More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1997 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0484  polysaccharide biosynthesis protein CapD  57.89 
 
 		 648 aa  653    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.339951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1360  polysaccharide biosynthesis protein CapD  55.42 
 
 		 643 aa  677    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1997  polysaccharide biosynthesis protein CapD  100 
 
 		 650 aa  1324    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.521686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4167  polysaccharide biosynthesis protein CapD  57.35 
 
 		 648 aa  682    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3654  polysaccharide biosynthesis protein CapD  57.28 
 
 		 656 aa  665    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.772925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4081  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.41 
 
 		 612 aa  532  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3994  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.9 
 
 		 612 aa  528  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.460388 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4505  polysaccharide biosynthesis protein CapD  47.8 
 
 		 610 aa  524  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000203589  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3050  polysaccharide biosynthesis protein CapD  50.38 
 
 		 613 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5070  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.28 
 
 		 612 aa  502  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2497  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.82 
 
 		 613 aa  502  1e-141  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.495773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0128  hypothetical protein  47.71 
 
 		 635 aa  503  1e-141  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5448  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  46.14 
 
 		 604 aa  499  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5395  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  45.63 
 
 		 603 aa  499  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638255  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0039  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.09 
 
 		 620 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4432  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.78 
 
 		 626 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.908556  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2582  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.41 
 
 		 647 aa  486  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2650  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.26 
 
 		 607 aa  486  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4411  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.88 
 
 		 644 aa  485  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1338  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.62 
 
 		 646 aa  482  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0399433 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1633  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.69 
 
 		 647 aa  484  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3385  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.65 
 
 		 651 aa  482  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2334  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.31 
 
 		 614 aa  480  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000027  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1513  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.66 
 
 		 638 aa  478  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0299792  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3403  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.94 
 
 		 609 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.397319  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1536  polysaccharide biosynthesis protein  43.08 
 
 		 647 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0573  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.37 
 
 		 633 aa  466  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1009  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.08 
 
 		 635 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000685319  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1801  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.82 
 
 		 619 aa  456  1e-127  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2864  polysaccharide biosynthesis protein CapD  52.24 
 
 		 478 aa  452  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1483  capsular polysaccharide biosynthesis  43.45 
 
 		 656 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0903  polysaccharide biosynthesis protein  44.74 
 
 		 615 aa  444  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.999651  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1976  polysaccharide synthase family protein  43.18 
 
 		 637 aa  445  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113139  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3150  polysaccharide biosynthesis protein  43.18 
 
 		 637 aa  445  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2504  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.9 
 
 		 628 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1838  polysaccharide synthase family protein  43.18 
 
 		 637 aa  445  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3090  capsular polysaccharide biosynthesis protein  43.18 
 
 		 637 aa  445  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0408  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.54 
 
 		 627 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3127  capsular polysaccharide biosynthesis protein  43.18 
 
 		 637 aa  445  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2767  polysaccharide synthase family protein  43.18 
 
 		 637 aa  445  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.149651  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0887  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.54 
 
 		 627 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0937  polysaccharide synthase family protein  43.18 
 
 		 637 aa  445  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.217913  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0776  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.93 
 
 		 627 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.905737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0857  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.07 
 
 		 627 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3360  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.04 
 
 		 642 aa  440  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0138  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.99 
 
 		 607 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0143  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.99 
 
 		 611 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0902  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.77 
 
 		 625 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1278  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.63 
 
 		 637 aa  437  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000704719 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3984  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.07 
 
 		 627 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3780  putative epimerase/dehydratase polysaccharide- related biosynthesis protein  42.46 
 
 		 625 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00473075  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1272  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.16 
 
 		 656 aa  433  1e-120  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0765  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.88 
 
 		 630 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3494  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.37 
 
 		 627 aa  435  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000299529  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1028  hypothetical protein  40.81 
 
 		 621 aa  432  1e-119  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0995  hypothetical protein  40.81 
 
 		 621 aa  431  1e-119  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0910  capsular polysaccharide biosynthesis protein  41.04 
 
 		 614 aa  430  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143929  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1211  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.24 
 
 		 605 aa  423  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1244  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.24 
 
 		 605 aa  423  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1871  putative epimerase/dehydratase polysaccharide-related biosynthesis protein  43.99 
 
 		 614 aa  422  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0360  lipopolysaccharide biosynthesis protein (WbpM)-like  42.83 
 
 		 649 aa  420  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2289  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.15 
 
 		 629 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195008  normal  0.481233 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.21 
 
 		 617 aa  418  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2281  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.33 
 
 		 630 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3268  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.07 
 
 		 629 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4167  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.82 
 
 		 628 aa  414  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3126  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.09 
 
 		 633 aa  409  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.503601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05820  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  39.06 
 
 		 613 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0718639  hitchhiker  0.00116651 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2347  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40 
 
 		 616 aa  405  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.866725 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3090  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.31 
 
 		 652 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16980  nucleoside-diphosphate sugar epimerase  47.43 
 
 		 487 aa  405  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2679  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40 
 
 		 647 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.999244  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18500  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  41.75 
 
 		 626 aa  400  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.981447 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6495  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.68 
 
 		 646 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0631  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.48 
 
 		 670 aa  396  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6005  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.17 
 
 		 655 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.104997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1702  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.9 
 
 		 680 aa  395  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1651  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.17 
 
 		 637 aa  392  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.449332  normal  0.072002 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1535  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.37 
 
 		 635 aa  394  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5248  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.01 
 
 		 617 aa  394  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1286  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.55 
 
 		 594 aa  393  1e-108  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.190847  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1592  epimerase/dehydratase protein  41.92 
 
 		 635 aa  391  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2635  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.4 
 
 		 682 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0577  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.06 
 
 		 627 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.155394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0086  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.39 
 
 		 645 aa  386  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4184  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.32 
 
 		 610 aa  386  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0594  polysaccharide biosynthesis protein  39.17 
 
 		 646 aa  384  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3919  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.99 
 
 		 652 aa  382  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2244  polysaccharide biosynthesis protein  40.75 
 
 		 644 aa  382  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.36548  normal  0.0653141 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2611  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.08 
 
 		 653 aa  383  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116735  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1986  nucleotide sugar epimerase/dehydratase WbpM  39.97 
 
 		 670 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0802  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.64 
 
 		 676 aa  382  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0301  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.52 
 
 		 623 aa  380  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1680  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.35 
 
 		 642 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23470  nucleotide sugar epimerase/dehydratase WbpM  39.97 
 
 		 665 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000136897  hitchhiker  0.00347476 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1573  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.1 
 
 		 634 aa  382  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.883555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3456  nucleotide sugar epimerase/dehydratase  37.5 
 
 		 635 aa  381  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.360155  normal  0.018 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1805  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.26 
 
 		 688 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.287116  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1414  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.58 
 
 		 669 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.987327  normal  0.0491926 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0082  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.86 
 
 		 660 aa  376  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>