More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3362 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  33.59 
 
 		 3335 aa  706    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  28.25 
 
 		 3739 aa  643    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  35.59 
 
 		 1087 aa  640    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.3 
 
 		 2551 aa  693    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.28 
 
 		 1874 aa  649    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  41.86 
 
 		 1656 aa  660    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  35.25 
 
 		 1786 aa  890    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  39.1 
 
 		 1587 aa  651    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0189  polyketide synthase peptide synthetase fusion protein  37.32 
 
 		 3133 aa  823    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  34.34 
 
 		 2710 aa  792    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1211  polyketide synthase  37.01 
 
 		 3044 aa  1259    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.165811  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3362  amino acid adenylation  100 
 
 		 2943 aa  5801    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  30.73 
 
 		 3718 aa  1167    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  33.62 
 
 		 2679 aa  751    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  33.94 
 
 		 4478 aa  743    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  32.97 
 
 		 2176 aa  768    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  36.19 
 
 		 2684 aa  783    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  36.03 
 
 		 3099 aa  761    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3761  amino acid adenylation domain protein  32.32 
 
 		 2682 aa  696    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674004  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1677  non-ribosomal peptide synthase  37.17 
 
 		 3157 aa  816    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1595  non-ribosomal peptide synthase/polyketide synthase  37.23 
 
 		 3148 aa  818    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  44.2 
 
 		 3696 aa  635  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  44.09 
 
 		 3693 aa  630  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  44.09 
 
 		 3693 aa  630  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  44.36 
 
 		 3676 aa  629  1e-178  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  43.98 
 
 		 3702 aa  629  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.82 
 
 		 1559 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  38.82 
 
 		 1559 aa  625  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  41.88 
 
 		 1337 aa  624  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  43.54 
 
 		 3679 aa  617  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  38.26 
 
 		 1354 aa  611  1e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  41.95 
 
 		 2477 aa  608  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4220  non-ribosomal peptide synthetase  34.03 
 
 		 2628 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.663079 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  39.33 
 
 		 2762 aa  606  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.13 
 
 		 1349 aa  605  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  39.02 
 
 		 1349 aa  601  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  40.4 
 
 		 3337 aa  598  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.63 
 
 		 1372 aa  595  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  33.05 
 
 		 5213 aa  597  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  42.77 
 
 		 6889 aa  593  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  44.85 
 
 		 4151 aa  593  1e-167  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  34.65 
 
 		 3231 aa  593  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  30.08 
 
 		 2033 aa  585  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  42.62 
 
 		 3158 aa  585  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  41.34 
 
 		 5154 aa  587  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  43.12 
 
 		 2880 aa  584  1e-164  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4085  amino acid adenylation domain-containing protein  33.73 
 
 		 2606 aa  581  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  38.79 
 
 		 1402 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  31.85 
 
 		 2875 aa  572  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.61 
 
 		 1101 aa  571  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  35.8 
 
 		 2551 aa  569  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  40.2 
 
 		 3176 aa  570  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  41.86 
 
 		 3930 aa  567  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.71 
 
 		 5400 aa  567  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  43.11 
 
 		 3254 aa  566  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2148  pyoverdine sidechain peptide synthetase II, D-Asp-L-Thr component  32.2 
 
 		 2625 aa  561  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307821  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  28.05 
 
 		 3498 aa  564  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.73 
 
 		 7110 aa  563  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  41.58 
 
 		 4882 aa  563  1e-158  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  39.18 
 
 		 1144 aa  560  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  42 
 
 		 3427 aa  560  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  42.68 
 
 		 3463 aa  560  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  38.98 
 
 		 1653 aa  560  1e-157  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  38.4 
 
 		 2462 aa  555  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  32.03 
 
 		 2883 aa  556  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  43.22 
 
 		 3424 aa  555  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  40 
 
 		 3130 aa  555  1e-156  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  40.56 
 
 		 7279 aa  553  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  42.23 
 
 		 3645 aa  554  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  40.71 
 
 		 7210 aa  553  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  32.19 
 
 		 5328 aa  554  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  42.11 
 
 		 2498 aa  550  1e-154  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  40.77 
 
 		 3045 aa  548  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  36.75 
 
 		 3252 aa  548  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  42.29 
 
 		 4165 aa  550  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  37.05 
 
 		 1909 aa  550  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  41.31 
 
 		 3711 aa  546  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  41.88 
 
 		 2604 aa  546  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  42.63 
 
 		 1602 aa  545  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  31.03 
 
 		 4136 aa  546  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  42.08 
 
 		 2367 aa  545  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.32 
 
 		 1816 aa  545  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  39.8 
 
 		 1470 aa  545  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  41.49 
 
 		 2066 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  37.84 
 
 		 1424 aa  543  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  36.96 
 
 		 1646 aa  541  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1877  amino acid adenylation domain-containing protein  31.1 
 
 		 1525 aa  541  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  40.72 
 
 		 3449 aa  541  9.999999999999999e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  31.2 
 
 		 5149 aa  544  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  43.34 
 
 		 3670 aa  543  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.02 
 
 		 950 aa  541  9.999999999999999e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.33 
 
 		 3092 aa  544  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  32.02 
 
 		 4991 aa  539  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2008  amino acid adenylation domain-containing protein  39.75 
 
 		 4101 aa  539  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  34.39 
 
 		 3235 aa  539  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  39.03 
 
 		 1574 aa  534  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7299  polyketide synthetase  42.36 
 
 		 1466 aa  536  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5779  Beta-ketoacyl synthase  39.91 
 
 		 2047 aa  536  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  41.93 
 
 		 3033 aa  536  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3390  beta-ketoacyl synthase  39.13 
 
 		 1489 aa  537  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100261  normal  0.176956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>