More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5189 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001302  ANIA_07884  nonribosomal peptide synthase, putative (JCVI)  26.35 
 
 
7214 aa  748    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.729291  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2090  amino acid adenylation domain-containing protein  31.07 
 
 
1568 aa  668    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02545  nonribosomal peptide synthase, putative (Eurofung)  24.71 
 
 
6919 aa  700    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.668891  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  34.51 
 
 
3470 aa  706    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4220  non-ribosomal peptide synthetase  34.61 
 
 
2628 aa  1351    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.663079 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  34.7 
 
 
3231 aa  1361    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  34.85 
 
 
4317 aa  1363    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  34.61 
 
 
5953 aa  726    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  34.89 
 
 
6889 aa  755    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  40.37 
 
 
2385 aa  771    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  34.93 
 
 
4336 aa  1400    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2148  pyoverdine sidechain peptide synthetase II, D-Asp-L-Thr component  35.02 
 
 
2625 aa  1411    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307821  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  36.71 
 
 
2151 aa  814    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  36.24 
 
 
2875 aa  1512    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  41.81 
 
 
5929 aa  794    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2095  amino acid adenylation domain-containing protein  35.8 
 
 
3395 aa  1609    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.800691  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  34.25 
 
 
3432 aa  687    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  39.26 
 
 
4531 aa  721    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  41.21 
 
 
2385 aa  782    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  40.75 
 
 
2385 aa  785    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1715  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  29.53 
 
 
2543 aa  1147    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1716  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  29.9 
 
 
3044 aa  1190    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1717  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  29.52 
 
 
2295 aa  950    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  40.84 
 
 
2385 aa  778    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  35.8 
 
 
3328 aa  653    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  33.67 
 
 
3021 aa  659    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  33.98 
 
 
3235 aa  1280    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  34.75 
 
 
4336 aa  1394    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1958  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  35.11 
 
 
2666 aa  1379    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.815513 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  37.62 
 
 
2154 aa  820    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  36.28 
 
 
2883 aa  1507    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  40.96 
 
 
5926 aa  783    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  36.63 
 
 
9498 aa  765    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  34.88 
 
 
2370 aa  774    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  33.99 
 
 
5328 aa  1454    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  33.5 
 
 
13537 aa  710    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  35.92 
 
 
6676 aa  781    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  28.47 
 
 
3629 aa  916    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  37.4 
 
 
2867 aa  846    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  30.87 
 
 
2791 aa  643    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  36.98 
 
 
1142 aa  743    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  35.11 
 
 
3308 aa  817    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  37.52 
 
 
3498 aa  1302    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  37.31 
 
 
2033 aa  1341    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3701  non-ribosomal peptide synthase  31.89 
 
 
3962 aa  1239    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  34.11 
 
 
5467 aa  2234    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2097  amino acid adenylation domain-containing protein  31.12 
 
 
1992 aa  830    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.164393  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2086  putative siderophore related no-ribosomal peptide synthase  31.19 
 
 
3287 aa  1077    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  38.39 
 
 
3348 aa  702    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2663  nonribosomal peptide synthetase  31.37 
 
 
2979 aa  1062    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  36.54 
 
 
6072 aa  840    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  38.22 
 
 
4572 aa  804    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  38.3 
 
 
3291 aa  697    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  35.76 
 
 
5654 aa  3229    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  35.1 
 
 
4502 aa  1592    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1849  amino acid adenylation  39.08 
 
 
1383 aa  727    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  32.89 
 
 
4882 aa  682    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  33.36 
 
 
3002 aa  654    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  35.14 
 
 
4317 aa  1383    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  34.93 
 
 
4332 aa  1444    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4786  non-ribosomal peptide synthase  31.54 
 
 
3219 aa  1092    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303001  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  41.21 
 
 
2385 aa  782    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  35.59 
 
 
4037 aa  1446    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  35.9 
 
 
5230 aa  2219    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  33.23 
 
 
3291 aa  746    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1956  non-ribosomal peptide synthetase, putative  30.76 
 
 
2967 aa  1089    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2364  peptide synthetase, putative  28.16 
 
 
3650 aa  851    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2418  peptide synthetase-like protein  30.81 
 
 
3296 aa  1067    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11449  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2450  amino acid adenylation  37.1 
 
 
4290 aa  911    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  39.39 
 
 
4489 aa  701    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2460  amino acid adenylation  33.78 
 
 
2605 aa  696    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.441641  normal  0.494441 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2461  amino acid adenylation  31.98 
 
 
4606 aa  1869    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.782467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1088  hypothetical protein  36.31 
 
 
2187 aa  657    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  37.76 
 
 
8646 aa  694    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0525  non-ribosomal peptide synthase  31.21 
 
 
3180 aa  1141    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  30.2 
 
 
2457 aa  647    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1160  amino acid adenylation  31.45 
 
 
3231 aa  1103    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1537  amino acid adenylation domain-containing protein  31.65 
 
 
3227 aa  1087    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  34.77 
 
 
3176 aa  1107    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  31.05 
 
 
3018 aa  1305    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0194792 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  33.76 
 
 
4383 aa  704    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  35.41 
 
 
4342 aa  1447    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  35.8 
 
 
5149 aa  1580    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  33.55 
 
 
2189 aa  657    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  36.99 
 
 
2448 aa  835    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1640  amino acid adenylation domain-containing protein  31.45 
 
 
3231 aa  1103    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2093  amino acid adenylation domain-containing protein  32.13 
 
 
2410 aa  655    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  31.94 
 
 
2138 aa  651    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  34.1 
 
 
2651 aa  1274    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1625  putative non-ribosomal peptide synthetase  31.22 
 
 
3297 aa  1080    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0842979  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  35.8 
 
 
3352 aa  653    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0288  putative non-ribosomal peptide synthetase  31.22 
 
 
3294 aa  1080    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  36.42 
 
 
1833 aa  662    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1927  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaJ  31.03 
 
 
3290 aa  1070    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0873  putative non-ribosomal peptide synthetase  31.22 
 
 
3294 aa  1080    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2522  non-ribosomal peptide synthase  31.45 
 
 
2979 aa  1070    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.207691  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  33.15 
 
 
6006 aa  660    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1942  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaJ  31.08 
 
 
3290 aa  1071    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  38.17 
 
 
4468 aa  795    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2575  non-ribosomal peptide synthase  31.37 
 
 
2979 aa  1051    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>