More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3154 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  45.58 
 
 
1402 aa  652    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  58.39 
 
 
1548 aa  897    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  51.65 
 
 
3463 aa  1105    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  48.46 
 
 
7210 aa  1046    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  40.37 
 
 
4111 aa  776    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.56 
 
 
7110 aa  1047    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  46.89 
 
 
2024 aa  655    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  54.34 
 
 
2376 aa  791    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  46.42 
 
 
3508 aa  966    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  48.25 
 
 
6768 aa  1373    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  49.53 
 
 
1602 aa  1204    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  42.99 
 
 
2719 aa  1304    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  42.09 
 
 
2066 aa  839    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  49.57 
 
 
1584 aa  731    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  49.1 
 
 
1955 aa  701    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  42.9 
 
 
2846 aa  811    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  44.25 
 
 
1924 aa  842    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.97 
 
 
2551 aa  638    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.28 
 
 
1874 aa  687    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  42.35 
 
 
1867 aa  872    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  52.16 
 
 
1071 aa  738    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  46.51 
 
 
1789 aa  911    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  43.92 
 
 
4930 aa  861    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  40.07 
 
 
3281 aa  747    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  49.07 
 
 
3494 aa  1033    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12960  polyketide synthase pks1  46 
 
 
1616 aa  1055    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  60.74 
 
 
2367 aa  2038    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  50.76 
 
 
3711 aa  1102    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  45.93 
 
 
2126 aa  1341    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  47.68 
 
 
2081 aa  713    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.38 
 
 
1837 aa  927    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  53.21 
 
 
1101 aa  853    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  42.91 
 
 
1820 aa  831    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  44.53 
 
 
2277 aa  887    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12947  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsC  31.6 
 
 
2188 aa  721    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4019  Acyl transferase  36.88 
 
 
5526 aa  684    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  35.62 
 
 
3693 aa  899    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  42.66 
 
 
3493 aa  806    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  47.99 
 
 
3670 aa  929    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.47 
 
 
5400 aa  1111    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  43.01 
 
 
2090 aa  798    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  44.11 
 
 
2020 aa  1289    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  35.25 
 
 
2604 aa  829    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  45.69 
 
 
2108 aa  1457    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  40.79 
 
 
1354 aa  639    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  75.81 
 
 
7279 aa  1158    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  45 
 
 
1831 aa  926    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  48.63 
 
 
5154 aa  868    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  49.96 
 
 
4080 aa  1018    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  45.91 
 
 
3408 aa  921    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  45.63 
 
 
2107 aa  838    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  35.62 
 
 
3693 aa  899    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  47.83 
 
 
3158 aa  830    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  48.66 
 
 
2966 aa  884    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  51.45 
 
 
3148 aa  729    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  39.11 
 
 
3449 aa  726    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  50.92 
 
 
1126 aa  731    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.27 
 
 
2078 aa  820    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  45.43 
 
 
5255 aa  929    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  46.25 
 
 
1305 aa  652    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.04 
 
 
3874 aa  1486    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  54.66 
 
 
2374 aa  785    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  44.71 
 
 
4607 aa  1265    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
2060 aa  4007    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  37.32 
 
 
3176 aa  973    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  45.7 
 
 
4882 aa  949    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  55.77 
 
 
3033 aa  836    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.79 
 
 
3092 aa  850    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.07 
 
 
1816 aa  1098    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  55.25 
 
 
3254 aa  805    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  48.41 
 
 
4151 aa  1554    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  35.76 
 
 
3702 aa  901    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  45.3 
 
 
3355 aa  874    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  48.31 
 
 
1593 aa  640    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  43.84 
 
 
3930 aa  1337    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  46.42 
 
 
4840 aa  937    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  48.25 
 
 
1601 aa  681    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  35.83 
 
 
3679 aa  890    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  47.32 
 
 
4575 aa  1260    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  44.84 
 
 
2847 aa  840    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  47.14 
 
 
2113 aa  941    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  35.95 
 
 
1349 aa  631  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  44.82 
 
 
1114 aa  632  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.95 
 
 
1349 aa  630  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  40.85 
 
 
1587 aa  627  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  38.44 
 
 
2230 aa  623  1e-176  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  33.58 
 
 
2551 aa  622  1e-176  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  39.17 
 
 
1087 aa  620  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  38.6 
 
 
1559 aa  619  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  42.95 
 
 
1656 aa  612  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  35.1 
 
 
2462 aa  610  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.04 
 
 
1559 aa  612  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  45.7 
 
 
1143 aa  607  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  40.71 
 
 
1337 aa  602  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  36.04 
 
 
1939 aa  601  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3480  Mycocerosate synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  44.82 
 
 
4264 aa  597  1e-169  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  39.57 
 
 
3676 aa  598  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  39.51 
 
 
2762 aa  597  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11682  polyketide synthase pks9  45.16 
 
 
1017 aa  592  1e-167  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.910189  normal  0.256718 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  42.97 
 
 
4478 aa  587  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>