More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_4642 on replicon NC_009363
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009363  OSTLU_4642  predicted protein  100 
 
 
347 aa  718    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.609905  normal  0.210663 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  40.12 
 
 
332 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  37.83 
 
 
337 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0464  UDP-glucose 4-epimerase  40.18 
 
 
327 aa  241  1e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0781477  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  37.24 
 
 
337 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  37.76 
 
 
332 aa  238  1e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1148  UDP-glucose 4-epimerase  39.7 
 
 
328 aa  236  5.0000000000000005e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.602539  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1273  UDP-glucose 4-epimerase  39.4 
 
 
328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.138557  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1224  UDP-glucose 4-epimerase  39.29 
 
 
328 aa  233  3e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00236591  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0590  UDP-glucose 4-epimerase  38.81 
 
 
328 aa  233  4.0000000000000004e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  41.02 
 
 
328 aa  232  6e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  39.82 
 
 
336 aa  232  6e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  39.64 
 
 
325 aa  232  7.000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  39.34 
 
 
338 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  39.22 
 
 
338 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  39.64 
 
 
338 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  39.34 
 
 
338 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  41.62 
 
 
330 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  41.27 
 
 
330 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  39.34 
 
 
338 aa  230  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  37.46 
 
 
332 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0783  UDP-glucose 4-epimerase  39.29 
 
 
329 aa  231  2e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.297847  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  41.96 
 
 
336 aa  230  3e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  37.46 
 
 
332 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  40.9 
 
 
321 aa  230  3e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  38.51 
 
 
328 aa  229  4e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  37.83 
 
 
333 aa  229  5e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0529  UDP-glucose 4-epimerase  38.3 
 
 
341 aa  228  1e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00475144  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  37.83 
 
 
332 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  38.74 
 
 
339 aa  228  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  39.04 
 
 
337 aa  227  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  37.84 
 
 
338 aa  226  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  40.9 
 
 
353 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  41.67 
 
 
330 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5437  UDP-glucose 4-epimerase  38.62 
 
 
342 aa  225  7e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  37.61 
 
 
328 aa  224  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1573  UDP-glucose 4-epimerase  40.56 
 
 
328 aa  224  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.95776  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  38.69 
 
 
333 aa  223  3e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  37.57 
 
 
332 aa  222  8e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  38.17 
 
 
331 aa  221  9.999999999999999e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  40.12 
 
 
328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  39.94 
 
 
328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  40.12 
 
 
328 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  38.32 
 
 
324 aa  219  7e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0227  UDP-glucose 4-epimerase  36.52 
 
 
351 aa  218  7.999999999999999e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0501438  normal  0.38802 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  36.9 
 
 
327 aa  219  7.999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  37.98 
 
 
326 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  37.61 
 
 
329 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  38.81 
 
 
323 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  40.56 
 
 
324 aa  216  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  37.43 
 
 
339 aa  216  4e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  41.18 
 
 
337 aa  216  4e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  38.39 
 
 
330 aa  215  8e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  37.87 
 
 
337 aa  215  9e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3834  UDP-galactose 4-epimerase  35.26 
 
 
342 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  37.5 
 
 
327 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  40.36 
 
 
329 aa  214  9.999999999999999e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0489  UDP-glucose 4-epimerase  37.54 
 
 
332 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  37.09 
 
 
331 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0182  UDP-glucose 4-epimerase  36.36 
 
 
342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  39.22 
 
 
327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0768  UDP-galactose 4-epimerase  37.72 
 
 
337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  37.57 
 
 
337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2339  UDP-galactose 4-epimerase  35.52 
 
 
349 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569597  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2007  UDP-galactose 4-epimerase  35.69 
 
 
334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.5887  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  36.9 
 
 
326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  37.98 
 
 
336 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  37.57 
 
 
337 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1125  UDP-glucose 4-epimerase  36.31 
 
 
337 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5304  UDP-glucose 4-epimerase  36.34 
 
 
338 aa  212  7e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5700  UDP-glucose 4-epimerase  36.34 
 
 
338 aa  212  7e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  39 
 
 
332 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4331  UDP-glucose 4-epimerase  37.65 
 
 
327 aa  212  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00663713  hitchhiker  0.0035738 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4002  UDP-glucose 4-epimerase  38.25 
 
 
327 aa  212  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.271936  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  38.02 
 
 
354 aa  212  9e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0768  UDP-glucose 4-epimerase  36.39 
 
 
340 aa  212  9e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  36.39 
 
 
340 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  38.81 
 
 
329 aa  211  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  40.99 
 
 
338 aa  211  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  36.83 
 
 
327 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1427  UDP-glucose 4-epimerase  38.99 
 
 
337 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.60129 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0368  UDP-glucose 4-epimerase  36.94 
 
 
323 aa  211  2e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  35.42 
 
 
338 aa  211  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1392  UDP-glucose 4-epimerase  36.9 
 
 
330 aa  211  2e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  35.91 
 
 
337 aa  210  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  37.43 
 
 
324 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  37.39 
 
 
337 aa  209  4e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5131  UDP-glucose 4-epimerase  36.04 
 
 
338 aa  209  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0518622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5545  UDP-glucose 4-epimerase  36.04 
 
 
338 aa  209  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306452 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  38.92 
 
 
329 aa  209  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  36.31 
 
 
331 aa  209  5e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2900  UDP-glucose 4-epimerase  35.22 
 
 
342 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234395  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2501  UDP-glucose 4-epimerase  36.47 
 
 
340 aa  209  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0410  UDP-glucose 4-epimerase  36.09 
 
 
340 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0889  UDP-glucose 4-epimerase  36.09 
 
 
340 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334492  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5146  UDP-glucose 4-epimerase  36.04 
 
 
338 aa  209  7e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  38.62 
 
 
329 aa  209  7e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  38.92 
 
 
329 aa  209  8e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  36.8 
 
 
337 aa  208  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1713  UDP-glucose 4-epimerase  37.39 
 
 
338 aa  208  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0170656  normal  0.546572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>