More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3636 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1805  polysaccharide biosynthesis protein CapD  76.17 
 
 		 688 aa  1065    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.287116  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1131  polysaccharide biosynthesis protein CapD  58.17 
 
 		 671 aa  757    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00726608  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1756  nucleotide sugar epimerase/dehydratase WbpM  97.89 
 
 		 664 aa  1308    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0505797  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3636  polysaccharide biosynthesis protein CapD  100 
 
 		 664 aa  1361    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49195 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1878  polysaccharide biosynthesis protein CapD  70.65 
 
 		 622 aa  899    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.822308  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4051  polysaccharide biosynthesis protein CapD  81.52 
 
 		 664 aa  1136    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8742  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1986  nucleotide sugar epimerase/dehydratase WbpM  73.6 
 
 		 670 aa  1030    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1414  polysaccharide biosynthesis protein CapD  75.68 
 
 		 669 aa  1064    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.987327  normal  0.0491926 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3936  polysaccharide biosynthesis protein CapD  77.12 
 
 		 670 aa  1051    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.218283 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23470  nucleotide sugar epimerase/dehydratase WbpM  73.52 
 
 		 665 aa  1032    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000136897  hitchhiker  0.00347476 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30080  Polysaccharide biosynthesis protein  61.43 
 
 		 765 aa  772    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.819591  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1379  polysaccharide biosynthesis protein CapD  79.97 
 
 		 675 aa  1105    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.136886  hitchhiker  0.000537083 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0802  polysaccharide biosynthesis protein CapD  51.15 
 
 		 676 aa  633  1e-180  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2244  polysaccharide biosynthesis protein  50.99 
 
 		 644 aa  625  1e-178  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.36548  normal  0.0653141 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2527  polysaccharide biosynthesis protein CapD  50 
 
 		 646 aa  624  1e-177  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2645  polysaccharide biosynthesis protein CapD  50.53 
 
 		 649 aa  624  1e-177  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3171  polysaccharide biosynthesis protein  50.53 
 
 		 646 aa  620  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0577  polysaccharide biosynthesis protein CapD  53.31 
 
 		 627 aa  614  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.155394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3480  polysaccharide biosynthesis protein CapD  49.84 
 
 		 655 aa  614  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.179961  normal  0.331186 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0594  polysaccharide biosynthesis protein  47.79 
 
 		 646 aa  609  1e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2876  polysaccharide biosynthesis protein CapD  50.08 
 
 		 646 aa  611  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1680  polysaccharide biosynthesis protein CapD  49.7 
 
 		 642 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1486  polysaccharide biosynthesis protein CapD  49.85 
 
 		 646 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0306155  normal  0.36533 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2679  polysaccharide biosynthesis protein CapD  49.32 
 
 		 647 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.999244  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6005  polysaccharide biosynthesis protein CapD  49.16 
 
 		 655 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.104997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6495  polysaccharide biosynthesis protein CapD  49.55 
 
 		 646 aa  600  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3983  polysaccharide biosynthesis protein CapD  50.46 
 
 		 643 aa  601  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2723  polysaccharide biosynthesis protein CapD  48.62 
 
 		 649 aa  596  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1416  polysaccharide biosynthesis protein CapD  49.92 
 
 		 647 aa  592  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.181862  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3456  nucleotide sugar epimerase/dehydratase  47.26 
 
 		 635 aa  588  1e-167  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.360155  normal  0.018 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1939  polysaccharide biosynthesis protein CapD  48.64 
 
 		 664 aa  583  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3033  polysaccharide biosynthesis protein, putative epimerase/dehydratase  47.78 
 
 		 644 aa  579  1e-164  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001764  nucleoside-diphosphate sugar epimerase/dehydratase  47.51 
 
 		 662 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000353165  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0813  polysaccharide biosynthesis protein CapD  47.34 
 
 		 659 aa  566  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1842  polysaccharide biosynthesis protein CapD type  48.21 
 
 		 684 aa  568  1e-160  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1573  polysaccharide biosynthesis protein CapD  48.08 
 
 		 634 aa  568  1e-160  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.883555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2611  polysaccharide biosynthesis protein CapD  47.38 
 
