More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6474 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011738  PCC7424_5753  amino acid adenylation domain protein  35.2 
 
 		 1525 aa  709    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  35.56 
 
 		 3086 aa  789    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  37.09 
 
 		 4317 aa  653    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3092  amino acid adenylation domain protein  36.13 
 
 		 1533 aa  742    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1877  amino acid adenylation domain-containing protein  36.43 
 
 		 1525 aa  709    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  36.36 
 
 		 4336 aa  669    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  34.99 
 
 		 9175 aa  657    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  34.86 
 
 		 2571 aa  681    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3029  amino acid adenylation domain protein  36.31 
 
 		 1533 aa  729    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  37.02 
 
 		 4317 aa  651    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  36.4 
 
 		 4336 aa  669    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  37.12 
 
 		 4991 aa  664    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1875  amino acid adenylation domain-containing protein  41.11 
 
 		 1990 aa  723    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  36.73 
 
 		 3942 aa  662    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  34.6 
 
 		 1556 aa  800    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  35.02 
 
 		 5213 aa  653    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2097  amino acid adenylation domain-containing protein  31.87 
 
 		 1992 aa  668    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.164393  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0024  linear gramicidin synthetase subunit D  32.34 
 
 		 3374 aa  651    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  35.91 
 
 		 3498 aa  793    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  38.21 
 
 		 2033 aa  849    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  34.86 
 
 		 2571 aa  679    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  36.44 
 
 		 5328 aa  665    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  36.52 
 
 		 4317 aa  640    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  34.69 
 
 		 5654 aa  637    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  35.46 
 
 		 4502 aa  675    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5751  amino acid adenylation domain protein  36.75 
 
 		 1578 aa  753    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  39.55 
 
 		 4136 aa  651    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  36.7 
 
 		 4317 aa  655    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  35.37 
 
 		 4747 aa  684    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  35.4 
 
 		 4332 aa  677    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  35.48 
 
 		 3086 aa  786    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  34.6 
 
 		 1556 aa  796    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  36.34 
 
 		 7712 aa  657    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0982  amino acid adenylation domain protein  33.54 
 
 		 2006 aa  725    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  36.03 
 
 		 4968 aa  739    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  36.9 
 
 		 2164 aa  805    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  37.26 
 
 		 3176 aa  674    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6474  amino acid adenylation domain-containing protein  100 
 
 		 1304 aa  2636    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.571102 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2461  linear gramicidin synthetase subunit C  33.33 
 
 		 1518 aa  696    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  36.32 
 
 		 4342 aa  667    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  35.78 
 
 		 5149 aa  664    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  35.83 
 
 		 4342 aa  668    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  34.88 
 
 		 4960 aa  701    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  37.2 
 
 		 4318 aa  649    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  35.24 
 
 		 4960 aa  696    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5619  amino acid adenylation domain-containing protein  34.1 
 
 		 1518 aa  698    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2875  linear gramicidin synthetase subunit C  34.1 
 
 		 1518 aa  695    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  38.42 
 
 		 3432 aa  632  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1874  amino acid adenylation domain-containing protein  33.46 
 
 		 1553 aa  632  1e-179  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  35.82 
 
 		 3404 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  35.62 
 
 		 2845 aa  625  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4220  non-ribosomal peptide synthetase  34.5 
 
 		 2628 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.663079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5189  amino acid adenylation domain protein  34.35 
 
 		 6202 aa  615  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018726 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25560  Non-ribosomal peptide synthase, PvdD-like protein  35.4 
 
 		 2878 aa  612  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  33.58 
 
 		 4037 aa  605  1.0000000000000001e-171  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2095  amino acid adenylation domain-containing protein  29.53 
 
 		 3395 aa  601  1e-170  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.800691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1858  amino acid adenylation domain-containing protein  33.16 
 
 		 1528 aa  598  1e-169  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1782  amino acid adenylation domain-containing protein  27.72 
 
 		 1476 aa  596  1e-169  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  38.19 
 
 		 6176 aa  598  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  37.9 
 
 		 5467 aa  593  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  36.61 
 
 		 5230 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4085  amino acid adenylation domain-containing protein  34.49 
 
 		 2606 aa  588  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1784  amino acid adenylation domain-containing protein  31.68 
 
 		 4080 aa  589  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  34.47 
 
 		 3018 aa  588  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0194792 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  35.11 
 
 		 2883 aa  586  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2574  amino acid adenylation domain-containing protein  33.2 
 
 		 6404 aa  585  1.0000000000000001e-165  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  33.77 
 
 		 2875 aa  572  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  38.19 
 
 		 2626 aa  563  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1972  amino acid adenylation domain-containing protein  36.13 
 
 		 3018 aa  557  1e-157  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812164 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7298  peptide synthetase  32.95 
 
 		 2573 aa  553  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  38.7 
 
 		 3231 aa  550  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0965  amino acid adenylation domain protein  27.45 
 
 		 1506 aa  552  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1886  amino acid adenylation domain protein  33.14 
 
 		 3710 aa  544  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1716  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  29.67 
 
 		 3044 aa  542  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  34.38 
 
 		 2614 aa  538  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  37.1 
 
 		 2651 aa  538  1e-151  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2329  amino acid adenylation domain protein  28.69 
 
 		 2752 aa  530  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1861  amino acid adenylation domain-containing protein  36.72 
 
 		 2883 aa  531  1e-149  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2148  pyoverdine sidechain peptide synthetase II, D-Asp-L-Thr component  31.35 
 
 		 2625 aa  528  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307821  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1717  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  30.09 
 
 		 2295 aa  524  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4307  amino acid adenylation domain protein  34.44 
 
 		 3247 aa  523  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.39871 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1859  amino acid adenylation domain-containing protein  35.11 
 
 		 2596 aa  516  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2450  amino acid adenylation  36.56 
 
 		 4290 aa  513  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6557  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  32.05 
 
 		 2320 aa  512  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000475071 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  29.78 
 
 		 2457 aa  511  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  36.67 
 
 		 3235 aa  506  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1958  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  31.69 
 
 		 2666 aa  506  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.815513 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18400  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  33.87 
 
 		 5750 aa  504  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4309  amino acid adenylation domain protein  35.76 
 
 		 2577 aa  503  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.867052 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  33.09 
 
 		 7310 aa  502  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3701  non-ribosomal peptide synthase  35.51 
 
 		 3962 aa  498  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1715  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  27.03 
 
 		 2543 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6558  non-ribosomal peptide synthase  37.67 
 
 		 4106 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138815 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2390  amino acid adenylation domain protein  26.63 
 
 		 1490 aa  491  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.215425  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  33.31 
 
 		 6889 aa  489  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1956  non-ribosomal peptide synthetase, putative  34.48 
 
 		 2967 aa  486  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2522  non-ribosomal peptide synthase  34.41 
 
 		 2979 aa  479  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.207691  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4039  amino acid adenylation domain-containing protein  35 
 
 		 3224 aa  473  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2663  nonribosomal peptide synthetase  34.08 
 
 		 2979 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2575  non-ribosomal peptide synthase  34.32 
 
 		 2979 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>