More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3553 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 302 aa  607  9.999999999999999e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.107355  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.16 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 		 318 aa  112  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2077  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.06 
 
 		 314 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.79 
 
 		 306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.39 
 
 		 310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.51 
 
 		 281 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2854  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.75 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000873024 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.44 
 
 		 312 aa  106  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1178  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33 
 
 		 317 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0253268  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0816  UDP-glucose 4-epimerase  28.57 
 
 		 337 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3228  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.9 
 
 		 316 aa  102  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.24 
 
 		 317 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.15 
 
 		 292 aa  102  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1066  UDP-glucose 4-epimerase  28.75 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0920176  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  28.75 
 
 		 335 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3310  UDP-glucose 4-epimerase  29.94 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138688  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.84 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  29.08 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1335  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.36 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0357756 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.34 
 
 		 317 aa  99.4  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.38 
 
 		 324 aa  99.4  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28 
 
 		 316 aa  99  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.577574  normal  0.786667 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.27 
 
 		 308 aa  99  9e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  32.44 
 
 		 320 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.46 
 
 		 339 aa  99  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.443287 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3722  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 		 335 aa  98.2  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.75 
 
 		 312 aa  98.2  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0778  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.67 
 
 		 316 aa  97.4  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00475764  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.9 
 
 		 296 aa  95.9  7e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5547  UDP-glucose 4-epimerase  32.01 
 
 		 336 aa  94.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.55 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3691  UDP-glucose 4-epimerase  28.4 
 
 		 319 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  25.9 
 
 		 339 aa  94.7  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2149  UDP-glucose 4-epimerase  27.73 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  25.9 
 
 		 338 aa  94  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  26.81 
 
 		 337 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  25.9 
 
 		 338 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2007  UDP-galactose 4-epimerase  27.5 
 
 		 334 aa  94.4  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.5887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.33 
 
 		 677 aa  94.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  28.4 
 
 		 337 aa  94  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0260  UDP-glucose 4-epimerase  28.14 
 
 		 353 aa  93.6  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.115261  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1722  UDP-galactose 4-epimerase  30.86 
 
 		 373 aa  93.6  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.82 
 
 		 292 aa  94  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  26.81 
 
 		 338 aa  94  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.67 
 
 		 318 aa  93.6  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  26.81 
 
 		 338 aa  93.2  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.68 
 
 		 310 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  31.46 
 
 		 330 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.95 
 
 		 301 aa  92.8  6e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0360193  hitchhiker  0.000175953 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.85 
 
 		 314 aa  92.8  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.37 
 
 		 308 aa  92.8  6e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.87 
 
 		 309 aa  92.8  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05793  UDP-glucose 4-epimerase  27.43 
 
 		 338 aa  92.8  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.9 
 
 		 324 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0974176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0776  UDP-glucose 4-epimerase  31.14 
 
 		 345 aa  92.8  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.16 
 
 		 310 aa  92.4  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 309 aa  92.4  9e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.79 
 
 		 353 aa  91.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0737  UDP-glucose 4-epimerase  30.68 
 
 		 339 aa  91.7  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.13 
 
 		 312 aa  91.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.99 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  26.51 
 
 		 338 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1866  UDP-glucose 4-epimerase  29.97 
 
 		 330 aa  92  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.07 
 
 		 331 aa  90.9  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  26.84 
 
 		 338 aa  91.3  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.67 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.32 
 
 		 316 aa  90.9  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2285  UDP-glucose 4-epimerase  27.49 
 
 		 351 aa  91.3  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  28.12 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1181  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5600  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.21 
 
 		 340 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  29.9 
 
 		 337 aa  90.5  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 		 323 aa  90.9  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.84 
 
 		 329 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.99 
 
 		 303 aa  90.5  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  31.48 
 
 		 331 aa  90.5  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5437  UDP-glucose 4-epimerase  26.85 
 
 		 342 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.59 
 
 		 299 aa  90.5  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  26.51 
 
 		 336 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1115  UDP-glucose 4-epimerase  29.9 
 
 		 326 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.423931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4008  UDP-glucose 4-epimerase  29.04 
 
 		 346 aa  89.4  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000293012 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5131  UDP-glucose 4-epimerase  24.7 
 
 		 338 aa  89  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0518622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5545  UDP-glucose 4-epimerase  24.7 
 
 		 338 aa  89  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306452 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 		 325 aa  88.6  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  26.51 
 
 		 338 aa  89  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5146  UDP-glucose 4-epimerase  24.4 
 
 		 338 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6713  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 		 314 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0954433  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.68 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5304  UDP-glucose 4-epimerase  24.7 
 
 		 338 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.58 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.365657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.17 
 
 		 292 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5700  UDP-glucose 4-epimerase  24.7 
 
 		 338 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0774  UDP-galactose 4-epimerase  29.31 
 
 		 336 aa  87.8  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0405649 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  30.32 
 
 		 329 aa  87.4  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3871  UDP-glucose 4-epimerase  31.17 
 
 		 320 aa  87  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454433 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4069  hypothetical protein  28.92 
 
 		 363 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.487038  normal  0.116036 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1806  UDP-glucose 4-epimerase  31.51 
 
 		 330 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03331  UDP-glucose 4-epimerase  27.6 
 
 		 336 aa  87.4  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>