa  332  5e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.567424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4115  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.72 
 
 		 346 aa  332  5e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0120  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.27 
 
 		 353 aa  332  5e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2456  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.59 
 
 		 353 aa  332  6e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3285  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.01 
 
 		 353 aa  332  6e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3691  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.5 
 
 		 352 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.139305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2393  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.5 
 
 		 352 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal  0.462988 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4003  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.5 
 
 		 352 aa  332  8e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2670  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.5 
 
 		 352 aa  332  8e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.27766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001808  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.56 
 
 		 355 aa  331  9e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0243  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  46.29 
 
 		 363 aa  331  1e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4253  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.59 
 
 		 352 aa  331  1e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0180  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  46.29 
 
 		 363 aa  331  1e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812162  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3465  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.18 
 
 		 360 aa  331  1e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.848345  normal  0.362131 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3502  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.06 
 
 		 363 aa  330  2e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602458 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3554  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.63 
 
 		 355 aa  330  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.110317  normal  0.824259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0701  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.01 
 
 		 360 aa  330  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.004629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2663  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  45.06 
 
 		 362 aa  330  2e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2900  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  46.47 
 
 		 358 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1489  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.35 
 
 		 355 aa  328  6e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1618  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.89 
 
 		 359 aa  328  7e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0773  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.83 
 
 		 358 aa  328  8e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.781884  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1405  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  43.54 
 
 		 354 aa  327  1.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2379  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.98 
 
 		 349 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.577133  hitchhiker  0.00102073 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1472  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  45.86 
 
 		 356 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.239272  normal  0.402949 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2992  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.11 
 
 		 356 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.147327  normal  0.427533 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1071  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.98 
 
 		 348 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1214  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.45 
 
 		 351 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0108326  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2317  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.97 
 
 		 367 aa  325  6e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150256 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3704  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.02 
 
 		 356 aa  325  6e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.524405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1562  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.76 
 
 		 353 aa  325  7e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0712  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.92 
 
 		 354 aa  325  8.000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03666  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.56 
 
 		 355 aa  324  1e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4188  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.7 
 
 		 355 aa  325  1e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03615  hypothetical protein  45.56 
 
 		 355 aa  324  1e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1379  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  45.16 
 
 		 359 aa  324  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000705991 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4152  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.7 
 
 		 355 aa  324  1e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1401  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  44.94 
 
 		 365 aa  324  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0069994 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00991  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  43.66 
 
 		 360 aa  323  2e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1318  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  44.61 
 
 		 359 aa  323  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0342732 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2990  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.83 
 
 		 352 aa  324  2e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2653  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.43 
 
 		 360 aa  323  2e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3018  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  43.77 
 
 		 371 aa  323  3e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2139  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.55 
 
 		 356 aa  323  3e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2540  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  43.99 
 
 		 359 aa  323  3e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5221  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.4 
 
 		 355 aa  323  4e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175839  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1282  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.94 
 
 		 357 aa  322  5e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.306583  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4006  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.99 
 
 		 355 aa  322  5e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4005  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.27 
 
 		 355 aa  322  6e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4215  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.27 
 
 		 355 aa  322  6e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0107  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.62 
 
 		 367 aa  322  6e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1192  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  45.13 
 
 		 361 aa  322  6e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.428891  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2890  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  44.38 
 
 		 356 aa  322  6e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3188  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  42.58 
 
 		 375 aa  322  7e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1212  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.73 
 
 		 360 aa  322  7e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.809645  decreased coverage  0.00336065 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2131  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.97 
 
 		 358 aa  322  7e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1601  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  44.54 
 
 		 361 aa  322  7e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0761  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.11 
 
 		 353 aa  322  8e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01947  dTDP-glucose 4,6 dehydratase, NAD(P)-binding  44.54 
 
 		 361 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2719  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.11 
 
 		 358 aa  321  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.719616  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2319  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.39 
 
 		 353 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.251448 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1683  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.83 
 
 		 363 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.429769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0516  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  44.81 
 
 		 355 aa  321  9.999999999999999e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4299  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.4 
 
 		 355 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3030  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  43.99 
 
 		 359 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.179842 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01936  hypothetical protein  44.54 
 
 		 361 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>