More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11680 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  47.98 
 
 
1402 aa  828    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  55.12 
 
 
3033 aa  855    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11205  polyketide beta-ketoacyl synthase pks4  35.63 
 
 
2101 aa  674    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  50.1 
 
 
4080 aa  1154    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  52.06 
 
 
7210 aa  1202    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  51.28 
 
 
3463 aa  1140    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12947  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsC  33.84 
 
 
2188 aa  696    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  51.33 
 
 
3711 aa  1159    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  45.68 
 
 
3493 aa  860    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  35.87 
 
 
2462 aa  669    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.87 
 
 
1349 aa  687    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  44.2 
 
 
2719 aa  1132    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  42.59 
 
 
2066 aa  951    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  45.18 
 
 
2880 aa  638    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  48.91 
 
 
1114 aa  791    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5779  Beta-ketoacyl synthase  40.61 
 
 
2047 aa  652    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  51.05 
 
 
1593 aa  775    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  33.63 
 
 
1939 aa  674    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.92 
 
 
2551 aa  737    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.2 
 
 
1874 aa  793    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  43.05 
 
 
1656 aa  676    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  45.74 
 
 
1820 aa  973    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  41.56 
 
 
1587 aa  709    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  51.62 
 
 
3158 aa  979    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  41.54 
 
 
3176 aa  725    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  60.04 
 
 
3254 aa  956    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  53.34 
 
 
1071 aa  828    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  41.11 
 
 
1337 aa  667    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  46.33 
 
 
1924 aa  972    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  41.75 
 
 
3252 aa  640    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  49.41 
 
 
7279 aa  1049    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  48.39 
 
 
4840 aa  1070    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  56.31 
 
 
1548 aa  919    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  52.95 
 
 
1584 aa  832    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  54.32 
 
 
2376 aa  870    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  51.49 
 
 
2081 aa  830    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  48.01 
 
 
3670 aa  1018    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  56.6 
 
 
3148 aa  863    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.05 
 
 
5400 aa  1200    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  53.31 
 
 
1601 aa  820    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  54 
 
 
1955 aa  838    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.58 
 
 
1816 aa  1216    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  42.29 
 
 
3693 aa  764    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  100 
 
 
1602 aa  3147    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.72 
 
 
1559 aa  696    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  48.1 
 
 
3408 aa  1067    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  39.17 
 
 
2890 aa  649    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  37 
 
 
2085 aa  739    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  50.88 
 
 
1789 aa  1090    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.18 
 
 
1837 aa  1084    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  33.17 
 
 
2551 aa  666    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  46.02 
 
 
4607 aa  1099    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  42.23 
 
 
1354 aa  726    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  48.31 
 
 
2107 aa  1017    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  48.15 
 
 
3355 aa  982    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  47.92 
 
 
5154 aa  989    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  46.96 
 
 
4111 aa  967    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  43.09 
 
 
4478 aa  672    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.29 
 
 
3092 aa  968    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12954  multi-functional membrane-associated mycocerosic acid synthase mas  35.58 
 
 
2111 aa  716    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  42.29 
 
 
3693 aa  764    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11682  polyketide synthase pks9  50.23 
 
 
1017 aa  776    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.910189  normal  0.256718 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  50.04 
 
 
2966 aa  1005    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  47.71 
 
 
4575 aa  1078    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  56.16 
 
 
2374 aa  881    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  37 
 
 
2085 aa  739    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  49.69 
 
 
5255 aa  1082    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  42.66 
 
 
3676 aa  766    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  43.73 
 
 
2477 aa  649    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  41.63 
 
 
3696 aa  709    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12960  polyketide synthase pks1  58.95 
 
 
1616 aa  1183    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  36.24 
 
 
4183 aa  658    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  47.47 
 
 
2847 aa  963    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  37.85 
 
 
2232 aa  679    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  35.78 
 
 
2230 aa  659    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  46.28 
 
 
3508 aa  1011    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  53.38 
 
 
3494 aa  1190    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  40.8 
 
 
1087 aa  674    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  49.69 
 
 
2060 aa  1166    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  59.49 
 
 
4151 aa  1732    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  40.83 
 
 
1559 aa  694    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  36.77 
 
 
1349 aa  688    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  50 
 
 
2024 aa  785    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  49.74 
 
 
1143 aa  741    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  39.9 
 
 
3645 aa  668    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  41.97 
 
 
3702 aa  761    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  61.83 
 
 
2126 aa  1701    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.32 
 
 
3874 aa  1264    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.52 
 
 
7110 aa  1164    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  37.05 
 
 
2085 aa  738    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  47.52 
 
 
1831 aa  1036    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  44.27 
 
 
4930 aa  953    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4019  Acyl transferase  37.96 
 
 
5526 aa  659    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  39.91 
 
 
3449 aa  895    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  41.41 
 
 
3679 aa  751    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12961  polyketide synthase pks15  73.93 
 
 
496 aa  667    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.914056  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  49.85 
 
 
2113 aa  1058    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  43.67 
 
 
2846 aa  889    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  50.59 
 
 
6768 aa  1241    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  51.3 
 
 
2367 aa  1294    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>