More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1895 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1895  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
311 aa  642    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1703  CDP-abequose synthase  29.13 
 
 
319 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000035805 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3528  CDP-abequose synthase  29.22 
 
 
319 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.78 
 
 
328 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.62 
 
 
316 aa  139  7e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0445125  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.45 
 
 
313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12941  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.47 
 
 
307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0139899  normal  0.0320984 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.86 
 
 
318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1572  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.85 
 
 
330 aa  125  9e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.55 
 
 
312 aa  123  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1538  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.62 
 
 
336 aa  121  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00186226  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
339 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.97 
 
 
333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.81 
 
 
327 aa  120  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  29.07 
 
 
307 aa  120  3e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.05 
 
 
303 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 
324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.47 
 
 
323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.01 
 
 
326 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1850  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.1 
 
 
325 aa  118  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0128954  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.59 
 
 
317 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0778  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.5 
 
 
316 aa  117  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00475764  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.01 
 
 
316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.58 
 
 
318 aa  116  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.71 
 
 
343 aa  116  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.213871 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.52 
 
 
310 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3167  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.95 
 
 
343 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 
326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.476272  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.13 
 
 
321 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1896  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.34 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1954  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.85 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794715  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.75 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.23 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0648845  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.39 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2010  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.67 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1925  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.35 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0305  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.98 
 
 
342 aa  114  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.13 
 
 
321 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
334 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.34 
 
 
313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4211  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.12 
 
 
331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.55 
 
 
316 aa  113  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.577574  normal  0.786667 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4693  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.15 
 
 
317 aa  113  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.56 
 
 
306 aa  112  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0228  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.42 
 
 
310 aa  112  9e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.194906  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
320 aa  112  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000773597 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3398  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.3 
 
 
307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1269  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.8 
 
 
323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.281724  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0496  UDP-glucuronate 5'-epimerase  26.17 
 
 
325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0876322  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.37 
 
 
313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101003  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.68 
 
 
306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.81 
 
 
328 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.74 
 
 
377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.47 
 
 
322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.75 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.75 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.94 
 
 
309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.71 
 
 
317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3402  NAD dependent epimerase/dehydratase family superfamily  27.24 
 
 
307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1390  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.84 
 
 
322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000137645  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3228  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.79 
 
 
316 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3376  NAD dependent epimerase/dehydratase family superfamily  26.54 
 
 
307 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3869  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.06 
 
 
335 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.629775  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 
314 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.5 
 
 
310 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.38 
 
 
308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26862  nad-dependent epimerase/dehydratase  25.76 
 
 
408 aa  110  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095088  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.16 
 
 
322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895742 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1117  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.84 
 
 
322 aa  109  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565824  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1685  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.87 
 
 
342 aa  109  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.48 
 
 
336 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0659  UDP-glucose 4-epimerase  31.05 
 
 
306 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1375  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.79 
 
 
322 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1677  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.85 
 
 
336 aa  109  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1337  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.16 
 
 
322 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120656  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0056  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.9 
 
 
318 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0568  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.19 
 
 
315 aa  109  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.973707  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 
309 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.25 
 
 
327 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3331  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.1 
 
 
302 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.86 
 
 
309 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3072  UDP-glucose 4-epimerase  26.6 
 
 
307 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0021  UDP-glucose 4-epimerase  29.55 
 
 
308 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0764  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.06 
 
 
332 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1583  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
330 aa  108  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.53 
 
 
308 aa  108  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.03 
 
 
304 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1137  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.84 
 
 
322 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
318 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445777 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1230  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.84 
 
 
322 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3095  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.64 
 
 
342 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.34 
 
 
322 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0107  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.45 
 
 
367 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  30.32 
 
 
302 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.32 
 
 
367 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.1 
 
 
302 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0679369  normal  0.411076 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.98 
 
 
303 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2077  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.71 
 
 
314 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>