More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2650 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2650  polysaccharide biosynthesis protein CapD  100 
 
 		 607 aa  1236    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2334  polysaccharide biosynthesis protein CapD  52.73 
 
 		 614 aa  642    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000027  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4505  polysaccharide biosynthesis protein CapD  48.17 
 
 		 610 aa  554  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000203589  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3494  polysaccharide biosynthesis protein CapD  50.08 
 
 		 627 aa  548  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000299529  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1272  polysaccharide biosynthesis protein CapD  47.01 
 
 		 656 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2347  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.76 
 
 		 616 aa  540  9.999999999999999e-153  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.866725 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2497  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.73 
 
 		 613 aa  536  1e-151  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.495773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3994  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.93 
 
 		 612 aa  533  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.460388 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05820  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  46.74 
 
 		 613 aa  533  1e-150  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0718639  hitchhiker  0.00116651 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4081  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.07 
 
 		 612 aa  535  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3050  polysaccharide biosynthesis protein CapD  49.21 
 
 		 613 aa  533  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0910  capsular polysaccharide biosynthesis protein  48.57 
 
 		 614 aa  526  1e-148  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143929  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4432  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.33 
 
 		 626 aa  524  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.908556  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4411  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.76 
 
 		 644 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0128  hypothetical protein  43.66 
 
 		 635 aa  514  1e-144  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3403  polysaccharide biosynthesis protein CapD  50.89 
 
 		 609 aa  495  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.397319  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5395  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  45.59 
 
 		 603 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638255  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1338  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.9 
 
 		 646 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0399433 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5448  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  45.59 
 
 		 604 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5070  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.17 
 
 		 612 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3360  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.4 
 
 		 642 aa  491  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1997  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.26 
 
 		 650 aa  486  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.521686 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1633  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.51 
 
 		 647 aa  482  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2582  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.01 
 
 		 647 aa  478  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1513  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.26 
 
 		 638 aa  475  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0299792  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2864  polysaccharide biosynthesis protein CapD  52.82 
 
 		 478 aa  475  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0903  polysaccharide biosynthesis protein  43.11 
 
 		 615 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.999651  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3385  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.65 
 
 		 651 aa  468  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1801  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.75 
 
 		 619 aa  459  9.999999999999999e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1009  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.61 
 
 		 635 aa  455  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000685319  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3268  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.41 
 
 		 629 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1360  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.54 
 
 		 643 aa  453  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0138  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.95 
 
 		 607 aa  449  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1536  polysaccharide biosynthesis protein  40.47 
 
 		 647 aa  450  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0573  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.93 
 
 		 633 aa  451  1e-125  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0143  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.95 
 
 		 611 aa  448  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0902  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.5 
 
 		 625 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0039  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.36 
 
 		 620 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4167  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.91 
 
 		 648 aa  449  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3127  capsular polysaccharide biosynthesis protein  39.97 
 
 		 637 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1976  polysaccharide synthase family protein  39.97 
 
 		 637 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113139  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3150  polysaccharide biosynthesis protein  39.97 
 
 		 637 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3090  capsular polysaccharide biosynthesis protein  39.97 
 
 		 637 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1483  capsular polysaccharide biosynthesis  39.97 
 
 		 656 aa  444  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1838  polysaccharide synthase family protein  39.97 
 
 		 637 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0776  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.27 
 
 		 627 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.905737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1702  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.05 
 
 		 680 aa  445  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2767  polysaccharide synthase family protein  39.97 
 
 		 637 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.149651  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0937  polysaccharide synthase family protein  39.97 
 
 		 637 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.217913  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0360  lipopolysaccharide biosynthesis protein (WbpM)-like  41 
 
 		 649 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1871  putative epimerase/dehydratase polysaccharide-related biosynthesis protein  38.69 
 
 		 614 aa  436  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3984  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.8 
 
 		 627 aa  437  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2504  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.97 
 
 		 628 aa  437  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0408  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.46 
 
 		 627 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0887  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.46 
 
 		 627 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0857  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.46 
 
 		 627 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.56 
 
 		 617 aa  432  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0765  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.46 
 
 		 630 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0484  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.71 
 
 		 648 aa  432  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.339951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3654  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.74 
 
 		 656 aa  432  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.772925  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1028  hypothetical protein  38.19 
 
 		 621 aa  430  1e-119  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0995  hypothetical protein  38.02 
 
 		 621 aa  428  1e-118  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3780  putative epimerase/dehydratase polysaccharide- related biosynthesis protein  38.9 
 
 		 625 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00473075  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2289  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.97 
 
 		 629 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195008  normal  0.481233 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1278  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.39 
 
 		 637 aa  424  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000704719 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2281  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.14 
 
 		 630 aa  420  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0802  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.21 
 
 		 676 aa  419  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16980  nucleoside-diphosphate sugar epimerase  48.2 
 
 		 487 aa  421  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1805  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.63 
 
 		 688 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.287116  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1414  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.32 
 
 		 669 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.987327  normal  0.0491926 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1244  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.24 
 
 		 605 aa  411  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1211  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.24 
 
 		 605 aa  411  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0631  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.16 
 
 		 670 aa  409  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3126  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.88 
 
 		 633 aa  408  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.503601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3456  nucleotide sugar epimerase/dehydratase  40.58 
 
 		 635 aa  402  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.360155  normal  0.018 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0082  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.74 
 
 		 660 aa  402  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3636  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.86 
 
 		 664 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49195 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.58 
 
 		 664 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.237133  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4051  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.11 
 
 		 664 aa  398  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8742  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2876  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.72 
 
 		 646 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02337  dTDP-glucose 4,6-dehydratase transmembrane protein  36.97 
 
 		 665 aa  393  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.029341 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3171  polysaccharide biosynthesis protein  39.89 
 
 		 646 aa  393  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1756  nucleotide sugar epimerase/dehydratase WbpM  38.86 
 
 		 664 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0505797  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2645  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.94 
 
 		 649 aa  394  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1986  nucleotide sugar epimerase/dehydratase WbpM  35.49 
 
 		 670 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23470  nucleotide sugar epimerase/dehydratase WbpM  36.11 
 
 		 665 aa  395  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000136897  hitchhiker  0.00347476 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3656  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.72 
 
 		 652 aa  389  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219229  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001764  nucleoside-diphosphate sugar epimerase/dehydratase  38.12 
 
 		 662 aa  390  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000353165  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0813  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.55 
 
 		 659 aa  389  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3090  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.56 
 
 		 652 aa  391  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2527  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.46 
 
 		 646 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0594  polysaccharide biosynthesis protein  38.59 
 
 		 646 aa  388  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0086  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.22 
 
 		 645 aa  386  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0577  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.26 
 
 		 627 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.155394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3480  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.32 
 
 		 655 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.179961  normal  0.331186 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1486  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.2 
 
 		 646 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0306155  normal  0.36533 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3033  polysaccharide biosynthesis protein, putative epimerase/dehydratase  39.96 
 
 		 644 aa  387  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2244  polysaccharide biosynthesis protein  38.77 
 
 		 644 aa  388  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.36548  normal  0.0653141 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2679  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.44 
 
 		 647 aa  384  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.999244  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3919  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.74 
 
 		 652 aa  385  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0124304 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>