More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_08571 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_08571  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  100 
 
 		 358 aa  737    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000591053 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2035  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.71 
 
 		 378 aa  483  1e-135  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0634  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.38 
 
 		 375 aa  474  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.75247  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01521  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  57.02 
 
 		 357 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2100  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.69 
 
 		 357 aa  403  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01181  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  54.36 
 
 		 364 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.683798 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2653  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.6 
 
 		 360 aa  397  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1489  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.45 
 
 		 355 aa  394  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3017  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.41 
 
 		 340 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0758664 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0050  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.85 
 
 		 351 aa  389  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2456  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.55 
 
 		 353 aa  390  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0120  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.96 
 
 		 353 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1236  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.94 
 
 		 344 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.443821  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4289  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.59 
 
 		 353 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.337575 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4115  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.85 
 
 		 346 aa  387  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001808  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.15 
 
 		 355 aa  385  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3306  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.55 
 
 		 356 aa  387  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.310142  normal  0.339449 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2106  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.52 
 
 		 350 aa  384  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0474818  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2121  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.28 
 
 		 345 aa  386  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1562  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.79 
 
 		 353 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1571  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.2 
 
 		 353 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.285914 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0624  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.23 
 
 		 365 aa  383  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0728968 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0180  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  52.89 
 
 		 363 aa  383  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812162  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1472  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  52.42 
 
 		 356 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.239272  normal  0.402949 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0243  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  52.89 
 
 		 363 aa  383  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3465  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.03 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.848345  normal  0.362131 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01947  dTDP-glucose 4,6 dehydratase, NAD(P)-binding  51.3 
 
 		 361 aa  378  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03666  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.15 
 
 		 355 aa  378  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4188  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.15 
 
 		 355 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3167  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.35 
 
 		 343 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03615  hypothetical protein  51.15 
 
 		 355 aa  378  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4058  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.82 
 
 		 358 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01936  hypothetical protein  51.3 
 
 		 361 aa  378  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1491  dTDP-D-glucose-46-dehydratase  50.44 
 
 		 352 aa  378  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2711  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.03 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1401  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  52.14 
 
 		 365 aa  380  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0069994 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1081  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.12 
 
 		 357 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1601  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  51.01 
 
 		 361 aa  375  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1397  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.52 
 
 		 358 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4152  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.86 
 
 		 355 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1212  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.63 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.809645  decreased coverage  0.00336065 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1986  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.44 
 
 		 352 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3554  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.78 
 
 		 355 aa  376  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.110317  normal  0.824259 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1183  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.07 
 
 		 351 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.769877  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1398  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  50.43 
 
 		 365 aa  375  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3502  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.35 
 
 		 363 aa  377  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602458 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3843  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.24 
 
 		 346 aa  375  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4299  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.57 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3054  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.1 
 
 		 350 aa  375  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3285  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.74 
 
 		 353 aa  378  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2182  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.59 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0103955  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1318  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  51.43 
 
 		 359 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0342732 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1399  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.65 
 
 		 339 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0294946 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5221  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.86 
 
 		 355 aa  378  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1379  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  50.86 
 
 		 359 aa  375  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000705991 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03169  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.88 
 
 		 351 aa  373  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2437  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  51.31 
 
 		 361 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000861453 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4029  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.15 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2279  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  51.31 
 
 		 361 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000978054 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5396  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.59 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2890  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  50.14 
 
 		 356 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0516  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  51.15 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4019  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.38 
 
 		 352 aa  373  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4215  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.57 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2323  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  51.31 
 
 		 361 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00762462 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2330  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  51.31 
 
 		 361 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.129575 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0837  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.43 
 
 		 361 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.378615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00991  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  50.85 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5507  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.08 
 
 		 349 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2222  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  51.6 
 
 		 361 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0048625  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2663  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  49.86 
 
 		 362 aa  372  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0107  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.6 
 
 		 367 aa  372  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3018  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  49.58 
 
 		 371 aa  372  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0186  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.15 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1272  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.07 
 
 		 351 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.447034 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4005  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.57 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4198  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.76 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2332  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  51.31 
 
 		 361 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000326666  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4935  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.3 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3582  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.15 
 
 		 342 aa  371  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4006  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.18 
 
 		 355 aa  368  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3935  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.04 
 
 		 358 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.259992 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3030  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  50 
 
 		 359 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.179842 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2131  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.02 
 
 		 358 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1192  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  51.6 
 
 		 361 aa  370  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.428891  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4335  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.08 
 
 		 349 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.796314  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3861  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.33 
 
 		 350 aa  369  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.646368 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1683  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.86 
 
 		 363 aa  371  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.429769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1071  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.7 
 
 		 348 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2830  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.72 
 
 		 367 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00106167  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2900  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  51.29 
 
 		 358 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2540  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  49.71 
 
 		 359 aa  370  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2990  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.01 
 
 		 352 aa  368  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2719  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.17 
 
 		 358 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.719616  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3188  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  47.95 
 
 		 375 aa  365  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4133  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.18 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0544  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.39 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4251  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.18 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1405  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.2 
 
 		 354 aa  365  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2242  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.63 
 
 		 377 aa  366  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>