More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1247 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  39.54 
 
 		 2220 aa  664    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  57.88 
 
 		 1584 aa  957    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  55.66 
 
 		 5154 aa  2780    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  35.9 
 
 		 1832 aa  828    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  41.54 
 
 		 4882 aa  1853    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  40.21 
 
 		 3101 aa  676    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  50.93 
 
 		 4151 aa  1391    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  46.33 
 
 		 3493 aa  1501    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  46.25 
 
 		 2846 aa  1302    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4951  Beta-ketoacyl synthase  34.54 
 
 		 1835 aa  689    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  46.87 
 
 		 4930 aa  2748    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  50.4 
 
 		 3711 aa  2741    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  44.77 
 
 		 2719 aa  1088    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  41.08 
 
 		 2066 aa  1072    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  58.01 
 
 		 1601 aa  909    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  52.44 
 
 		 3158 aa  1343    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  72.44 
 
 		 1789 aa  2235    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  43.22 
 
 		 4111 aa  2025    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  46.59 
 
 		 3508 aa  2604    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  43.01 
 
 		 4840 aa  1528    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.95 
 
 		 2551 aa  659    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 		 1874 aa  720    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  39.69 
 
 		 1656 aa  675    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  36.29 
 
 		 1966 aa  667    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  41.69 
 
 		 1587 aa  671    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  51.77 
 
 		 3254 aa  1065    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  41.84 
 
 		 3176 aa  768    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  40.59 
 
 		 2890 aa  803    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  49.62 
 
 		 3033 aa  988    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  47.25 
 
 		 1820 aa  1313    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  47.4 
 
 		 1071 aa  687    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  52.5 
 
 		 1548 aa  768    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  58.94 
 
 		 1143 aa  939    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  32.1 
 
 		 1876 aa  674    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  40.51 
 
 		 2880 aa  772    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  51.12 
 
 		 7210 aa  4424    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  46.58 
 
 		 1955 aa  766    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  46.99 
 
 		 2081 aa  783    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  31.58 
 
 		 3111 aa  751    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  36.73 
 
 		 2333 aa  711    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  64.05 
 
 		 3494 aa  3927    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  50.43 
 
 		 1924 aa  1344    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  49.13 
 
 		 7279 aa  3428    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  53.08 
 
 		 6768 aa  1469    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  35.97 
 
 		 3693 aa  852    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  47.38 
 
 		 1867 aa  1436    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  37.14 
 
 		 4183 aa  915    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  41.6 
 
 		 2232 aa  748    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  38.46 
 
 		 2085 aa  647    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  54.89 
 
 		 3408 aa  2420    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  53.59 
 
 		 2966 aa  1950    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  47.61 
 
 		 2090 aa  1365    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  49.15 
 
 		 2374 aa  792    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.77 
 
 		 1837 aa  1015    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  75.47 
 
 		 1831 aa  2363    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  48.49 
 
 		 2367 aa  1015    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  53.14 
 
 		 2126 aa  1208    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  32.91 
 
 		 1939 aa  839    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  48.91 
 
 		 4080 aa  2090    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  46.39 
 
 		 2024 aa  733    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  39.74 
 
 		 4478 aa  803    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.77 
 
 		 1816 aa  1342    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  45.88 
 
 		 2107 aa  1146    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  35.97 
 
 		 3693 aa  852    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  39.46 
 
 		 2225 aa  655    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  42.55 
 
 		 3449 aa  1428    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  40.67 
 
 		 2230 aa  759    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  38.46 
 
 		 2085 aa  647    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  53.99 
 
 		 3355 aa  1930    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  37.63 
 
 		 3676 aa  827    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  44.48 
 
 		 4575 aa  1259    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  38.48 
 
 		 3696 aa  820    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  49.27 
 
 		 1602 aa  1067    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  40.11 
 
 		 1805 aa  679    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.11 
 
 		 1909 aa  652    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.49 
 
 		 3092 aa  963    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  50.7 
 
 		 4607 aa  1077    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  46.21 
 
 		 2113 aa  1181    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  39.67 
 
 		 1827 aa  662    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  52.46 
 
 		 3148 aa  806    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.68 
 
 		 3874 aa  1638    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  46.37 
 
 		 3670 aa  1360    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  43.69 
 
 		 2847 aa  1103    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  49.93 
 
 		 3463 aa  2714    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  38.8 
 
 		 3427 aa  668    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  35.89 
 
 		 3702 aa  848    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.71 
 
 		 1804 aa  671    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  47.47 
 
 		 2060 aa  898    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  38.46 
 
 		 2085 aa  647    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  59.6 
 
 		 1593 aa  878    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.57 
 
 		 7110 aa  4374    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.31 
 
 		 5400 aa  3852    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  54.13 
 
 		 1114 aa  900    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  37.99 
 
 		 3679 aa  837    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  42.71 
 
 		 2136 aa  672    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  49.19 
 
 		 2376 aa  783    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  38.92 
 
 		 1806 aa  645    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  43.87 
 
 		 3930 aa  1604    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  34.43 
 
 		 3645 aa  1396    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  33.83 
 
 		 1823 aa  660    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>