More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7004 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4756  Acyl transferase  34.15 
 
 
2162 aa  652    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  100 
 
 
2846 aa  5567    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  46.55 
 
 
2374 aa  709    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  45.69 
 
 
1924 aa  1154    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  46.19 
 
 
2108 aa  1047    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  32.45 
 
 
1876 aa  646    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  47.73 
 
 
3033 aa  765    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  47.02 
 
 
4840 aa  1382    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  43.3 
 
 
1602 aa  882    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  49.73 
 
 
3158 aa  1012    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  45.21 
 
 
3508 aa  1348    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  39.84 
 
 
2719 aa  1157    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  39.35 
 
 
2066 aa  1028    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  51.89 
 
 
1820 aa  1560    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  33.26 
 
 
1823 aa  676    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  45.24 
 
 
3463 aa  1243    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  45.78 
 
 
1867 aa  1302    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  51.24 
 
 
1305 aa  822    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  46.58 
 
 
5255 aa  1301    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.78 
 
 
1909 aa  661    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.54 
 
 
1874 aa  860    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  49.15 
 
 
1101 aa  739    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3479  Acyl transferase  48.25 
 
 
1077 aa  694    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  38.88 
 
 
2890 aa  710    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.09 
 
 
2078 aa  879    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  42.89 
 
 
3449 aa  1261    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  44.9 
 
 
4111 aa  1079    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  39.28 
 
 
2230 aa  718    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  49.54 
 
 
3148 aa  703    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  48.08 
 
 
4151 aa  1047    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.55 
 
 
3874 aa  1254    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4951  Beta-ketoacyl synthase  33.08 
 
 
1835 aa  664    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780339  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.31 
 
 
1816 aa  1191    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  44.57 
 
 
2024 aa  678    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  44.74 
 
 
2081 aa  717    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  47.19 
 
 
2020 aa  993    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  36.91 
 
 
2333 aa  692    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  47.64 
 
 
1548 aa  680    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  43.69 
 
 
2367 aa  874    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  39.82 
 
 
2232 aa  747    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  48.3 
 
 
4607 aa  1014    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  36.59 
 
 
3693 aa  695    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  35.29 
 
 
1832 aa  747    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.98 
 
 
7110 aa  1386    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  44.74 
 
 
3930 aa  1376    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  45.21 
 
 
3408 aa  1169    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  45.68 
 
 
2090 aa  1228    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  47.57 
 
 
2126 aa  1056    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  32.65 
 
 
3101 aa  689    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11682  polyketide synthase pks9  42.76 
 
 
1017 aa  638    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.910189  normal  0.256718 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  43.12 
 
 
2847 aa  1439    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  48.03 
 
 
1831 aa  946    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  50.8 
 
 
4575 aa  982    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.1 
 
 
1822 aa  800    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  47.68 
 
 
1789 aa  957    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  41.31 
 
 
4930 aa  1113    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  51.3 
 
 
1143 aa  775    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  48.04 
 
 
1071 aa  644    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  42.37 
 
 
4183 aa  733    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  56.61 
 
 
1584 aa  911    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  47.27 
 
 
4080 aa  1622    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  45.76 
 
 
2376 aa  706    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  36.59 
 
 
3693 aa  695    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  45.52 
 
 
5154 aa  1250    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  31.68 
 
 
2462 aa  715    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.1 
 
 
1837 aa  983    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3478  Acyl transferase  47.23 
 
 
1573 aa  669    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  38.44 
 
 
3281 aa  923    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  42.57 
 
 
2107 aa  1020    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  46.58 
 
 
3494 aa  1327    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  36.54 
 
 
3676 aa  682    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  49.92 
 
 
6768 aa  1038    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  36.27 
 
 
3696 aa  679    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  42.97 
 
 
4882 aa  1228    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  34.71 
 
 
1805 aa  712    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  49.84 
 
 
1114 aa  806    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  52.66 
 
 
2966 aa  1036    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  32.73 
 
 
1828 aa  669    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  45.51 
 
 
7279 aa  1845    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  39.65 
 
 
2225 aa  664    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.73 
 
 
3092 aa  737    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  42.91 
 
 
2060 aa  793    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  52.78 
 
 
1601 aa  810    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  48.16 
 
 
3670 aa  1022    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  54.39 
 
 
3254 aa  813    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  47.92 
 
 
7210 aa  1440    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.37 
 
 
5400 aa  1250    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  36.52 
 
 
3702 aa  697    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  47.67 
 
 
1955 aa  711    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  42.34 
 
 
2113 aa  1044    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  29.93 
 
 
1804 aa  644    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0494  Acyl transferase  53.21 
 
 
2666 aa  1258    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  43.43 
 
 
2277 aa  1520    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  33.9 
 
 
3645 aa  712    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  43.72 
 
 
3493 aa  1208    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  45.53 
 
 
3711 aa  1244    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  51.73 
 
 
1593 aa  767    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  35.84 
 
 
3679 aa  663    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  48.31 
 
 
3355 aa  1252    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  32.97 
 
 
1939 aa  826    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>