More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7636 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7636  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
1444 aa  2963    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2232  amino acid adenylation domain protein  32.32 
 
 
1395 aa  514  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.214627 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2092  AMP-dependent synthetase and ligase  26.56 
 
 
1406 aa  471  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261871  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5753  amino acid adenylation domain protein  30.45 
 
 
1525 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1877  amino acid adenylation domain-containing protein  32.64 
 
 
1525 aa  429  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3092  amino acid adenylation domain protein  28.88 
 
 
1533 aa  409  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3029  amino acid adenylation domain protein  28.98 
 
 
1533 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4220  non-ribosomal peptide synthetase  30.91 
 
 
2628 aa  383  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.663079 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  27.37 
 
 
2164 aa  380  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  29.99 
 
 
4336 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  30.28 
 
 
4336 aa  374  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4072  amino acid adenylation domain protein  31.51 
 
 
3230 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.753138 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  30.47 
 
 
4747 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  30.91 
 
 
5213 aa  369  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4039  amino acid adenylation domain-containing protein  31.1 
 
 
3224 aa  370  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  30.46 
 
 
4318 aa  362  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2148  pyoverdine sidechain peptide synthetase II, D-Asp-L-Thr component  30.57 
 
 
2625 aa  362  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307821  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4085  amino acid adenylation domain-containing protein  31.73 
 
 
2606 aa  361  6e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  30.62 
 
 
2883 aa  356  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  27.51 
 
 
3086 aa  354  8.999999999999999e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  27.51 
 
 
3086 aa  353  8.999999999999999e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  30.14 
 
 
4317 aa  354  8.999999999999999e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  30.2 
 
 
4317 aa  353  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  30.22 
 
 
4317 aa  353  1e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2418  peptide synthetase-like protein  31.47 
 
 
3296 aa  350  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11449  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  30.08 
 
 
4317 aa  349  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  29.74 
 
 
2875 aa  349  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  28.68 
 
 
4332 aa  347  6e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1558  amino acid adenylation domain-containing protein  33.09 
 
 
3227 aa  347  7e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.765691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  29.55 
 
 
4342 aa  345  4e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  29.63 
 
 
4342 aa  340  8e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  27.33 
 
 
1556 aa  336  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  29.99 
 
 
3231 aa  334  7.000000000000001e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  28.7 
 
 
9175 aa  333  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1537  amino acid adenylation domain-containing protein  32.38 
 
 
3227 aa  331  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0525  non-ribosomal peptide synthase  31.08 
 
 
3180 aa  331  7e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  25.62 
 
 
1556 aa  328  5e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  29.29 
 
 
3942 aa  328  6e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  28.63 
 
 
5149 aa  327  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25560  Non-ribosomal peptide synthase, PvdD-like protein  27.66 
 
 
2878 aa  327  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5619  amino acid adenylation domain-containing protein  27.35 
 
 
1518 aa  326  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5189  amino acid adenylation domain protein  29.07 
 
 
6202 aa  325  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000018726 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  29.04 
 
 
5328 aa  325  3e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  26.9 
 
 
3498 aa  325  4e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4786  non-ribosomal peptide synthase  31.3 
 
 
3219 aa  325  4e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303001  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  28.88 
 
 
7712 aa  325  5e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1875  amino acid adenylation domain-containing protein  28.29 
 
 
1990 aa  324  6e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1598  amino acid adenylation domain-containing protein  31.45 
 
 
3219 aa  323  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546873 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0965  amino acid adenylation domain protein  27.36 
 
 
1506 aa  323  1.9999999999999998e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1927  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaJ  30.43 
 
 
3290 aa  322  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  28.97 
 
 
2571 aa  322  5e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1717  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  24.59 
 
 
2295 aa  321  6e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2390  amino acid adenylation domain protein  25.55 
 
 
1490 aa  321  6e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.215425  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0288  putative non-ribosomal peptide synthetase  30.43 
 
 
3294 aa  321  7e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0873  putative non-ribosomal peptide synthetase  30.43 
 
 
3294 aa  321  7e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1942  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaJ  30.42 
 
 
3290 aa  321  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1625  putative non-ribosomal peptide synthetase  30.43 
 
 
3297 aa  321  7e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0842979  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  28.97 
 
 
2571 aa  320  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2461  linear gramicidin synthetase subunit C  26.91 
 
 
1518 aa  319  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2086  putative siderophore related no-ribosomal peptide synthase  30.33 
 
 
3287 aa  319  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6474  amino acid adenylation domain-containing protein  28.71 
 
 
1304 aa  318  6e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.571102 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1782  amino acid adenylation domain-containing protein  26.06 
 
 
1476 aa  318  7e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0024  linear gramicidin synthetase subunit D  26.59 
 
 
3374 aa  317  8e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  27.11 
 
 
4968 aa  317  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7298  peptide synthetase  28.9 
 
 
2573 aa  316  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  27.64 
 
 
5654 aa  316  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  26.18 
 
 
4960 aa  316  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  26.25 
 
 
4960 aa  315  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  27.13 
 
 
2033 aa  315  3.9999999999999997e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  29.09 
 
 
3404 aa  313  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  28.72 
 
 
4991 aa  313  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2875  linear gramicidin synthetase subunit C  26.84 
 
 
1518 aa  313  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  29.31 
 
 
3432 aa  312  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  29.34 
 
 
6176 aa  312  2.9999999999999997e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  27.45 
 
 
4502 aa  311  6.999999999999999e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1716  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  24.74 
 
 
3044 aa  310  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1784  amino acid adenylation domain-containing protein  25.52 
 
 
4080 aa  310  1.0000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2574  amino acid adenylation domain-containing protein  27.24 
 
 
6404 aa  310  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  28.58 
 
 
4136 aa  308  6e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5751  amino acid adenylation domain protein  26.45 
 
 
1578 aa  308  7e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1859  amino acid adenylation domain-containing protein  28.47 
 
 
2596 aa  307  8.000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1858  amino acid adenylation domain-containing protein  28.64 
 
 
1528 aa  306  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  29.31 
 
 
3235 aa  306  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3362  amino acid adenylation  29.71 
 
 
2943 aa  302  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1715  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  25.02 
 
 
2543 aa  301  7e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1615  amino acid adenylation domain-containing protein  33.86 
 
 
3221 aa  300  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0566356 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  31.47 
 
 
3331 aa  295  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  25.62 
 
 
2457 aa  294  7e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1160  amino acid adenylation  33.46 
 
 
3231 aa  292  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1640  amino acid adenylation domain-containing protein  33.46 
 
 
3231 aa  292  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4307  amino acid adenylation domain protein  28.94 
 
 
3247 aa  290  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.39871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  28.46 
 
 
5467 aa  290  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0982  amino acid adenylation domain protein  26.78 
 
 
2006 aa  288  4e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  27.64 
 
 
2845 aa  287  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2329  amino acid adenylation domain protein  25.72 
 
 
2752 aa  286  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  26.29 
 
 
3176 aa  286  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  26.67 
 
 
4037 aa  286  3.0000000000000004e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18400  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  30.99 
 
 
5750 aa  283  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  29.6 
 
 
5230 aa  283  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  29.41 
 
 
3018 aa  279  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0194792 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>