More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_14581 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_14581  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.12 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.12 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.05 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  31.48 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0489  UDP-glucose 4-epimerase  26.18 
 
 		 332 aa  62.4  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.3 
 
 		 348 aa  62.4  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0186538  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0055  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.66 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.57 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0360193  hitchhiker  0.000175953 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.64 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.97 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.22 
 
 		 347 aa  58.9  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.2 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1273  UDP-glucose 4-epimerase  28.66 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.138557  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.34 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000549333 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0590  UDP-glucose 4-epimerase  28.66 
 
 		 328 aa  57  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1920  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.44 
 
 		 346 aa  57  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.892292  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1148  UDP-glucose 4-epimerase  28.03 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.602539  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.92 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0260  UDP-glucose 4-epimerase  45.16 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.115261  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0130  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.66 
 
 		 347 aa  55.8  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.116782  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  21.26 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0368  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.67 
 
 		 347 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0497868  normal  0.291666 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.82 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0774  UDP-galactose 4-epimerase  24.86 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0405649 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  48.33 
 
 		 339 aa  54.7  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.86 
 
 		 349 aa  55.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.36 
 
 		 311 aa  55.1  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5131  UDP-glucose 4-epimerase  43.28 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0518622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5146  UDP-glucose 4-epimerase  43.28 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  30.82 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  18.54 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5545  UDP-glucose 4-epimerase  43.28 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306452 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1573  UDP-glucose 4-epimerase  25.64 
 
 		 328 aa  54.3  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.95776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2821  UDP-glucose 4-epimerase  22.17 
 
 		 332 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  26.95 
 
 		 327 aa  53.9  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.39 
 
 		 316 aa  53.9  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2555  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.5 
 
 		 311 aa  53.5  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.134819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.15 
 
 		 336 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0777  UDP-galactose 4-epimerase  39.39 
 
 		 329 aa  53.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107594  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56720  putative oxidoreductase  21.05 
 
 		 329 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5494  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  23.62 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4425  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  21.04 
 
 		 336 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.15 
 
 		 336 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  46.67 
 
 		 338 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  46.67 
 
 		 338 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.47 
 
 		 285 aa  53.1  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  46.67 
 
 		 337 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  46.67 
 
 		 338 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0713  UDP-glucose 4-epimerase  40.32 
 
 		 339 aa  53.5  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  25.17 
 
 		 331 aa  53.5  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  45 
 
 		 338 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0529  UDP-glucose 4-epimerase  34.83 
 
 		 341 aa  53.1  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00475144  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5437  UDP-glucose 4-epimerase  46.67 
 
 		 342 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0056  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.14 
 
 		 318 aa  53.1  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  40.98 
 
 		 330 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  46.67 
 
 		 338 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  41.94 
 
 		 337 aa  52.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.53 
 
 		 309 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1293  UDP-glucose 4-epimerase  43.86 
 
 		 336 aa  52.8  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606002  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.68 
 
 		 310 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.22 
 
 		 332 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.481935 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1482  UDP-glucose 4-epimerase  41.94 
 
 		 337 aa  52.4  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000762592  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1848  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.81 
 
 		 305 aa  52.4  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  41.94 
 
 		 337 aa  52.4  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.02 
 
 		 309 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0023317 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  41.94 
 
 		 337 aa  52.4  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  41.94 
 
 		 337 aa  52.4  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2870  UDP-glucose 4-epimerase  41.94 
 
 		 337 aa  52.4  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00371745  hitchhiker  0.000000287874 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  41.94 
 
 		 337 aa  52.4  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  41.94 
 
 		 337 aa  52.4  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1477  UDP-glucose 4-epimerase  41.94 
 
 		 337 aa  52.4  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000121809  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.68 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5304  UDP-glucose 4-epimerase  41.79 
 
 		 338 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  45 
 
 		 336 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  26.42 
 
 		 339 aa  52  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0571  UDP-glucose 4-epimerase  32.67 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5700  UDP-glucose 4-epimerase  41.79 
 
 		 338 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1685  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  21.66 
 
 		 342 aa  51.6  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3445  glutamine amidotransferase  20.77 
 
 		 332 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  34.65 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  27.15 
 
 		 329 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0539  hypothetical protein  20.85 
 
 		 328 aa  51.6  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.26 
 
 		 310 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1622  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.56 
 
 		 374 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3722  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.13 
 
 		 335 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4288  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.15 
 
 		 336 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0737  UDP-glucose 4-epimerase  29.63 
 
 		 339 aa  50.8  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.6 
 
 		 299 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  40.32 
 
 		 336 aa  51.2  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1044  UDP-galactose 4-epimerase  28.7 
 
 		 338 aa  51.2  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.18 
 
 		 372 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506617 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.59 
 
 		 310 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14221  hypothetical protein  25.15 
 
 		 307 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1433  UDP-glucose 4-epimerase  40.32 
 
 		 337 aa  50.4  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0122713  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  38.71 
 
 		 337 aa  50.4  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  19.4 
 
 		 332 aa  50.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3002  UDP-glucose 4-epimerase  43.33 
 
 		 337 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.03 
 
 		 312 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3907  UDP-glucose 4-epimerase  41.94 
 
 		 336 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.179551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>