More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1272 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1272  polysaccharide biosynthesis protein CapD  100 
 
 
656 aa  1327    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2650  polysaccharide biosynthesis protein CapD  47.01 
 
 
607 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2334  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.1 
 
 
614 aa  533  1e-150  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000027  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3494  polysaccharide biosynthesis protein CapD  47.62 
 
 
627 aa  525  1e-148  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000299529  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3050  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.44 
 
 
613 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0910  capsular polysaccharide biosynthesis protein  43.85 
 
 
614 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143929  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4505  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.97 
 
 
610 aa  464  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000203589  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1338  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.87 
 
 
646 aa  462  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0399433 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0128  hypothetical protein  40.4 
 
 
635 aa  459  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2347  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.49 
 
 
616 aa  455  1.0000000000000001e-126  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.866725 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3403  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.82 
 
 
609 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.397319  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4081  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.51 
 
 
612 aa  450  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4411  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.98 
 
 
644 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4432  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.13 
 
 
626 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.908556  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2582  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.82 
 
 
647 aa  442  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3994  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.97 
 
 
612 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.460388 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1633  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.82 
 
 
647 aa  444  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5395  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  40.79 
 
 
603 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638255  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05820  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  40.66 
 
 
613 aa  439  9.999999999999999e-123  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0718639  hitchhiker  0.00116651 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5448  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  41.28 
 
 
604 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2497  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.27 
 
 
613 aa  441  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.495773  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3360  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.34 
 
 
642 aa  436  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2864  polysaccharide biosynthesis protein CapD  49.89 
 
 
478 aa  435  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1997  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.16 
 
 
650 aa  433  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.521686 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0903  polysaccharide biosynthesis protein  40.5 
 
 
615 aa  431  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.999651  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5070  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.13 
 
 
612 aa  430  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1536  polysaccharide biosynthesis protein  39.97 
 
 
647 aa  426  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1513  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.49 
 
 
638 aa  428  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0299792  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1871  putative epimerase/dehydratase polysaccharide-related biosynthesis protein  38.51 
 
 
614 aa  421  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4167  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.85 
 
 
648 aa  422  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1360  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.59 
 
 
643 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1976  polysaccharide synthase family protein  40.1 
 
 
637 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113139  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3150  polysaccharide biosynthesis protein  40.1 
 
 
637 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3090  capsular polysaccharide biosynthesis protein  40.1 
 
 
637 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1838  polysaccharide synthase family protein  40.1 
 
 
637 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1483  capsular polysaccharide biosynthesis  40.1 
 
 
656 aa  410  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3127  capsular polysaccharide biosynthesis protein  40.1 
 
 
637 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2767  polysaccharide synthase family protein  40.1 
 
 
637 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.149651  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0937  polysaccharide synthase family protein  40.1 
 
 
637 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.217913  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0902  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.13 
 
 
625 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3780  putative epimerase/dehydratase polysaccharide- related biosynthesis protein  39.48 
 
 
625 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00473075  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1009  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.49 
 
 
635 aa  405  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000685319  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3654  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.24 
 
 
656 aa  404  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.772925  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2289  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.03 
 
 
629 aa  405  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195008  normal  0.481233 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0039  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.78 
 
 
620 aa  404  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.68 
 
 
617 aa  404  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235509  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3268  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.28 
 
 
629 aa  405  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2504  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.57 
 
 
628 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288119  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3919  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.67 
 
 
652 aa  400  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3984  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.57 
 
 
627 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0776  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.28 
 
 
627 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.905737  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0573  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.83 
 
 
633 aa  400  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1801  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.26 
 
 
619 aa  400  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0143  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.87 
 
 
611 aa  399  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0765  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.58 
 
 
630 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0138  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.99 
 
 
607 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3385  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.51 
 
 
651 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1278  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.25 
 
 
637 aa  398  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000704719 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0484  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.54 
 
 
648 aa  397  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.339951  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0408  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.98 
 
 
627 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0887  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.98 
 
 
627 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0857  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.98 
 
 
627 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0360  lipopolysaccharide biosynthesis protein (WbpM)-like  37.07 
 
 
649 aa  395  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0301  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.03 
 
 
623 aa  395  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1939  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.98 
 
 
664 aa  391  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001764  nucleoside-diphosphate sugar epimerase/dehydratase  39.57 
 
 
662 aa  389  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000353165  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0631  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.09 
 
 
670 aa  386  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2679  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.29 
 
 
647 aa  385  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.999244  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3480  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.25 
 
 
655 aa  385  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.179961  normal  0.331186 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1028  hypothetical protein  38.26 
 
 
621 aa  382  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0995  hypothetical protein  38.26 
 
 
621 aa  379  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1842  polysaccharide biosynthesis protein CapD type  37 
 
 
684 aa  381  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3983  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.3 
 
 
643 aa  382  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2723  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.98 
 
 
649 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1986  nucleotide sugar epimerase/dehydratase WbpM  37.76 
 
 
670 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23470  nucleotide sugar epimerase/dehydratase WbpM  37.93 
 
 
665 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000136897  hitchhiker  0.00347476 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1702  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.48 
 
 
680 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3456  nucleotide sugar epimerase/dehydratase  37.91 
 
 
635 aa  379  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.360155  normal  0.018 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16980  nucleoside-diphosphate sugar epimerase  46.1 
 
 
487 aa  376  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6495  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.44 
 
 
646 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2611  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.75 
 
 
653 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116735  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3033  polysaccharide biosynthesis protein, putative epimerase/dehydratase  37.97 
 
 
644 aa  374  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1805  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.64 
 
 
688 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.287116  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_003296  RS02337  dTDP-glucose 4,6-dehydratase transmembrane protein  38.46 
 
 
665 aa  375  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.029341 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6005  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.63 
 
 
655 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.104997  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0520  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.02 
 
 
647 aa  375  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3090  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.03 
 
 
652 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4002  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.06 
 
 
615 aa  374  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1379  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.6 
 
 
675 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.136886  hitchhiker  0.000537083 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.77 
 
 
664 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.237133  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0609  polysaccharide biosynthesis protein  36.44 
 
 
642 aa  370  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1244  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.03 
 
 
605 aa  372  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1131  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.84 
 
 
671 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00726608  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1878  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.43 
 
 
622 aa  372  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.822308  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2635  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.35 
 
 
682 aa  372  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1211  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.03 
 
 
605 aa  372  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2244  polysaccharide biosynthesis protein  35.81 
 
 
644 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.36548  normal  0.0653141 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1680  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.11 
 
 
642 aa  368  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981888  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3126  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.07 
 
 
633 aa  368  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.503601  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0371  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.54 
 
 
604 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>