More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1131 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1805  polysaccharide biosynthesis protein CapD  57.16 
 
 		 688 aa  771    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.287116  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1756  nucleotide sugar epimerase/dehydratase WbpM  58.02 
 
 		 664 aa  759    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0505797  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3636  polysaccharide biosynthesis protein CapD  58.17 
 
 		 664 aa  766    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49195 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1986  nucleotide sugar epimerase/dehydratase WbpM  62.78 
 
 		 670 aa  833    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4051  polysaccharide biosynthesis protein CapD  58.41 
 
 		 664 aa  767    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8742  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3936  polysaccharide biosynthesis protein CapD  58.11 
 
 		 670 aa  752    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.218283 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30080  Polysaccharide biosynthesis protein  61.91 
 
 		 765 aa  734    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.819591  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23470  nucleotide sugar epimerase/dehydratase WbpM  63.6 
 
 		 665 aa  845    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000136897  hitchhiker  0.00347476 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1131  polysaccharide biosynthesis protein CapD  100 
 
 		 671 aa  1343    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00726608  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1878  polysaccharide biosynthesis protein CapD  61.34 
 
 		 622 aa  736    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.822308  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1379  polysaccharide biosynthesis protein CapD  59.17 
 
 		 675 aa  787    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.136886  hitchhiker  0.000537083 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1414  polysaccharide biosynthesis protein CapD  56.99 
 
 		 669 aa  773    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.987327  normal  0.0491926 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2244  polysaccharide biosynthesis protein  50.6 
 
 		 644 aa  616  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.36548  normal  0.0653141 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3480  polysaccharide biosynthesis protein CapD  51.3 
 
 		 655 aa  617  1e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.179961  normal  0.331186 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0594  polysaccharide biosynthesis protein  47.66 
 
 		 646 aa  606  9.999999999999999e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1680  polysaccharide biosynthesis protein CapD  50 
 
 		 642 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2645  polysaccharide biosynthesis protein CapD  49.1 
 
 		 649 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2723  polysaccharide biosynthesis protein CapD  50.77 
 
 		 649 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3456  nucleotide sugar epimerase/dehydratase  47.97 
 
 		 635 aa  603  1.0000000000000001e-171  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.360155  normal  0.018 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001764  nucleoside-diphosphate sugar epimerase/dehydratase  49.02 
 
 		 662 aa  600  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000353165  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2679  polysaccharide biosynthesis protein CapD  50.15 
 
 		 647 aa  597  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.999244  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3171  polysaccharide biosynthesis protein  49.17 
 
 		 646 aa  593  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2527  polysaccharide biosynthesis protein CapD  49.32 
 
 		 646 aa  594  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0802  polysaccharide biosynthesis protein CapD  50.07 
 
 		 676 aa  594  1e-168  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2876  polysaccharide biosynthesis protein CapD  49.1 
 
 		 646 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1486  polysaccharide biosynthesis protein CapD  49.7 
 
 		 646 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0306155  normal  0.36533 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0577  polysaccharide biosynthesis protein CapD  50.63 
 
 		 627 aa  589  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.155394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1842  polysaccharide biosynthesis protein CapD type  49.85 
 
 		 684 aa  586  1e-166  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1939  polysaccharide biosynthesis protein CapD  49.32 
 
 		 664 aa  588  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6005  polysaccharide biosynthesis protein CapD  47.81 
 
 		 655 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.104997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3033  polysaccharide biosynthesis protein, putative epimerase/dehydratase  47.31 
 
 		 644 aa  582  1.0000000000000001e-165  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6495  polysaccharide biosynthesis protein CapD  48.94 
 
 		 646 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3983  polysaccharide biosynthesis protein CapD  50 
 
 		 643 aa  577  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0813  polysaccharide biosynthesis protein CapD  47.81 
 
 		 659 aa  576  1.0000000000000001e-163  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1416  polysaccharide biosynthesis protein CapD  49.78 
 
 		 647 aa  570  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.181862  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2611  polysaccharide biosynthesis protein CapD  47.54 
 
 		 653 aa  567  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116735  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1573  polysaccharide biosynthesis protein CapD  48.7 
 
 		 634 aa  558  1e-157  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.883555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2635  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.51 
 
