More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1172 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  42.47 
 
 
2225 aa  647    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  44.84 
 
 
3645 aa  704    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  41.32 
 
 
1966 aa  674    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  44.75 
 
 
1559 aa  808    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.66 
 
 
2551 aa  861    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.65 
 
 
1874 aa  838    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  48.84 
 
 
1656 aa  825    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  43.58 
 
 
1144 aa  724    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  46.97 
 
 
1587 aa  846    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  47.21 
 
 
2880 aa  758    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  42.48 
 
 
3130 aa  689    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  39.98 
 
 
3252 aa  657    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  100 
 
 
1372 aa  2810    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5779  Beta-ketoacyl synthase  43.06 
 
 
2047 aa  652    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  46.59 
 
 
3424 aa  738    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  43.17 
 
 
4165 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  45.15 
 
 
1087 aa  823    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  41.17 
 
 
1939 aa  675    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  44.36 
 
 
3693 aa  700    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  44.85 
 
 
2762 aa  774    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  44.57 
 
 
950 aa  695    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  42.1 
 
 
2333 aa  660    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  48.5 
 
 
3176 aa  765    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  41.18 
 
 
2551 aa  738    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  37.33 
 
 
1909 aa  686    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  43.12 
 
 
1354 aa  782    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  43.36 
 
 
1806 aa  660    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  42.49 
 
 
4080 aa  652    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  41.73 
 
 
2462 aa  702    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  45.71 
 
 
3099 aa  716    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  45.82 
 
 
4478 aa  756    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  44.02 
 
 
2230 aa  713    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  44.36 
 
 
3693 aa  700    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  43 
 
 
1955 aa  639    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  46.61 
 
 
3427 aa  737    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.65 
 
 
3092 aa  636    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  43.36 
 
 
3254 aa  642    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  44.11 
 
 
3676 aa  693    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  43.73 
 
 
2477 aa  680    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  44.42 
 
 
3696 aa  699    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  44.39 
 
 
2367 aa  645    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  43.05 
 
 
1805 aa  655    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.53 
 
 
1804 aa  664    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.61 
 
 
7110 aa  651    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.03 
 
 
1349 aa  815    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  45.43 
 
 
3337 aa  721    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.79 
 
 
1816 aa  638    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  45.47 
 
 
2136 aa  667    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  44.61 
 
 
2232 aa  728    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  36.09 
 
 
1349 aa  812    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  44.47 
 
 
3702 aa  701    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  46.67 
 
 
1337 aa  778    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  44.97 
 
 
1559 aa  810    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  43.9 
 
 
3679 aa  692    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  42.09 
 
 
1827 aa  640    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  42.68 
 
 
4151 aa  631  1e-179  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 
5400 aa  630  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  40.73 
 
 
2081 aa  630  1e-179  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.79 
 
 
1101 aa  631  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  41.54 
 
 
7210 aa  632  1e-179  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  43.19 
 
 
2604 aa  632  1e-179  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  42.89 
 
 
2113 aa  627  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  41.8 
 
 
5154 aa  626  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  42.3 
 
 
1548 aa  629  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.47 
 
 
1837 aa  621  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  41.56 
 
 
1602 aa  622  1e-176  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  41.68 
 
 
2890 aa  620  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  42.49 
 
 
7279 aa  622  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  41.64 
 
 
3033 aa  619  1e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2887  Beta-ketoacyl synthase  40.31 
 
 
1208 aa  617  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  39.68 
 
 
3101 aa  617  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  41.79 
 
 
1832 aa  617  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  41.51 
 
 
2126 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  41.59 
 
 
3463 aa  610  1e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  41.21 
 
 
2719 aa  612  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  42.94 
 
 
2374 aa  611  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  40.97 
 
 
3494 aa  612  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  40.78 
 
 
3158 aa  611  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  42.11 
 
 
6889 aa  608  9.999999999999999e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.41 
 
 
1909 aa  607  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  42.2 
 
 
1867 aa  609  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  43.93 
 
 
1537 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  41.64 
 
 
3045 aa  605  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  37.84 
 
 
3111 aa  603  1.0000000000000001e-171  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  40.86 
 
 
3449 aa  603  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3392  acyl transferase domain-containing protein  42.12 
 
 
1822 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572453  normal  0.26547 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  40.65 
 
 
1789 aa  602  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  40.86 
 
 
3930 aa  597  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  41.34 
 
 
5255 aa  598  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  40.93 
 
 
3711 aa  596  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  41.83 
 
 
1520 aa  598  1e-169  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  41.83 
 
 
1520 aa  598  1e-169  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2834  beta-ketoacyl synthase  43.42 
 
 
1190 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2878  beta-ketoacyl synthase  43.42 
 
 
1190 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.696765  normal  0.141108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3125  beta-ketoacyl synthase  41.69 
 
 
1812 aa  594  1e-168  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.11 
 
 
1822 aa  595  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  40.35 
 
 
4882 aa  595  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  40.15 
 
 
1831 aa  590  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  43.16 
 
 
3148 aa  590  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  40.32 
 
 
3493 aa  592  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>