More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2762 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
317 aa  621  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105028  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.84 
 
 
326 aa  196  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0794985  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.32 
 
 
326 aa  79.7  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.47 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  28.08 
 
 
329 aa  77.8  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1895  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05730  UDP-galactose 4-epimerase  29.28 
 
 
333 aa  76.6  0.0000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.805791  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.43 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0249986  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.76 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.21 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.72 
 
 
364 aa  73.6  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.97 
 
 
296 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0360339 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  22.19 
 
 
326 aa  67  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.68 
 
 
323 aa  67  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.95 
 
 
322 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3528  CDP-abequose synthase  20.71 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  24.11 
 
 
329 aa  66.2  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3519  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.75 
 
 
302 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.68 
 
 
317 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5600  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 
340 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.88 
 
 
329 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1703  CDP-abequose synthase  21.02 
 
 
319 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000035805 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  22.94 
 
 
353 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.11 
 
 
351 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.151939  normal  0.0166428 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.7 
 
 
316 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.577574  normal  0.786667 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72000  oxidoreductase Rmd  24.84 
 
 
304 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1448  UDP-2-acetamido-2,6-dideoxy-hexulose 4-reductase  22.87 
 
 
303 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000898227 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  28.94 
 
 
329 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27520  UDP-galactose 4-epimerase  26.52 
 
 
321 aa  63.5  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.24 
 
 
314 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12941  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  21.79 
 
 
307 aa  63.2  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0139899  normal  0.0320984 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1836  UDP-glucose 4-epimerase  25.55 
 
 
337 aa  62.8  0.000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000102298  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.49 
 
 
318 aa  62.8  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.55 
 
 
317 aa  62.8  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.307285  normal  0.160905 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3348  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.45 
 
 
302 aa  62.4  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179855  normal  0.339449 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.63 
 
 
317 aa  62.4  0.000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 
345 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3850  UDP-2-acetamido-2,6-dideoxy-hexulose 4-reductase  21.69 
 
 
303 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.29 
 
 
317 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.06 
 
 
308 aa  62  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.93 
 
 
317 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.56 
 
 
309 aa  62  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.88 
 
 
308 aa  62  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  27.36 
 
 
327 aa  61.6  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1700  NDP-hexose epimerase/oxydoreductase  24.61 
 
 
304 aa  61.2  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.61 
 
 
304 aa  61.2  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.356198  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0398  ADP-L-glycero-D-manno-heptose-6-epimerase  21.02 
 
 
305 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.71 
 
 
330 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.31 
 
 
319 aa  61.2  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4023  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 
308 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0248885  hitchhiker  0.0015787 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.57 
 
 
330 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46913  normal  0.0352982 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.07 
 
 
312 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  23.24 
 
 
324 aa  60.8  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1800  oxidoreductase Rmd  24.44 
 
 
298 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0661573 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  27.02 
 
 
329 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4820  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.61 
 
 
342 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.503744  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1148  UDP-glucose 4-epimerase  23.25 
 
 
328 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.602539  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  23.43 
 
 
328 aa  60.1  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1679  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.33 
 
 
291 aa  60.1  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0323  UDP-glucose 4-epimerase  20.06 
 
 
315 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.428855  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2781  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 
314 aa  59.7  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  25.38 
 
 
320 aa  59.7  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.6 
 
 
315 aa  59.3  0.00000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1273  UDP-glucose 4-epimerase  22.93 
 
 
328 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.138557  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.29 
 
 
298 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0778  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.29 
 
 
316 aa  58.9  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00475764  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6244  oxidoreductase Rmd  24.28 
 
 
303 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.588442  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2973  UDP-glucose 4-epimerase  24.19 
 
 
331 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3893  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.89 
 
 
346 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258351  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1119  UDP-glucose 4-epimerase  23.44 
 
 
336 aa  57.8  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0493  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.19 
 
 
303 aa  57.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1007  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  24.92 
 
 
319 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.197321  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.88 
 
 
354 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.875814  normal  0.757495 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.81 
 
 
375 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.15 
 
 
314 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1401  UDP-glucose 4-epimerase  26.73 
 
 
325 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0394  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  20.97 
 
 
323 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.286083  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.59 
 
 
319 aa  57.8  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.312436  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  24.02 
 
 
330 aa  57  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1677  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.73 
 
 
336 aa  57.4  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0930  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.43 
 
 
364 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2760  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.3 
 
 
356 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00545494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.3 
 
 
356 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.722542  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3134  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.3 
 
 
356 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.3 
 
 
356 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0337067  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  26.97 
 
 
319 aa  57  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1983  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.43 
 
 
363 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.064917  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3157  GepiA  24.43 
 
 
363 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0004  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.75 
 
 
300 aa  56.2  0.0000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.69 
 
 
302 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0679369  normal  0.411076 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.24 
 
 
327 aa  55.8  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  26.84 
 
 
328 aa  55.8  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3464  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 
315 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174065  normal  0.540107 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.12 
 
 
372 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0121065  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3722  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.09 
 
 
335 aa  55.8  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0590  UDP-glucose 4-epimerase  22.61 
 
 
328 aa  55.8  0.0000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1520  ADP-L-glycero-D-manno-heptose-6-epimerase  20.86 
 
 
312 aa  55.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00376715  hitchhiker  3.69674e-16 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  26.46 
 
 
327 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>