 		 682 aa  550  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2638  mannosyl-transferase  46.34 
 
 		 621 aa  542  1e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0801  polysaccharide biosynthesis protein CapD  48.62 
 
 		 668 aa  532  1e-149  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.950377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3273  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.7 
 
 		 628 aa  523  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.4 
 
 		 664 aa  521  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.237133  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0605  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.86 
 
 		 666 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0935812  normal  0.274375 
 
 
-
 
NC_003296  RS02337  dTDP-glucose 4,6-dehydratase transmembrane protein  45.55 
 
 		 665 aa  513  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.029341 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0250  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.26 
 
 		 665 aa  513  1e-144  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234353 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0612  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.43 
 
 		 650 aa  511  1e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.301721 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3389  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44 
 
 		 630 aa  510  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0520  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.12 
 
 		 647 aa  503  1e-141  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0371  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.39 
 
 		 604 aa  500  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4002  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.7 
 
 		 615 aa  491  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0697  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.21 
 
 		 622 aa  458  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1585  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.72 
 
 		 653 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216403  normal  0.968528 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0779  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.14 
 
 		 644 aa  441  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3857  polysaccharide biosynthesis protein CapD  49.08 
 
 		 630 aa  434  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0261396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2850  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.06 
 
 		 655 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1188  nucleotide sugar epimerase/dehydratase  45.06 
 
 		 628 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2627  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.12 
 
 		 628 aa  435  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08591  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase, membrane associated  46.28 
 
 		 626 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225321 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0514  putative epimerase/dehydratase  41.36 
 
 		 622 aa  426  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0510  epimerase/dehydratase, putative  41.53 
 
 		 622 aa  424  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.798384  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2334  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.98 
 
 		 614 aa  419  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000027  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2582  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.4 
 
 		 647 aa  410  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4432  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.68 
 
 		 626 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.908556  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1633  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.6 
 
 		 647 aa  411  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1513  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.5 
 
 		 638 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0299792  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1338  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.1 
 
 		 646 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0399433 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4411  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.22 
 
 		 644 aa  405  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3268  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.62 
 
 		 629 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2497  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.27 
 
 		 613 aa  399  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.495773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1278  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.11 
 
 		 637 aa  397  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000704719 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3360  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.18 
 
 		 642 aa  398  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14131  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase, membrane-associated protein  43.62 
 
 		 520 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14281  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase, membrane associated  35.68 
 
 		 629 aa  395  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4081  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.84 
 
 		 612 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3994  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.91 
 
 		 612 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.460388 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3385  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.25 
 
 		 651 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5448  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  37.71 
 
 		 604 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5070  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.54 
 
 		 612 aa  383  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5395  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  37.48 
 
 		 603 aa  382  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638255  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0902  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.22 
 
 		 625 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.14 
 
 		 617 aa  376  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2650  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.26 
 
 		 607 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0360  lipopolysaccharide biosynthesis protein (WbpM)-like  40.89 
 
 		 649 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1272  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.56 
 
 		 656 aa  376  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1997  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.66 
 
 		 650 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.521686 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3780  putative epimerase/dehydratase polysaccharide- related biosynthesis protein  41.89 
 
 		 625 aa  375  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00473075  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3050  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.49 
 
 		 613 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3403  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.59 
 
 		 609 aa  374  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.397319  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1871  putative epimerase/dehydratase polysaccharide-related biosynthesis protein  40.8 
 
 		 614 aa  370  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1306  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase, membrane associated  39.76 
 
 		 635 aa  372  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.238436  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0143  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.28 
 
 		 611 aa  370  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0138  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.96 
 
 		 607 aa  370  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05820  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  37.21 
 
 		 613 aa  367  1e-100  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0718639  hitchhiker  0.00116651 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1009  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.25 
 
 		 635 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000685319  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1483  capsular polysaccharide biosynthesis  41.07 
 
 		 656 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0039  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.91 
 
 		 620 aa  367  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2504  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.45 
 
 		 628 aa  369  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0910  capsular polysaccharide biosynthesis protein  33.28 
 
 		 614 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143929  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0301  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.57 
 
 		 623 aa  365  1e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2347  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.08 
 
 		 616 aa  365  1e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.866725 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>