More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2390 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4220  non-ribosomal peptide synthetase  27.88 
 
 
2628 aa  658    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.663079 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  28.77 
 
 
4317 aa  678    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  29.17 
 
 
4336 aa  722    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  28.94 
 
 
4318 aa  719    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  30.39 
 
 
3942 aa  746    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  30.82 
 
 
5213 aa  721    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  30.6 
 
 
4747 aa  743    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2329  amino acid adenylation domain protein  29 
 
 
2752 aa  645    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1715  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  31.15 
 
 
2543 aa  677    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1972  amino acid adenylation domain-containing protein  28.69 
 
 
3018 aa  652    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.812164 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  28.76 
 
 
3404 aa  681    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0024  linear gramicidin synthetase subunit D  29.54 
 
 
3374 aa  705    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  29.71 
 
 
4336 aa  723    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  28.72 
 
 
4317 aa  679    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  31.89 
 
 
4960 aa  736    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1858  amino acid adenylation domain-containing protein  30.54 
 
 
1528 aa  705    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  29.29 
 
 
4342 aa  726    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2461  linear gramicidin synthetase subunit C  34.91 
 
 
1518 aa  797    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1886  amino acid adenylation domain protein  28.76 
 
 
3710 aa  648    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  31.11 
 
 
2571 aa  696    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  31.46 
 
 
3308 aa  641    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  33.74 
 
 
3498 aa  868    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  31.52 
 
 
2033 aa  817    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  29.4 
 
 
4317 aa  714    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5753  amino acid adenylation domain protein  32.25 
 
 
1525 aa  690    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  32.55 
 
 
3086 aa  777    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  32.45 
 
 
1556 aa  795    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  28.61 
 
 
2845 aa  662    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25560  Non-ribosomal peptide synthase, PvdD-like protein  30.48 
 
 
2878 aa  730    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3029  amino acid adenylation domain protein  32.1 
 
 
1533 aa  721    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  29.51 
 
 
5654 aa  682    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  30.34 
 
 
4502 aa  756    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4085  amino acid adenylation domain-containing protein  29.39 
 
 
2606 aa  657    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3092  amino acid adenylation domain protein  32.32 
 
 
1533 aa  739    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2390  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 
1490 aa  3056    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.215425  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  28.74 
 
 
3432 aa  736    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  29.61 
 
 
4332 aa  722    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0965  amino acid adenylation domain protein  50.83 
 
 
1506 aa  1519    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  29.71 
 
 
4037 aa  678    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0982  amino acid adenylation domain protein  32.11 
 
 
2006 aa  760    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2097  amino acid adenylation domain-containing protein  31.18 
 
 
1992 aa  684    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.164393  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  29.07 
 
 
4317 aa  681    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  30.61 
 
 
4991 aa  705    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  32.55 
 
 
3086 aa  776    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1875  amino acid adenylation domain-containing protein  30.42 
 
 
1990 aa  672    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2875  linear gramicidin synthetase subunit C  34.21 
 
 
1518 aa  775    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  31.04 
 
 
2571 aa  694    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2095  amino acid adenylation domain-containing protein  31.48 
 
 
3395 aa  713    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.800691  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  28.54 
 
 
3176 aa  652    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5751  amino acid adenylation domain protein  32.05 
 
 
1578 aa  763    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  32.02 
 
 
2164 aa  805    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  30.23 
 
 
4136 aa  717    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  29.51 
 
 
4342 aa  736    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  30.32 
 
 
5149 aa  707    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  31.98 
 
 
4960 aa  732    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5619  amino acid adenylation domain-containing protein  34.14 
 
 
1518 aa  791    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1782  amino acid adenylation domain-containing protein  47.62 
 
 
1476 aa  1371    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  31.39 
 
 
4968 aa  725    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  29.37 
 
 
5328 aa  663    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  32.32 
 
 
1556 aa  787    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  27.98 
 
 
2883 aa  633  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1784  amino acid adenylation domain-containing protein  31.93 
 
 
4080 aa  635  1e-180  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  28.17 
 
 
2875 aa  630  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5189  amino acid adenylation domain protein  28.95 
 
 
6202 aa  626  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000018726 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1716  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  30.72 
 
 
3044 aa  628  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  27.65 
 
 
2626 aa  629  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  28.45 
 
 
2614 aa  626  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  30.45 
 
 
2581 aa  622  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7298  peptide synthetase  26.75 
 
 
2573 aa  619  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2148  pyoverdine sidechain peptide synthetase II, D-Asp-L-Thr component  28.55 
 
 
2625 aa  616  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307821  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  27.19 
 
 
3231 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1877  amino acid adenylation domain-containing protein  27.54 
 
 
1525 aa  615  9.999999999999999e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1874  amino acid adenylation domain-containing protein  28.92 
 
 
1553 aa  607  9.999999999999999e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4307  amino acid adenylation domain protein  27.46 
 
 
3247 aa  600  1e-170  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.39871 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  27.58 
 
 
9175 aa  597  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  28.43 
 
 
7712 aa  590  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6558  non-ribosomal peptide synthase  26.64 
 
 
4106 aa  591  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138815 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  30.92 
 
 
1550 aa  591  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  28.11 
 
 
3348 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2574  amino acid adenylation domain-containing protein  28.3 
 
 
6404 aa  585  1.0000000000000001e-165  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  28.28 
 
 
3291 aa  586  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  29.59 
 
 
6889 aa  582  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1646  putative peptide synthetase  28.36 
 
 
1483 aa  582  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2054  amino acid adenylation  28.06 
 
 
3102 aa  581  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  27.06 
 
 
2651 aa  580  1e-164  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1733  putative peptide synthetase  28.36 
 
 
1528 aa  582  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0618  putative peptide synthetase  28.36 
 
 
1483 aa  582  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.099304  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1938  putative peptide synthetase  28.36 
 
 
1520 aa  581  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  28.96 
 
 
2448 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  29.84 
 
 
5953 aa  575  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  28.54 
 
 
5230 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2384  amino acid adenylation domain protein  34.62 
 
 
2508 aa  571  1e-161  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  30.34 
 
 
7122 aa  570  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  30.42 
 
 
3695 aa  571  1e-161  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  28.38 
 
 
2867 aa  568  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  31.91 
 
 
6006 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  30.34 
 
 
3291 aa  566  1.0000000000000001e-159  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2381  amino acid adenylation domain protein  29.09 
 
 
4196 aa  563  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1958  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  27.56 
 
 
2666 aa  561  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.815513 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  28.19 
 
 
9498 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>