More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2981 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  55.84 
 
 		 2024 aa  1970    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  48.54 
 
 		 2376 aa  860    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  46.2 
 
 		 2847 aa  753    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  38.83 
 
 		 1349 aa  667    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  47.88 
 
 		 3355 aa  692    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  42.14 
 
 		 2719 aa  719    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  49.2 
 
 		 2066 aa  800    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  52.67 
 
 		 4840 aa  914    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  42.67 
 
 		 3449 aa  1021    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  48.83 
 
 		 2126 aa  763    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  52.92 
 
 		 4080 aa  951    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  48.87 
 
 		 3711 aa  846    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  43.56 
 
 		 6768 aa  1028    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.85 
 
 		 2551 aa  714    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.54 
 
 		 1874 aa  665    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  39.9 
 
 		 1656 aa  714    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  44.02 
 
 		 3281 aa  664    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  41.5 
 
 		 1587 aa  703    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  37.63 
 
 		 1087 aa  687    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  47.45 
 
 		 4575 aa  743    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  41.34 
 
 		 1601 aa  981    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  47.96 
 
 		 2078 aa  728    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  46.99 
 
 		 5255 aa  780    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  45.99 
 
 		 4607 aa  678    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  51.53 
 
 		 1126 aa  813    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.13 
 
 		 5400 aa  940    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  53.25 
 
 		 2113 aa  837    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  46.59 
 
 		 1789 aa  732    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  43.28 
 
 		 1402 aa  667    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.76 
 
 		 1816 aa  880    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 2081 aa  4082    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  47.01 
 
 		 1831 aa  717    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  36.43 
 
 		 3427 aa  755    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.95 
 
 		 1349 aa  668    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  32.18 
 
 		 1559 aa  806    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  41.32 
 
 		 5154 aa  1031    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  52.6 
 
 		 2367 aa  813    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  36.8 
 
 		 3693 aa  840    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  44.99 
 
 		 7279 aa  1111    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 		 3092 aa  1164    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  48.28 
 
 		 3670 aa  813    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  44.46 
 
 		 3176 aa  682    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  44.26 
 
 		 1114 aa  704    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  50.29 
 
 		 3463 aa  853    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  53.16 
 
 		 1101 aa  911    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  41.34 
 
 		 3493 aa  943    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  45.76 
 
 		 2108 aa  712    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  38.72 
 
 		 1354 aa  686    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  52.51 
 
 		 7210 aa  960    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  46.61 
 
 		 1924 aa  654    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  51.81 
 
 		 3494 aa  812    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  43.47 
 
 		 2020 aa  650    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  41.51 
 
 		 4478 aa  696    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  41.25 
 
 		 3508 aa  711    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  45.25 
 
 		 1820 aa  674    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  36.8 
 
 		 3693 aa  840    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  47.83 
 
 		 1593 aa  697    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.82 
 
 		 7110 aa  929    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  48.4 
 
 		 2966 aa  755    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  32.11 
 
 		 2762 aa  812    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  43.03 
 
 		 1584 aa  994    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  48.07 
 
 		 2060 aa  701    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  36.54 
 
 		 3676 aa  813    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  42.62 
 
 		 3696 aa  707    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  43.22 
 
 		 3930 aa  782    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.05 
 
 		 1837 aa  824    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  45.23 
 
 		 1867 aa  732    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3480  Mycocerosate synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  40.65 
 
 		 4264 aa  682    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  39.68 
 
 		 1337 aa  645    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  61.47 
 
 		 1955 aa  2264    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  46.08 
 
 		 1143 aa  683    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  46.46 
 
 		 4111 aa  825    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  44.09 
 
 		 2277 aa  749    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  46.35 
 
 		 2090 aa  702    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  50.42 
 
 		 2374 aa  866    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  55.05 
 
 		 1071 aa  865    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  49.37 
 
 		 3148 aa  796    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  51.17 
 
 		 1602 aa  817    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  48.58 
 
 		 3158 aa  1327    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  36.57 
 
 		 3702 aa  840    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.32 
 
 		 3874 aa  790    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  44.09 
 
 		 1305 aa  714    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  45.35 
 
 		 3408 aa  789    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  44.46 
 
 		 3033 aa  1105    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  47.22 
 
 		 1548 aa  1131    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  52.34 
 
 		 2107 aa  764    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  50.94 
 
 		 4151 aa  899    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  47.09 
 
 		 3254 aa  1254    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  42.04 
 
 		 3679 aa  709    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  44.87 
 
 		 4930 aa  710    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  48.4 
 
 		 4882 aa  879    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  32.42 
 
 		 1559 aa  816    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  44.63 
 
 		 2846 aa  717    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.77 
 
 		 1372 aa  636  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5779  Beta-ketoacyl synthase  42.33 
 
 		 2047 aa  631  1e-179  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4356  KR domain protein  41.9 
 
 		 3400 aa  632  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  33.09 
 
 		 1537 aa  623  1e-177  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  39.38 
 
 		 3645 aa  623  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  36.96 
 
 		 2551 aa  616  9.999999999999999e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  42.2 
 
 		 2477 aa  617  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>