More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7003 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  47.64 
 
 
7210 aa  1228    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  44.04 
 
 
2108 aa  941    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  47.25 
 
 
1820 aa  1228    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  50.81 
 
 
3033 aa  806    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  46.86 
 
 
1143 aa  691    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  49.73 
 
 
2376 aa  763    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  46.65 
 
 
3711 aa  1235    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  40.68 
 
 
3281 aa  900    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  53.38 
 
 
1548 aa  840    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  45.82 
 
 
3158 aa  833    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  41.16 
 
 
2719 aa  811    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  40.99 
 
 
2066 aa  1056    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  45.84 
 
 
2966 aa  888    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  43.7 
 
 
1402 aa  660    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  47.88 
 
 
1602 aa  1062    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  45.91 
 
 
4151 aa  1031    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.96 
 
 
5400 aa  1223    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 
2551 aa  681    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
1874 aa  726    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  41.65 
 
 
1656 aa  657    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  40.32 
 
 
2020 aa  742    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  41.65 
 
 
1587 aa  692    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  47.72 
 
 
1593 aa  686    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  47.47 
 
 
4111 aa  712    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  44.38 
 
 
2126 aa  949    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  43.6 
 
 
2090 aa  773    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  46.2 
 
 
4840 aa  1156    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  51.03 
 
 
1101 aa  855    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  38.21 
 
 
1349 aa  675    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  42.16 
 
 
1924 aa  958    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  52.1 
 
 
2374 aa  793    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.59 
 
 
3092 aa  908    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  50.37 
 
 
1126 aa  777    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  50.64 
 
 
2081 aa  825    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.95 
 
 
2078 aa  930    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  44.83 
 
 
2113 aa  1082    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  44.35 
 
 
2847 aa  1067    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  49.5 
 
 
4080 aa  1222    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  45.08 
 
 
3670 aa  1052    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  39.38 
 
 
3693 aa  698    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  41.81 
 
 
2277 aa  979    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  42.53 
 
 
3176 aa  718    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  46.97 
 
 
7279 aa  1130    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  45.46 
 
 
4882 aa  1133    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  46.7 
 
 
2060 aa  909    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  33.18 
 
 
2551 aa  656    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  40.81 
 
 
1354 aa  687    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
1837 aa  3613    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  42.22 
 
 
1831 aa  1007    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  43.55 
 
 
3408 aa  1024    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  45.14 
 
 
4478 aa  670    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.21 
 
 
1816 aa  1221    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  37.1 
 
 
2232 aa  645    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  39.38 
 
 
3693 aa  698    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  41.93 
 
 
3508 aa  1029    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  44.22 
 
 
1114 aa  700    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  43.65 
 
 
1789 aa  1066    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  40.39 
 
 
3676 aa  688    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  44 
 
 
1305 aa  702    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  38.99 
 
 
3696 aa  671    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  51.32 
 
 
3254 aa  827    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.21 
 
 
1349 aa  676    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  44.36 
 
 
3355 aa  1005    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  49.92 
 
 
2367 aa  968    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  37.5 
 
 
2230 aa  637    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  50.72 
 
 
1071 aa  804    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  46.01 
 
 
4575 aa  1009    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  46.48 
 
 
3463 aa  1209    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  47.89 
 
 
1584 aa  747    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.61 
 
 
3874 aa  954    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  52.13 
 
 
3148 aa  761    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  44.61 
 
 
3493 aa  801    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  41.32 
 
 
3930 aa  1058    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  45.15 
 
 
6768 aa  904    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  39.45 
 
 
3702 aa  697    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  43.27 
 
 
2846 aa  994    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  47.38 
 
 
3494 aa  1178    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  39.14 
 
 
3449 aa  955    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  41.12 
 
 
4930 aa  925    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  50.05 
 
 
2024 aa  779    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  46.38 
 
 
1601 aa  701    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  45.48 
 
 
2107 aa  1032    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  39.74 
 
 
3679 aa  685    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  52.06 
 
 
1955 aa  812    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  40.04 
 
 
4607 aa  753    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.05 
 
 
7110 aa  1214    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  42.82 
 
 
5154 aa  988    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  43.83 
 
 
5255 aa  1088    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3480  Mycocerosate synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  38.06 
 
 
4264 aa  774    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  42.58 
 
 
1372 aa  629  1e-178  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  36.84 
 
 
1087 aa  629  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  41.13 
 
 
3130 aa  625  1e-177  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  38.69 
 
 
4183 aa  622  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3478  Acyl transferase  42.94 
 
 
1573 aa  614  9.999999999999999e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.23 
 
 
1559 aa  615  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  39.58 
 
 
3645 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  40.2 
 
 
1337 aa  615  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  37.41 
 
 
1559 aa  612  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  36.41 
 
 
2225 aa  606  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  35.95 
 
 
1939 aa  603  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>