More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_01181 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_01181  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  100 
 
 		 364 aa  758    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.683798 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2035  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.62 
 
 		 378 aa  456  1e-127  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0634  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.64 
 
 		 375 aa  447  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.75247  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01521  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  54.96 
 
 		 357 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08571  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  54.36 
 
 		 358 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000591053 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2100  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.37 
 
 		 357 aa  390  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1491  dTDP-D-glucose-46-dehydratase  51.13 
 
 		 352 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1986  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.85 
 
 		 352 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2711  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.98 
 
 		 356 aa  375  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3554  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.69 
 
 		 355 aa  376  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.110317  normal  0.824259 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3054  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.83 
 
 		 350 aa  375  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4289  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.94 
 
 		 353 aa  375  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.337575 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1236  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.66 
 
 		 344 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.443821  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1571  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.82 
 
 		 353 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.285914 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4115  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.27 
 
 		 346 aa  370  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3502  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.86 
 
 		 363 aa  368  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602458 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1562  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.26 
 
 		 353 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0120  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.98 
 
 		 353 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1405  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.6 
 
 		 354 aa  370  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4029  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.42 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4019  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.84 
 
 		 352 aa  365  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0516  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  50.42 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0186  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.42 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2719  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.41 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.719616  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3306  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.58 
 
 		 356 aa  366  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.310142  normal  0.339449 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4188  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.72 
 
 		 355 aa  363  3e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5836  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.58 
 
 		 350 aa  363  3e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1401  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  48.76 
 
 		 365 aa  363  3e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0069994 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1272  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.87 
 
 		 351 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.447034 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5221  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.72 
 
 		 355 aa  362  4e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1397  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50 
 
 		 358 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4152  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.72 
 
 		 355 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03666  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.72 
 
 		 355 aa  362  6e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03615  hypothetical protein  49.72 
 
 		 355 aa  362  6e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0050  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.31 
 
 		 351 aa  362  6e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4148  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.72 
 
 		 355 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4133  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.72 
 
 		 355 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4310  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.72 
 
 		 355 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.847685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4251  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.72 
 
 		 355 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1183  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.87 
 
 		 351 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.769877  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2106  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.71 
 
 		 350 aa  360  2e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0474818  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4299  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.44 
 
 		 355 aa  359  3e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1318  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  48.22 
 
 		 359 aa  360  3e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0342732 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2890  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  48.07 
 
 		 356 aa  359  4e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00991  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  48.48 
 
 		 360 aa  359  5e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4202  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.44 
 
 		 355 aa  358  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5396  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.97 
 
 		 360 aa  358  6e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4215  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.44 
 
 		 355 aa  358  6e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4005  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.44 
 
 		 355 aa  358  6e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1379  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  47.96 
 
 		 359 aa  358  6e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000705991 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4935  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.7 
 
 		 360 aa  358  7e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1489  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50 
 
 		 355 aa  358  9.999999999999999e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0209  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.13 
 
 		 350 aa  358  9.999999999999999e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4006  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.44 
 
 		 355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3017  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.55 
 
 		 340 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0758664 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1472  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  48.9 
 
 		 356 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.239272  normal  0.402949 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4058  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.29 
 
 		 358 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1398  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  47.93 
 
 		 365 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1081  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.86 
 
 		 357 aa  354  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2540  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  47.54 
 
 		 359 aa  354  1e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0773  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.42 
 
 		 358 aa  353  2e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.781884  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4198  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.61 
 
 		 355 aa  353  2e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2121  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50 
 
 		 345 aa  354  2e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147251  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3167  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.13 
 
 		 343 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0180  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  49.44 
 
 		 363 aa  353  4e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812162  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001808  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.19 
 
 		 355 aa  353  4e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0243  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  49.44 
 
 		 363 aa  353  4e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0107  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.57 
 
 		 367 aa  352  5e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2900  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  48.77 
 
 		 358 aa  352  7e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5507  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.01 
 
 		 349 aa  351  8.999999999999999e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2762  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.14 
 
 		 352 aa  352  8.999999999999999e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3030  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  47.12 
 
 		 359 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.179842 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3582  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.55 
 
 		 342 aa  351  1e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3843  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.44 
 
 		 346 aa  351  1e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3935  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49 
 
 		 358 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.259992 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2456  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.59 
 
 		 353 aa  351  1e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1212  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.72 
 
 		 360 aa  350  2e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.809645  decreased coverage  0.00336065 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3018  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  46.61 
 
 		 371 aa  350  2e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2131  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.41 
 
 		 358 aa  350  2e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2352  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.73 
 
 		 352 aa  350  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.567424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2393  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.16 
 
 		 352 aa  350  3e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal  0.462988 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3691  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.16 
 
 		 352 aa  350  3e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.139305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2670  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.16 
 
 		 352 aa  350  3e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.27766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4003  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.16 
 
 		 352 aa  350  3e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4253  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.73 
 
 		 352 aa  349  5e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2379  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.88 
 
 		 349 aa  349  5e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.577133  hitchhiker  0.00102073 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1618  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.29 
 
 		 359 aa  349  5e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1071  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.74 
 
 		 348 aa  349  5e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4335  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.01 
 
 		 349 aa  348  6e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.796314  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03169  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.44 
 
 		 351 aa  348  6e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1058  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.88 
 
 		 355 aa  348  7e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.807242  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2182  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.3 
 
 		 354 aa  348  1e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0103955  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0837  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.76 
 
 		 361 aa  347  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.378615  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1282  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.59 
 
 		 357 aa  347  2e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.306583  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1683  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.57 
 
 		 363 aa  347  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.429769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2830  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.75 
 
 		 367 aa  347  2e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00106167  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3465  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.32 
 
 		 360 aa  347  2e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.848345  normal  0.362131 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0503  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.72 
 
 		 351 aa  346  3e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0802438  normal  0.0327306 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3188  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  45.38 
 
 		 375 aa  346  5e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2653  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.71 
 
 		 360 aa  344  1e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>