More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5070 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_5395  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  92.82 
 
 
603 aa  1153    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638255  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5448  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  92.19 
 
 
604 aa  1153    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3403  polysaccharide biosynthesis protein CapD  62.19 
 
 
609 aa  760    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.397319  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5070  polysaccharide biosynthesis protein CapD  100 
 
 
612 aa  1253    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0143  polysaccharide biosynthesis protein CapD  53.31 
 
 
611 aa  612  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0138  polysaccharide biosynthesis protein CapD  53.31 
 
 
607 aa  612  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4081  polysaccharide biosynthesis protein CapD  48.47 
 
 
612 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3994  polysaccharide biosynthesis protein CapD  47.31 
 
 
612 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.460388 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4505  polysaccharide biosynthesis protein CapD  49.28 
 
 
610 aa  527  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000203589  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3050  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.97 
 
 
613 aa  526  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0128  hypothetical protein  48.38 
 
 
635 aa  517  1.0000000000000001e-145  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2334  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.27 
 
 
614 aa  514  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000027  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1997  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.28 
 
 
650 aa  502  1e-141  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.521686 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2497  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.7 
 
 
613 aa  495  1e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.495773  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2650  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.17 
 
 
607 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1513  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.95 
 
 
638 aa  488  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0299792  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1633  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.36 
 
 
647 aa  488  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2582  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.14 
 
 
647 aa  485  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4432  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.26 
 
 
626 aa  482  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.908556  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2347  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.26 
 
 
616 aa  476  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.866725 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4411  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.7 
 
 
644 aa  475  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1338  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.78 
 
 
646 aa  478  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0399433 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2864  polysaccharide biosynthesis protein CapD  56.39 
 
 
478 aa  477  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05820  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  43.14 
 
 
613 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0718639  hitchhiker  0.00116651 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0573  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.68 
 
 
633 aa  463  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.47 
 
 
617 aa  456  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235509  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0039  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.22 
 
 
620 aa  457  1e-127  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1871  putative epimerase/dehydratase polysaccharide-related biosynthesis protein  41.52 
 
 
614 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3494  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.8 
 
 
627 aa  451  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000299529  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0902  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.27 
 
 
625 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2504  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42 
 
 
628 aa  443  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288119  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3984  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.48 
 
 
627 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0776  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.17 
 
 
627 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.905737  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0408  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.92 
 
 
627 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0857  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.92 
 
 
627 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2289  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.66 
 
 
629 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195008  normal  0.481233 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0887  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.92 
 
 
627 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3385  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.61 
 
 
651 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1976  polysaccharide synthase family protein  41.62 
 
 
637 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113139  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3150  polysaccharide biosynthesis protein  41.62 
 
 
637 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2767  polysaccharide synthase family protein  41.62 
 
 
637 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.149651  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0937  polysaccharide synthase family protein  41.62 
 
 
637 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.217913  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1483  capsular polysaccharide biosynthesis  39.23 
 
 
656 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0484  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.12 
 
 
648 aa  434  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.339951  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3780  putative epimerase/dehydratase polysaccharide- related biosynthesis protein  40.73 
 
 
625 aa  435  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00473075  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3127  capsular polysaccharide biosynthesis protein  41.62 
 
 
637 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3090  capsular polysaccharide biosynthesis protein  41.62 
 
 
637 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1009  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.55 
 
 
635 aa  434  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000685319  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1838  polysaccharide synthase family protein  41.62 
 
 
637 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1360  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40 
 
 
643 aa  430  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1278  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.42 
 
 
637 aa  431  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000704719 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1272  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.13 
 
 
656 aa  430  1e-119  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0910  capsular polysaccharide biosynthesis protein  44.66 
 
 
614 aa  431  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143929  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0765  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.2 
 
 
630 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0903  polysaccharide biosynthesis protein  42.86 
 
 
615 aa  428  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.999651  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4167  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.86 
 
 
648 aa  428  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2281  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.07 
 
 
630 aa  421  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1536  polysaccharide biosynthesis protein  40.68 
 
 
647 aa  422  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3654  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.03 
 
 
656 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.772925  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3360  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.58 
 
 
642 aa  418  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0301  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.79 
 
 
623 aa  414  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3268  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40 
 
 
629 aa  415  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0609  polysaccharide biosynthesis protein  40.83 
 
 
642 aa  409  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1801  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.8 
 
 
619 aa  409  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0360  lipopolysaccharide biosynthesis protein (WbpM)-like  42.33 
 
 
649 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0631  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.52 
 
 
670 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0802  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.54 
 
 
676 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0995  hypothetical protein  40.5 
 
 
621 aa  402  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2723  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.93 
 
 
649 aa  405  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3090  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.93 
 
 
652 aa  403  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0594  polysaccharide biosynthesis protein  38.85 
 
 
646 aa  401  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1028  hypothetical protein  40.17 
 
 
621 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0082  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.52 
 
 
660 aa  397  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0371  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.86 
 
 
604 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1211  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.78 
 
 
605 aa  396  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1244  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.78 
 
 
605 aa  396  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3456  nucleotide sugar epimerase/dehydratase  42.94 
 
 
635 aa  396  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.360155  normal  0.018 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16980  nucleoside-diphosphate sugar epimerase  45.69 
 
 
487 aa  392  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1680  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.43 
 
 
642 aa  392  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981888  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1486  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.63 
 
 
646 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0306155  normal  0.36533 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0577  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.88 
 
 
627 aa  392  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.155394  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1805  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.14 
 
 
688 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.287116  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3171  polysaccharide biosynthesis protein  42.69 
 
 
646 aa  387  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.24 
 
 
664 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.237133  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1842  polysaccharide biosynthesis protein CapD type  37.63 
 
 
684 aa  389  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1414  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.24 
 
 
669 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.987327  normal  0.0491926 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2645  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.86 
 
 
649 aa  388  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0520  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.11 
 
 
647 aa  387  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4002  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.25 
 
 
615 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1702  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.88 
 
 
680 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23470  nucleotide sugar epimerase/dehydratase WbpM  36.79 
 
 
665 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000136897  hitchhiker  0.00347476 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2635  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.44 
 
 
682 aa  388  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2244  polysaccharide biosynthesis protein  37.18 
 
 
644 aa  386  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.36548  normal  0.0653141 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5248  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.86 
 
 
617 aa  387  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3480  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.76 
 
 
655 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.179961  normal  0.331186 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2679  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.33 
 
 
647 aa  385  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.999244  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2527  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.5 
 
 
646 aa  382  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3126  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.62 
 
 
633 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.503601  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1986  nucleotide sugar epimerase/dehydratase WbpM  37.56 
 
 
670 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3919  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.2 
 
 
652 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0124304 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>