More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2789 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
326 aa  633  1e-180  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0794985  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.87 
 
 
317 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105028  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.89 
 
 
326 aa  90.5  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33900  UDP-glucose 4-epimerase  33.44 
 
 
313 aa  88.6  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3646  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.05 
 
 
284 aa  82.8  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.701865  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12941  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  22.64 
 
 
307 aa  82.4  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0139899  normal  0.0320984 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 
303 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.5 
 
 
299 aa  79  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 
322 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1800  oxidoreductase Rmd  27.86 
 
 
298 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0661573 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3810  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.82 
 
 
345 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0478  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.57 
 
 
320 aa  75.9  0.0000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  unclonable  0.00000000000851226  decreased coverage  0.0000000042699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4023  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.86 
 
 
308 aa  73.6  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0248885  hitchhiker  0.0015787 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  28.44 
 
 
339 aa  72  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0493  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 
303 aa  72.4  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4464  UDP-glucose 4-epimerase  29.82 
 
 
324 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.9 
 
 
296 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0347  UDP-glucose 4-epimerase  27.67 
 
 
342 aa  70.9  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0730081 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.82 
 
 
314 aa  70.1  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.05 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  21.62 
 
 
328 aa  69.3  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.72 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1850  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.07 
 
 
325 aa  69.3  0.00000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0128954  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.82 
 
 
339 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.443287 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.4 
 
 
329 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  30.06 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.3 
 
 
313 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.72 
 
 
298 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.329803 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5836  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.01 
 
 
350 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.09 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0182  UDP-glucose 4-epimerase  22.62 
 
 
342 aa  66.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.55 
 
 
368 aa  66.2  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.850115  normal  0.207226 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0923  UDP-glucose 4-epimerase  22.73 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000616826  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.25 
 
 
304 aa  66.2  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  27.88 
 
 
329 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0215  UDP-glucose 4-epimerase  26.44 
 
 
344 aa  65.1  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.91 
 
 
338 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.33 
 
 
308 aa  65.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4335  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.31 
 
 
349 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.796314  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23780  UDP-glucose 4-epimerase  27.92 
 
 
308 aa  65.1  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00097023  normal  0.178512 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1836  UDP-glucose 4-epimerase  25.62 
 
 
337 aa  65.1  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000102298  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.09 
 
 
318 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4331  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.99 
 
 
331 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3291  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.12 
 
 
294 aa  64.7  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43810  putative dtdp-glucose 4,6-dehydratase  22.16 
 
 
332 aa  65.1  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.720699 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0186  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.46 
 
 
320 aa  64.7  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2149  UDP-glucose 4-epimerase  25.23 
 
 
335 aa  65.1  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2889  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.12 
 
 
294 aa  64.7  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.244527  normal  0.404656 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.54 
 
 
281 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  26.52 
 
 
320 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.87 
 
 
308 aa  64.3  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.56373  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6244  oxidoreductase Rmd  29.19 
 
 
303 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.588442  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  28.44 
 
 
322 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.27 
 
 
305 aa  63.5  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76750  UDP glucose-4-epimerase  22.47 
 
 
688 aa  63.5  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.949645  normal  0.956921 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.91 
 
 
313 aa  63.5  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5661  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.64 
 
 
329 aa  63.5  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0256  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.69 
 
 
334 aa  63.5  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00101554  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0774  UDP-galactose 4-epimerase  27.11 
 
 
336 aa  63.5  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0405649 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  25 
 
 
354 aa  63.2  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5507  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25 
 
 
349 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1119  UDP-glucose 4-epimerase  25.39 
 
 
336 aa  63.2  0.000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4642  predicted protein  26.09 
 
 
347 aa  63.2  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.609905  normal  0.210663 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  25.57 
 
 
332 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6347  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.14 
 
 
330 aa  62.8  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0782  UDP-galactose-4-epimerase  25.29 
 
 
338 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00238  UDP-glucose 4-epimerase  24.48 
 
 
338 aa  62.8  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0680  UDP-galactose-4-epimerase  25.29 
 
 
338 aa  62.8  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0786  UDP-galactose-4-epimerase  25.29 
 
 
338 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  29.45 
 
 
330 aa  62.8  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0187  UDP-galactose 4-epimerase  26.61 
 
 
344 aa  62.8  0.000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.611091  decreased coverage  0.00729822 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4942  UDP-glucose 4-epimerase  24.92 
 
 
328 aa  62.4  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0332152  normal  0.293116 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2883  UDP-glucose 4-epimerase  25.29 
 
 
338 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.09 
 
 
304 aa  62.4  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.356198  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0816  UDP-glucose 4-epimerase  23.35 
 
 
337 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05730  UDP-galactose 4-epimerase  27.19 
 
 
333 aa  62  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.805791  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.52 
 
 
334 aa  62  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0370756  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.19 
 
 
315 aa  62.4  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1853  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 
319 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.61 
 
 
306 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1700  NDP-hexose epimerase/oxydoreductase  25.09 
 
 
304 aa  62.4  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47152  predicted protein  23.18 
 
 
437 aa  62.4  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.23 
 
 
309 aa  62.4  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2903  UDP-galactose-4-epimerase  25.29 
 
 
338 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0813  UDP-galactose-4-epimerase  25.29 
 
 
338 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  26.61 
 
 
329 aa  62  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  24.32 
 
 
324 aa  62  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1728  UDP-glucose 4-epimerase  21.55 
 
 
338 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.87625  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2141  UDP-glucose 4-epimerase  26.79 
 
 
334 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27450  UDP-galactose 4-epimerase  27.03 
 
 
355 aa  61.2  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2317  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  35.53 
 
 
367 aa  61.6  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.150256 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 
329 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4161  UDP-galactose 4-epimerase  32.12 
 
 
334 aa  61.6  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00395253  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0862  UDP-galactose-4-epimerase  25.29 
 
 
338 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0889309  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.84 
 
 
283 aa  61.6  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0812  UDP-galactose-4-epimerase  24.19 
 
 
338 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  30.25 
 
 
330 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1769  UDP-glucose 4-epimerase  27.46 
 
 
320 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818465  normal  0.0921457 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  24.39 
 
 
324 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  24.49 
 
 
330 aa  60.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>