More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4920 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4920  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
331 aa  691    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46785  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4619  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.89 
 
 
323 aa  159  7e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000781919 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0618  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.05 
 
 
328 aa  159  8e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.47 
 
 
323 aa  157  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.059052  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  33.94 
 
 
321 aa  156  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  33.94 
 
 
321 aa  155  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0507  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  33.94 
 
 
321 aa  155  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0488  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  33.94 
 
 
321 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0418  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  33.94 
 
 
321 aa  155  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0422  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  33.94 
 
 
321 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4813  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  33.33 
 
 
321 aa  153  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0563  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.72 
 
 
321 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0561  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  33.03 
 
 
321 aa  149  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.64 
 
 
321 aa  149  9e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.72 
 
 
321 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.15 
 
 
321 aa  146  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.3 
 
 
322 aa  145  9e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.15 
 
 
321 aa  142  9e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000491095  unclonable  4.61706e-23 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2234  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 
313 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.81 
 
 
311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.17 
 
 
336 aa  138  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.150051  normal  0.64899 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.34 
 
 
330 aa  135  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.38 
 
 
333 aa  134  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.427857  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1182  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 
322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4588  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.56 
 
 
311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1858  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.5 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 
325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.56 
 
 
321 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 
318 aa  129  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.75 
 
 
343 aa  129  6e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471078  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.79 
 
 
327 aa  129  7.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3393  dTDP-glucose 4,6-dehydratase, NAD-dependent epimerase/dehydratase-related protein  29.54 
 
 
326 aa  129  9.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.229105  normal  0.0838562 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3525  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.31 
 
 
326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0900  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.54 
 
 
326 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.425817  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.28 
 
 
341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298599  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3614  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
329 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.34994  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3924  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
329 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.0226045 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.82 
 
 
316 aa  127  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0782  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.19 
 
 
316 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.182086  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0162  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.34 
 
 
317 aa  126  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.12 
 
 
314 aa  126  5e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.167111  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3252  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.63 
 
 
314 aa  126  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0363049  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0408  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.08 
 
 
326 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.253997 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.68 
 
 
353 aa  126  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.93 
 
 
327 aa  125  8.000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 
328 aa  125  8.000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4509  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.32 
 
 
325 aa  125  8.000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.46 
 
 
313 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 
309 aa  125  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.21 
 
 
311 aa  125  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.747671  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2307  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.47 
 
 
311 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124145  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
325 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.620777 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4020  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.52 
 
 
318 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.83 
 
 
348 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0857049  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
313 aa  124  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3029  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.83 
 
 
348 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.965327  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1378  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.83 
 
 
348 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280113  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 
313 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000855956  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 
311 aa  124  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.97 
 
 
313 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.376158  normal  0.0242286 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2263  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.83 
 
 
348 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.171141  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4100  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.84 
 
 
325 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.83 
 
 
348 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.47827  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1288  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.83 
 
 
348 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3158  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.83 
 
 
348 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0477125  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5610  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.56 
 
 
330 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 
309 aa  124  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.54 
 
 
342 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1611  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.75 
 
 
313 aa  124  3e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.709629  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2118  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 
336 aa  123  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.292316  normal  0.0790503 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.5 
 
 
318 aa  123  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954538 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 
318 aa  122  6e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000151711  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
317 aa  122  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.307285  normal  0.160905 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.94 
 
 
309 aa  122  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
310 aa  122  6e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.453654  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.82 
 
 
333 aa  122  6e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0169  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase (UDP-glucose 4-epimerase)  29.94 
 
 
319 aa  122  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2645  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.92 
 
 
326 aa  122  7e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6047  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 
348 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438767  normal  0.0540302 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.53 
 
 
318 aa  122  9e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.34 
 
 
309 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 
348 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 
349 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 
348 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.64 
 
 
318 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 
349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.43701  normal  0.257537 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1970  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.14 
 
 
326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 
346 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218972  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.94 
 
 
328 aa  120  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.38 
 
 
324 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.91 
 
 
298 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.54 
 
 
329 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.463092  decreased coverage  0.00350753 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.556452  hitchhiker  0.000650625 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0893  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 
308 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.38 
 
 
318 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0464  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 
325 aa  119  7.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3404  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
311 aa  119  9e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132998  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 
346 aa  119  9e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.794763  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1140  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.73 
 
 
312 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>