More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4023 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  59.61 
 
 		 661 aa  858    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  83.46 
 
 		 664 aa  1170    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.447449 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0491  short chain dehydrogenase  81.24 
 
 		 668 aa  1136    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0442129 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  51.12 
 
 		 659 aa  684    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  84.65 
 
 		 665 aa  1191    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4023  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 671 aa  1388    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.367232  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2917  short chain dehydrogenase  46.89 
 
 		 665 aa  611  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0126943  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4896  short chain dehydrogenase  41.84 
 
 		 671 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0501144 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3608  Male sterility domain protein  40.03 
 
 		 637 aa  434  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.619777  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1527  short chain dehydrogenase  41.63 
 
 		 653 aa  433  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1104  Male sterility domain protein  41.63 
 
 		 701 aa  432  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972313  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1750  Male sterility domain protein  38.63 
 
 		 642 aa  420  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13425  short chain dehydrogenase  38.51 
 
 		 650 aa  404  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.2 
 
 		 292 aa  270  5e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0182353  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.98 
 
 		 295 aa  245  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.366872  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1299  fatty acyl-CoA reductase protein  44.53 
 
 		 295 aa  238  4e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.77 
 
 		 305 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623354  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11576  fatty acyl-CoA reductase  43.38 
 
 		 341 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0726  short chain dehydrogenase  46.51 
 
 		 291 aa  224  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.352329 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0732  short chain dehydrogenase  46.51 
 
 		 291 aa  224  4e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.403449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0746  short chain dehydrogenase  46.51 
 
 		 291 aa  224  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.095749 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0026  short chain dehydrogenase  45.28 
 
 		 319 aa  213  7e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122051  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0944  short chain dehydrogenase  46.46 
 
 		 294 aa  213  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10558  short chain dehydrogenase  43.8 
 
 		 294 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0196339 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0860  short chain dehydrogenase  44.4 
 
 		 291 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0854  short chain dehydrogenase  44.4 
 
 		 291 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0871  short chain dehydrogenase  44.4 
 
 		 291 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3466  short chain dehydrogenase  44.18 
 
 		 294 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.241299 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0002  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 		 273 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.690765 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4094  Male sterility domain protein  32.05 
 
 		 359 aa  181  4.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.796216  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.3 
 
 		 280 aa  178  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.88 
 
 		 275 aa  176  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1327  Male sterility domain protein  32.34 
 
 		 356 aa  172  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38219  normal  0.51823 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1667  hypothetical protein  32.98 
 
 		 358 aa  171  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0262372  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2676  hypothetical protein  32.32 
 
 		 373 aa  167  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0511814 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4728  hypothetical protein  29.68 
 
 		 354 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.97 
 
 		 383 aa  154  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2871  Male sterility domain protein  32.69 
 
 		 381 aa  154  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2778  male sterility domain protein  32.42 
 
 		 383 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2731  Male sterility domain protein  31.22 
 
 		 392 aa  149  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.885706  hitchhiker  0.00797999 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6897  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 		 290 aa  129  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.7 
 
 		 347 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 		 342 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  25.3 
 
 		 1270 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.79 
 
 		 340 aa  114  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0031  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 		 340 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 		 254 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.43 
 
 		 340 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0147442  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.73 
 
 		 264 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0726  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 		 366 aa  111  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.642345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 		 339 aa  110  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.5 
 
 		 244 aa  110  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123251 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0348  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.49 
 
 		 244 aa  109  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.753226  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.18 
 
 		 279 aa  108  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.99 
 
 		 247 aa  107  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 317 aa  108  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00194851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0938  short chain dehydrogenase  31.02 
 
 		 242 aa  107  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23800  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  31.34 
 
 		 937 aa  107  8e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.04 
 
 		 239 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0911  short chain dehydrogenase  31.02 
 
 		 242 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  31.48 
 
 		 236 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2522  Male sterility domain protein  29.65 
 
 		 410 aa  106  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.63 
 
 		 230 aa  105  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 		 286 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.04 
 
 		 239 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.77 
 
 		 267 aa  105  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.04 
 
 		 239 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.84 
 
 		 255 aa  104  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 		 272 aa  104  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4933  Male sterility domain protein  30.91 
 
 		 437 aa  103  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal  0.407936 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 		 255 aa  103  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.91 
 
 		 250 aa  103  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3685  short chain dehydrogenase  33.04 
 
 		 346 aa  103  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.67 
 
 		 272 aa  103  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  33.68 
 
 		 264 aa  103  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0093  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 		 266 aa  103  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0433  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.11 
 
 		 244 aa  103  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00087459  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  33.16 
 
 		 264 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.16 
 
 		 264 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.16 
 
 		 264 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.51 
 
 		 351 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  33.16 
 
 		 264 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.25 
 
 		 360 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0340631  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11068  oxidoreductase  30.43 
 
 		 301 aa  102  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.205536 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.16 
 
 		 264 aa  102  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 		 272 aa  102  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 		 257 aa  102  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.76225  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.32 
 
 		 238 aa  101  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.09 
 
 		 354 aa  101  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.718494 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.96 
 
 		 239 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  30.77 
 
 		 286 aa  100  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.38 
 
 		 264 aa  101  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0980  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.16 
 
 		 238 aa  100  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000633587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  36.9 
 
 		 344 aa  100  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.94 
 
 		 251 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.400321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 		 252 aa  100  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2536  short chain dehydrogenase  30.73 
 
 		 241 aa  100  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 		 274 aa  100  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.448097 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3571  short chain dehydrogenase  30.4 
 
 		 256 aa  100  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0445953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>