More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2780 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  47.51 
 
 		 3493 aa  1769    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  48.88 
 
 		 7210 aa  1081    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  63.49 
 
 		 1584 aa  1709    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  68.25 
 
 		 3711 aa  1640    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  38.41 
 
 		 4183 aa  692    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  46.16 
 
 		 1593 aa  1064    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  49.6 
 
 		 2847 aa  789    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  44.6 
 
 		 2719 aa  754    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  48.99 
 
 		 2066 aa  779    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  44.26 
 
 		 3508 aa  852    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  32.52 
 
 		 4646 aa  934    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  50.05 
 
 		 7279 aa  2386    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  34.33 
 
 		 1559 aa  829    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  54.31 
 
 		 1789 aa  812    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  55.01 
 
 		 1602 aa  846    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3964  Beta-ketoacyl synthase  32.22 
 
 		 3089 aa  911    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 		 2551 aa  1058    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 		 1874 aa  686    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  40.24 
 
 		 1656 aa  672    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  47.21 
 
 		 1114 aa  737    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  40.81 
 
 		 1587 aa  676    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  47.64 
 
 		 1867 aa  765    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  49.32 
 
 		 5255 aa  964    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  34.83 
 
 		 1537 aa  660    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  50.74 
 
 		 1071 aa  781    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3963  Beta-ketoacyl synthase  31.03 
 
 		 3090 aa  941    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  45.96 
 
 		 4930 aa  848    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  42.5 
 
 		 3449 aa  1606    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  45.74 
 
 		 4607 aa  642    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  27.46 
 
 		 3099 aa  824    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  52.72 
 
 		 2107 aa  799    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  51.01 
 
 		 2376 aa  846    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  65.53 
 
 		 3463 aa  1506    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  44.16 
 
 		 2081 aa  1139    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  52.22 
 
 		 3355 aa  741    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  48.54 
 
 		 2020 aa  706    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  44.57 
 
 		 3930 aa  901    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  52.26 
 
 		 2966 aa  790    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.26 
 
 		 3874 aa  938    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  38.11 
 
 		 3645 aa  721    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  40.39 
 
 		 3693 aa  1461    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4356  KR domain protein  45.32 
 
 		 3400 aa  679    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  36.11 
 
 		 1520 aa  694    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.16 
 
 		 1559 aa  823    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  37.01 
 
 		 1580 aa  673    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  38.83 
 
 		 1087 aa  654    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.39 
 
 		 3092 aa  3081    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  49.49 
 
 		 4151 aa  1005    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  48.86 
 
 		 1820 aa  745    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  49.28 
 
 		 4575 aa  886    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  39.22 
 
 		 1354 aa  662    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  32.99 
 
 		 3093 aa  972    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  32.87 
 
 		 2762 aa  732    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 3033 aa  5896    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  48.76 
 
 		 3148 aa  955    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  51.56 
 
 		 2374 aa  862    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  46.89 
 
 		 5154 aa  1160    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  50.38 
 
 		 1143 aa  721    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  39.99 
 
 		 4478 aa  838    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  40.24 
 
 		 3176 aa  753    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  49.23 
 
 		 3158 aa  1897    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  40.39 
 
 		 3693 aa  1461    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.53 
 
 		 1816 aa  942    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  36.11 
 
 		 1520 aa  694    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  46.46 
 
 		 4882 aa  1010    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  37.01 
 
 		 1580 aa  673    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  39.43 
 
 		 2880 aa  802    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.81 
 
 		 1837 aa  801    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  42.05 
 
 		 3676 aa  858    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  39.46 
 
 		 3427 aa  735    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  40.35 
 
 		 3696 aa  1446    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  41.74 
 
 		 2024 aa  1000    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.46 
 
 		 7110 aa  1014    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3125  beta-ketoacyl synthase  36.82 
 
 		 1812 aa  656    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  35.35 
 
 		 1581 aa  644    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  51.66 
 
 		 3408 aa  910    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  51.37 
 
 		 2126 aa  778    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  48.23 
 
 		 1924 aa  686    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  48.28 
 
 		 3494 aa  962    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  53.41 
 
 		 2113 aa  862    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  42.63 
 
 		 1402 aa  669    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  55.78 
 
 		 2367 aa  844    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.27 
 
 		 5400 aa  1088    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  48.38 
 
 		 3254 aa  1299    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  47.93 
 
 		 6768 aa  1410    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  50.27 
 
 		 1548 aa  1164    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  40.35 
 
 		 3702 aa  1456    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  50.91 
 
 		 3670 aa  965    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  48.83 
 
 		 2846 aa  742    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  36.81 
 
 		 1580 aa  660    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  48.14 
 
 		 2090 aa  687    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  49.59 
 
 		 4080 aa  1060    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  39.27 
 
 		 4111 aa  767    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  46.01 
 
 		 1955 aa  1183    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  55.1 
 
 		 2060 aa  806    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  41.52 
 
 		 3679 aa  849    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  49.03 
 
 		 4840 aa  986    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  53.18 
 
 		 1831 aa  793    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  49.91 
 
 		 1601 aa  1266    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3392  acyl transferase domain-containing protein  36.03 
 
 		 1822 aa  644    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572453  normal  0.26547 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>