More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1693 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1693  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
396 aa  822    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1622  NAD-dependent epimerase/dehydratase  72.43 
 
 
374 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3032  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.84 
 
 
369 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.33 
 
 
369 aa  485  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5443  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.22 
 
 
369 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.77 
 
 
369 aa  431  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0140  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.77 
 
 
369 aa  431  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.94 
 
 
383 aa  387  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0559  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.23 
 
 
372 aa  380  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0160035  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1981  WbjC  47.68 
 
 
373 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.23 
 
 
372 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506617 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3802  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.13 
 
 
375 aa  364  1e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.69 
 
 
367 aa  339  4e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.25 
 
 
372 aa  222  7e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
372 aa  220  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0951736  normal  0.0534111 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18630  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.25 
 
 
381 aa  203  4e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
364 aa  186  8e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.02 
 
 
281 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0225  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein/3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  25.75 
 
 
330 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.85 
 
 
318 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 
327 aa  63.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6506  UDP-glucose 4-epimerase  26.03 
 
 
326 aa  63.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.6 
 
 
320 aa  63.2  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 
330 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46913  normal  0.0352982 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.45 
 
 
304 aa  61.2  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
313 aa  61.2  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000549333 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.5 
 
 
320 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0160  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.73 
 
 
310 aa  60.5  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  25.2 
 
 
324 aa  58.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.17 
 
 
317 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5517  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.32 
 
 
315 aa  58.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.89 
 
 
336 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111318  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.15 
 
 
349 aa  57.8  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1677  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.79 
 
 
315 aa  57  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.48 
 
 
331 aa  56.6  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.633416 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.61 
 
 
320 aa  56.6  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0253949  normal  0.427643 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1873  putative UDP-glucose 4-epimerase  21.76 
 
 
306 aa  56.2  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.38 
 
 
325 aa  56.2  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 
324 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0974176  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4509  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.89 
 
 
325 aa  56.2  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.45 
 
 
331 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.33 
 
 
315 aa  56.2  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0171245  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.79 
 
 
321 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.79 
 
 
321 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.15 
 
 
303 aa  55.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.78 
 
 
328 aa  55.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.321568  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.79 
 
 
321 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.79 
 
 
321 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.57 
 
 
315 aa  54.3  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.43 
 
 
321 aa  54.7  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000491095  unclonable  4.61706e-23 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.14 
 
 
313 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101003  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.48 
 
 
313 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.18 
 
 
318 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.5 
 
 
324 aa  54.3  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.89 
 
 
310 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.75 
 
 
320 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3246  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.02 
 
 
338 aa  53.5  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.61 
 
 
318 aa  53.1  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1178  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.93 
 
 
317 aa  53.5  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0253268  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.84 
 
 
311 aa  53.5  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3129  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.63 
 
 
321 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2173  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.46 
 
 
332 aa  53.1  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0967474  normal  0.0101731 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.37 
 
 
321 aa  53.1  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 
319 aa  53.1  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  24.37 
 
 
321 aa  53.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.22 
 
 
329 aa  53.1  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0129  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.79 
 
 
322 aa  52.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.89 
 
 
310 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0764  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.85 
 
 
332 aa  52.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.79 
 
 
330 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 
304 aa  52.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0624037  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4020  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.91 
 
 
318 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.17 
 
 
328 aa  52.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.97 
 
 
320 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0558  polysaccharide biosynthesis protein CapD  27.72 
 
 
340 aa  52.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.201229  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6713  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.34 
 
 
314 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0954433  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14357  predicted protein  27.13 
 
 
359 aa  52  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0021  UDP-glucose 4-epimerase  25 
 
 
308 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.5 
 
 
323 aa  52.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.784653  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein/3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  24.88 
 
 
330 aa  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1844  UDP-glucose 4-epimerase  25.48 
 
 
309 aa  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1672  polysaccharide biosynthesis protein CapD  25.09 
 
 
346 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  24.79 
 
 
318 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.24 
 
 
308 aa  51.6  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43376  predicted protein  23.62 
 
 
326 aa  52  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412352  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4753  polysaccharide biosynthesis protein CapD  24.36 
 
 
345 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.447789  normal  0.0884742 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2863  hypothetical protein  30.36 
 
 
134 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.949512  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.89 
 
 
310 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1621  polysaccharide biosynthesis protein CapD  25.24 
 
 
338 aa  52.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.58 
 
 
332 aa  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00157026  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.52 
 
 
323 aa  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.362508 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3569  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.12 
 
 
334 aa  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.303688  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.33 
 
 
318 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1872  polysaccharide biosynthesis protein CapD  26.38 
 
 
336 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0528646  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2558  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.11 
 
 
335 aa  51.2  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  25 
 
 
332 aa  51.2  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.44 
 
 
321 aa  51.2  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000270425 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.5 
 
 
323 aa  51.6  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.58049  normal  0.22893 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.58 
 
 
314 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.91 
 
 
323 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.473487  normal  0.360955 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>