More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4147 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3013  hypothetical protein  96.72 
 
 		 366 aa  712    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0103839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4147  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  739    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2551  hypothetical protein  44.99 
 
 		 351 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0234245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23800  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  36.18 
 
 		 937 aa  129  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2676  hypothetical protein  40.25 
 
 		 373 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0511814 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0364  Male sterility domain protein  30.46 
 
 		 493 aa  125  9e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4094  Male sterility domain protein  34.66 
 
 		 359 aa  125  9e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.796216  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5128  Male sterility domain protein  33.12 
 
 		 358 aa  123  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.31 
 
 		 383 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2871  Male sterility domain protein  34.97 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2778  male sterility domain protein  34.69 
 
 		 383 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1327  Male sterility domain protein  36.97 
 
 		 356 aa  116  7.999999999999999e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38219  normal  0.51823 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4728  hypothetical protein  36.6 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2522  Male sterility domain protein  34.2 
 
 		 410 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4896  short chain dehydrogenase  36.86 
 
 		 671 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0501144 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1667  hypothetical protein  37.86 
 
 		 358 aa  110  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0262372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4933  Male sterility domain protein  32.46 
 
 		 437 aa  109  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal  0.407936 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3148  Male sterility domain protein  36.03 
 
 		 354 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1750  Male sterility domain protein  35.11 
 
 		 642 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1104  Male sterility domain protein  36.32 
 
 		 701 aa  107  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972313  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3229  Male sterility-like  32.9 
 
 		 351 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  31.34 
 
 		 659 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1527  short chain dehydrogenase  35.57 
 
 		 653 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3912  thioester reductase domain-containing protein  27.54 
 
 		 505 aa  96.7  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501975  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3829  hypothetical protein  33.33 
 
 		 362 aa  95.5  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5489  amino acid adenylation domain-containing protein  27.49 
 
 		 2439 aa  94.4  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934581 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68020  L-aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase, large subunit  29.07 
 
 		 1394 aa  92  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224506  normal  0.0608631 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  32.26 
 
 		 1449 aa  90.5  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2731  Male sterility domain protein  27.96 
 
 		 392 aa  89.7  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.885706  hitchhiker  0.00797999 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  31.43 
 
 		 1454 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3702  thioester reductase domain protein  27.92 
 
 		 398 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3755  thioester reductase domain protein  27.92 
 
 		 398 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.801599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2186  non-ribosomal peptide synthase MxaA  34.96 
 
 		 1436 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026407  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05610  aminoadipate reductase large subunit (Eurofung)  27.65 
 
 		 1421 aa  85.9  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0476531 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3608  Male sterility domain protein  31.91 
 
 		 637 aa  85.9  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.619777  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  28.27 
 
 		 665 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7306  peptide synthetase  28.35 
 
 		 1506 aa  84.3  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.370247  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2595  thioester reductase  28.8 
 
 		 506 aa  83.2  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.410224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  31.33 
 
 		 2107 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4023  short chain dehydrogenase  29.06 
 
 		 671 aa  82  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.367232  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0491  short chain dehydrogenase  30.2 
 
 		 668 aa  81.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0442129 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  27.04 
 
 		 661 aa  80.9  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  27.82 
 
 		 2376 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  26.69 
 
 		 2374 aa  80.5  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  32.34 
 
 		 340 aa  79.3  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4416  amino acid adenylation domain-containing protein  29.76 
 
 		 1485 aa  79.3  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47104  non ribosomal peptide synthase  32.12 
 
 		 1367 aa  79  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13425  short chain dehydrogenase  30.33 
 
 		 650 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1805  amino acid adenylation domain-containing protein  29.6 
 
 		 1413 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.323791  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  27.4 
 
 		 664 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.447449 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0002  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.28 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1225  peptide synthetase  25.9 
 
 		 382 aa  77.4  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.289629  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2232  amino acid adenylation domain protein  31.98 
 
 		 1395 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.214627 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  27.02 
 
 		 1067 aa  75.9  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4890  amino acid adenylation domain-containing protein  29.91 
 
 		 1500 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.365672 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4292  amino acid adenylation domain-containing protein  28.3 
 
 		 1188 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375384  normal  0.670751 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1067  Male sterility-like protein  25.3 
 
 		 685 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2917  short chain dehydrogenase  31.38 
 
 		 665 aa  74.3  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0126943  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.48 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5388  amino acid adenylation domain-containing protein  27.06 
 
 		 997 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4973  amino acid adenylation  28.25 
 
 		 1188 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432296  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3187  amino acid adenylation domain-containing protein  28.25 
 
 		 1188 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.86 
 
 		 326 aa  72.8  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1185  steroid dehydrogenase  28.33 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.809029 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1033  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.88 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.19855 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7636  AMP-dependent synthetase and ligase  29.75 
 
 		 1444 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3156  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.59 
 
 		 361 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  30.27 
 
 		 1270 aa  71.2  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1372  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.73 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1326  AMP-dependent synthetase and ligase  34.73 
 
 		 1538 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.683911  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2112  HAD family hydrolase  32.92 
 
 		 750 aa  70.9  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5457  ornithine acetyl transferase inhibitor  28.81 
 
 		 1149 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.18 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  29.2 
 
 		 1498 aa  70.1  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.92 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1165  long-chain-fatty-acid CoA ligase  35.15 
 
 		 1537 aa  69.7  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3148  thioester reductase domain-containing protein  29.8 
 
 		 1165 aa  69.7  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.209957 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3032  hypothetical protein  24.75 
 
 		 354 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.638017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5015  Male sterility domain-containing protein  28.38 
 
 		 667 aa  69.7  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435156  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2092  AMP-dependent synthetase and ligase  24.21 
 
 		 1406 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261871  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  32.34 
 
 		 329 aa  69.3  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1224  AMP-dependent synthetase and ligase  42.53 
 
 		 1538 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0228  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.43 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.194906  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4650  male sterility domain protein  28.57 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458104  normal  0.580556 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1745  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  28.87 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03495  nonribosomal peptide synthase, putative (Eurofung)  29.47 
 
 		 1480 aa  67  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2712  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.4 
 
 		 394 aa  67  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.62 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3248  AMP-dependent synthetase and ligase  32.14 
 
 		 1542 aa  66.2  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.151013 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.11 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.08 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0280203  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00170  aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase, putative  24.8 
 
 		 1409 aa  65.9  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.682323  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2545  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.4 
 
 		 375 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11140  putative nonribosomal peptide synthetase  27.03 
 
 		 991 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3227  hypothetical protein  23.28 
 
 		 618 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0125277  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12610  fatty-acid-CoA ligase fadD9  27.57 
 
 		 1168 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.945549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.1 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.956027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1513  steroid dehydrogenase  28.72 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0864  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>