More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_18500 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_18500  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  100 
 
 		 626 aa  1252    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.981447 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5248  polysaccharide biosynthesis protein CapD  50.18 
 
 		 617 aa  496  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4184  polysaccharide biosynthesis protein CapD  48.03 
 
 		 610 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3473  polysaccharide biosynthesis protein CapD  51.9 
 
 		 666 aa  457  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.467717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1271  polysaccharide biosynthesis protein CapD  50.73 
 
 		 655 aa  438  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1997  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.75 
 
 		 650 aa  400  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.521686 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1360  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.17 
 
 		 643 aa  396  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5395  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  43.84 
 
 		 603 aa  392  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638255  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4432  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.25 
 
 		 626 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.908556  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5448  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  46.88 
 
 		 604 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0128  hypothetical protein  45.34 
 
 		 635 aa  386  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4167  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.92 
 
 		 648 aa  386  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2582  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.14 
 
 		 647 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4411  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.34 
 
 		 644 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3360  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.24 
 
 		 642 aa  384  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5070  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.42 
 
 		 612 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4081  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.78 
 
 		 612 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0484  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.99 
 
 		 648 aa  379  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.339951  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0903  polysaccharide biosynthesis protein  39.76 
 
 		 615 aa  377  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.999651  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2497  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.41 
 
 		 613 aa  377  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.495773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1633  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.86 
 
 		 647 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1338  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.91 
 
 		 646 aa  373  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0399433 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2334  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.07 
 
 		 614 aa  372  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000027  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0039  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.53 
 
 		 620 aa  373  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3994  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.97 
 
 		 612 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.460388 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4505  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.14 
 
 		 610 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000203589  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.34 
 
 		 617 aa  366  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3403  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.74 
 
 		 609 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.397319  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3050  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.35 
 
 		 613 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3654  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.62 
 
 		 656 aa  365  1e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.772925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1513  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.52 
 
 		 638 aa  365  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0299792  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3268  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.88 
 
 		 629 aa  362  1e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1009  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.14 
 
 		 635 aa  362  1e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000685319  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2650  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.73 
 
 		 607 aa  362  2e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0573  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.89 
 
 		 633 aa  360  4e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1702  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.11 
 
 		 680 aa  360  6e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2864  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.33 
 
 		 478 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1871  putative epimerase/dehydratase polysaccharide-related biosynthesis protein  41.73 
 
 		 614 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3385  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.77 
 
 		 651 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0360  lipopolysaccharide biosynthesis protein (WbpM)-like  45.52 
 
 		 649 aa  356  6.999999999999999e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3090  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.71 
 
 		 652 aa  353  7e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1272  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.1 
 
 		 656 aa  352  1e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0138  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.23 
 
 		 607 aa  348  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1536  polysaccharide biosynthesis protein  40.68 
 
 		 647 aa  348  2e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0143  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.23 
 
 		 611 aa  348  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1028  hypothetical protein  38.36 
 
 		 621 aa  347  3e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1801  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.21 
 
 		 619 aa  346  8.999999999999999e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0995  hypothetical protein  38.55 
 
 		 621 aa  345  1e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1278  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.62 
 
 		 637 aa  345  1e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000704719 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1592  epimerase/dehydratase protein  43.5 
 
 		 635 aa  344  2.9999999999999997e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0910  capsular polysaccharide biosynthesis protein  40.58 
 
 		 614 aa  344  2.9999999999999997e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143929  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1535  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.46 
 
 		 635 aa  343  5e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2347  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.84 
 
 		 616 aa  343  8e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.866725 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4766  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.11 
 
 		 643 aa  341  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0559289  normal  0.121979 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0301  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.76 
 
 		 623 aa  341  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2504  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.26 
 
 		 628 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3780  putative epimerase/dehydratase polysaccharide- related biosynthesis protein  39.37 
 
 		 625 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00473075  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0408  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.72 
 
 		 627 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0887  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.72 
 
 		 627 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0857  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.72 
 
 		 627 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3494  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.27 
 
 		 627 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000299529  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0902  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.27 
 
 		 625 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2638  mannosyl-transferase  36.78 
 
 		 621 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0776  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.88 
 
 		 627 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.905737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05820  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  40.08 
 
 		 613 aa  335  1e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0718639  hitchhiker  0.00116651 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0250  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.26 
 
 		 665 aa  334  3e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234353 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3126  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.76 
 
 		 633 aa  334  3e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.503601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0765  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.92 
 
 		 630 aa  334  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1939  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.33 
 
 		 664 aa  333  6e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0609  polysaccharide biosynthesis protein  44.2 
 
 		 642 aa  333  6e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00896  epimerase  40.15 
 
 		 635 aa  333  6e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2281  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.3 
 
 		 630 aa  332  1e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3919  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.43 
 
 		 652 aa  331  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3984  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.18 
 
 		 627 aa  331  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1286  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.52 
 
 		 594 aa  331  3e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.190847  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3150  polysaccharide biosynthesis protein  39.69 
 
 		 637 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2767  polysaccharide synthase family protein  39.69 
 
 		 637 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.149651  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1976  polysaccharide synthase family protein  39.69 
 
 		 637 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113139  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3090  capsular polysaccharide biosynthesis protein  39.69 
 
 		 637 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1838  polysaccharide synthase family protein  39.69 
 
 		 637 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3127  capsular polysaccharide biosynthesis protein  39.69 
 
 		 637 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0937  polysaccharide synthase family protein  39.69 
 
 		 637 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.217913  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4051  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.63 
 
 		 664 aa  330  7e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8742  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1805  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.27 
 
 		 688 aa  329  8e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.287116  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2244  polysaccharide biosynthesis protein  37.42 
 
 		 644 aa  329  9e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.36548  normal  0.0653141 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0631  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.7 
 
 		 670 aa  329  1.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1131  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.67 
 
 		 671 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00726608  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1414  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.75 
 
 		 669 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.987327  normal  0.0491926 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1211  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.33 
 
 		 605 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0577  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.7 
 
 		 627 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.155394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1244  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.33 
 
 		 605 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0520  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.82 
 
 		 647 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0082  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.08 
 
 		 660 aa  327  5e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0612  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.92 
 
 		 650 aa  326  7e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.301721 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3389  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.9 
 
 		 630 aa  326  8.000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1573  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.47 
 
 		 634 aa  325  1e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.883555  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0594  polysaccharide biosynthesis protein  36.24 
 
 		 646 aa  325  2e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2527  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.08 
 
 		 646 aa  323  5e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1483  capsular polysaccharide biosynthesis  37.26 
 
 		 656 aa  323  5e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4167  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.34 
 
 		 628 aa  323  6e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>