60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1111 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 372 aa  774    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.08 
 
 		 372 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0951736  normal  0.0534111 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18630  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  39.2 
 
 		 381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5443  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.19 
 
 		 369 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 		 364 aa  235  9e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0140  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.66 
 
 		 369 aa  231  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.66 
 
 		 369 aa  231  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3032  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.04 
 
 		 369 aa  229  5e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1622  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.22 
 
 		 374 aa  229  7e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.86 
 
 		 369 aa  228  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1693  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.25 
 
 		 396 aa  222  6e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0559  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.07 
 
 		 372 aa  215  9e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0160035  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.96 
 
 		 372 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506617 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.61 
 
 		 367 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.68 
 
 		 383 aa  191  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1981  WbjC  31.93 
 
 		 373 aa  185  9e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3802  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.94 
 
 		 375 aa  176  9e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1181  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.51 
 
 		 310 aa  54.3  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0055  dTDP-4-dehydrorhamnose 35-epimerase related  27.2 
 
 		 153 aa  53.5  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1176  domain of unknown function DUF1731  31.4 
 
 		 289 aa  52.4  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1504  NAD dependent protein  28.24 
 
 		 328 aa  52  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132125 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02560  UDP-glucuronic acid decarboxylase Uxs1p  24.56 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1063  ADP-L-glycero-D-manno-heptose-6-epimerase  26.43 
 
 		 312 aa  47.8  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0165  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase related  26.83 
 
 		 151 aa  47.8  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1401  UDP-glucose 4-epimerase  28.64 
 
 		 325 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.27 
 
 		 298 aa  47  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.13 
 
 		 328 aa  46.6  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.869195 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.63 
 
 		 306 aa  46.2  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44260  NAD dependent epimerase/dehydratase  26.24 
 
 		 303 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1044  UDP-galactose 4-epimerase  25.18 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.11 
 
 		 321 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000491095  unclonable  4.61706e-23 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0024  UDP-glucose 4-epimerase  27.27 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0016  hypothetical protein  22 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.59 
 
 		 308 aa  45.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23780  UDP-glucose 4-epimerase  25.3 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00097023  normal  0.178512 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3049  uridine diphosphate N-acetylgalactosamine 4-epimerase  26.88 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.200753  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05730  UDP-galactose 4-epimerase  24.75 
 
 		 333 aa  44.7  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.805791  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2555  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.15 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.134819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1916  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.89 
 
 		 330 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.215962 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0230  ADP-L-glycero-D-manno-heptose-6-epimerase  23.14 
 
 		 310 aa  44.3  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000382346  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2220  Male sterility-like protein  22.05 
 
 		 306 aa  44.3  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589015  normal  0.345847 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.57 
 
 		 322 aa  43.9  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1718  UDP-glucose 4-epimerase  23.83 
 
 		 318 aa  43.9  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.818272  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.57 
 
 		 318 aa  43.9  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.24 
 
 		 311 aa  43.9  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.73 
 
 		 331 aa  43.9  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.478693  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02852  conserved hypothetical protein  23.79 
 
 		 304 aa  43.5  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000137618  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.86 
 
 		 332 aa  43.5  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.377731  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02802  hypothetical protein  23.79 
 
 		 304 aa  43.5  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000121739  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.82 
 
 		 303 aa  43.5  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.79 
 
 		 304 aa  43.5  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1997  polysaccharide biosynthesis protein CapD  26.44 
 
 		 650 aa  43.5  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.521686 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2854  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.75 
 
 		 307 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000873024 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.96 
 
 		 299 aa  43.1  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1901  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 		 312 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.747333  normal  0.141884 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1847  UDP-glucose 4-epimerase  22.57 
 
 		 317 aa  43.1  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.336736 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3907  UDP-glucose 4-epimerase  27.16 
 
 		 336 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.179551 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 		 305 aa  42.7  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0185  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  21.95 
 
 		 158 aa  42.7  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.91 
 
 		 315 aa  42.7  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>