 		 653 aa  566  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116735  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0801  polysaccharide biosynthesis protein CapD  48.46 
 
 		 668 aa  551  1e-155  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.950377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3389  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.18 
 
 		 630 aa  545  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2635  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.5 
 
 		 682 aa  547  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2638  mannosyl-transferase  46.43 
 
 		 621 aa  540  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0605  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.88 
 
 		 666 aa  536  1e-151  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0935812  normal  0.274375 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3273  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.02 
 
 		 628 aa  534  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0520  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.07 
 
 		 647 aa  534  1e-150  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0612  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.19 
 
 		 650 aa  517  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.301721 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.65 
 
 		 664 aa  509  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.237133  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0371  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.12 
 
 		 604 aa  507  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4002  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.01 
 
 		 615 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02337  dTDP-glucose 4,6-dehydratase transmembrane protein  43.74 
 
 		 665 aa  498  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.029341 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0250  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.4 
 
 		 665 aa  493  9.999999999999999e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234353 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0697  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.52 
 
 		 622 aa  473  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0779  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.08 
 
 		 644 aa  458  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1585  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.46 
 
 		 653 aa  451  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216403  normal  0.968528 
 
 
-
 
NC_004310  BR0510  epimerase/dehydratase, putative  41.99 
 
 		 622 aa  444  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.798384  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0514  putative epimerase/dehydratase  41.65 
 
 		 622 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1188  nucleotide sugar epimerase/dehydratase  42.53 
 
 		 628 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2850  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.53 
 
 		 655 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2627  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.03 
 
 		 628 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1306  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase, membrane associated  45.78 
 
 		 635 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.238436  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08591  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase, membrane associated  42.83 
 
 		 626 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225321 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2582  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.47 
 
 		 647 aa  419  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3857  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.03 
 
 		 630 aa  420  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0261396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14131  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase, membrane-associated protein  46.78 
 
 		 520 aa  419  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14281  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase, membrane associated  37.79 
 
 		 629 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1633  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.14 
 
 		 647 aa  411  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2650  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.86 
 
 		 607 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1871  putative epimerase/dehydratase polysaccharide-related biosynthesis protein  40.97 
 
 		 614 aa  403  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2334  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.35 
 
 		 614 aa  405  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000027  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3268  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.66 
 
 		 629 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4432  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.56 
 
 		 626 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.908556  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1278  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.16 
 
 		 637 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000704719 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4411  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.94 
 
 		 644 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1009  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.08 
 
 		 635 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000685319  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.5 
 
 		 617 aa  397  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2497  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.93 
 
 		 613 aa  397  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.495773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5448  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  43.51 
 
 		 604 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1338  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.8 
 
 		 646 aa  393  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0399433 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4081  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.01 
 
 		 612 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3360  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.18 
 
 		 642 aa  395  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3994  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.2 
 
 		 612 aa  395  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.460388 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5395  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  43.89 
 
 		 603 aa  392  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638255  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1997  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.4 
 
 		 650 aa  388  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.521686 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0143  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.22 
 
 		 611 aa  385  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0138  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.22 
 
 		 607 aa  386  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3385  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.02 
 
 		 651 aa  388  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5070  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.98 
 
 		 612 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0408  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.51 
 
 		 627 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0128  hypothetical protein  38.23 
 
 		 635 aa  384  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0857  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.47 
 
 		 627 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0887  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.51 
 
 		 627 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1513  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.24 
 
 		 638 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0299792  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3984  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.09 
 
 		 627 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3403  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.06 
 
 		 609 aa  381  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.397319  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0902  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.27 
 
 		 625 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0903  polysaccharide biosynthesis protein  40.53 
 
 		 615 aa  377  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.999651  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1028  hypothetical protein  38.19 
 
 		 621 aa  378  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1483  capsular polysaccharide biosynthesis  39.65 
 
 		 656 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3780  putative epimerase/dehydratase polysaccharide- related biosynthesis protein  39.31 
 
 		 625 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00473075  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2504  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.58 
 
 		 628 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0776  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.67 
 
 		 627 aa  379  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.905737  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>