More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3179 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12954  multi-functional membrane-associated mycocerosic acid synthase mas  63 
 
 
2111 aa  2550    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  33.94 
 
 
1939 aa  716    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4756  Acyl transferase  42.52 
 
 
2162 aa  655    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.69 
 
 
1867 aa  675    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  40.28 
 
 
3158 aa  640    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  37.55 
 
 
2890 aa  642    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  40.55 
 
 
4930 aa  642    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0383  Beta-ketoacyl synthase  33.43 
 
 
3080 aa  903    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.658279 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  40.56 
 
 
1806 aa  845    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  39.99 
 
 
1827 aa  837    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  38.43 
 
 
2108 aa  646    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  39.97 
 
 
7279 aa  650    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  35.75 
 
 
2719 aa  991    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  37 
 
 
2225 aa  1125    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  34.92 
 
 
3176 aa  936    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3392  acyl transferase domain-containing protein  46.78 
 
 
1822 aa  674    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572453  normal  0.26547 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  36.93 
 
 
1832 aa  694    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.05 
 
 
7110 aa  664    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  33.3 
 
 
3930 aa  785    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
1874 aa  656    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4951  Beta-ketoacyl synthase  34.07 
 
 
1835 aa  645    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780339  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  34.94 
 
 
2020 aa  819    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  35.71 
 
 
3449 aa  675    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2029  Beta-ketoacyl synthase  43.76 
 
 
1263 aa  670    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0480562  normal  0.193313 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  36.87 
 
 
2333 aa  672    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  36.15 
 
 
3508 aa  691    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  36.82 
 
 
1602 aa  714    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  37.81 
 
 
2277 aa  644    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  37.71 
 
 
2126 aa  651    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0991  acyl transferase region  46.51 
 
 
1076 aa  714    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2690  beta-ketoacyl synthase  42.36 
 
 
1698 aa  654    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.588409  normal  0.25936 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  38.04 
 
 
2232 aa  1212    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  37.59 
 
 
3494 aa  645    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  35.89 
 
 
2230 aa  1108    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  44.31 
 
 
1537 aa  655    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  33.61 
 
 
3693 aa  920    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  46.25 
 
 
1520 aa  654    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2834  beta-ketoacyl synthase  46.31 
 
 
1190 aa  656    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  100 
 
 
2085 aa  4184    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3472  beta-ketoacyl synthase  42.14 
 
 
1704 aa  666    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12947  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsC  37.96 
 
 
2188 aa  1162    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  34.67 
 
 
2367 aa  822    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  35.53 
 
 
4183 aa  652    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  35.39 
 
 
6768 aa  822    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11205  polyketide beta-ketoacyl synthase pks4  67.43 
 
 
2101 aa  2704    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  39.13 
 
 
7210 aa  642    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.08 
 
 
1822 aa  699    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11560  polyketide synthase pks5  67.4 
 
 
2108 aa  2739    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  33.61 
 
 
3693 aa  920    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13859  polyketide synthase pks2  66.2 
 
 
2126 aa  2661    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  46.25 
 
 
1520 aa  654    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2878  beta-ketoacyl synthase  46.31 
 
 
1190 aa  656    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.696765  normal  0.141108 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  100 
 
 
2085 aa  4184    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3535  beta-ketoacyl synthase  42.14 
 
 
1704 aa  666    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  33.66 
 
 
3676 aa  911    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  35.49 
 
 
4607 aa  852    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  33.96 
 
 
3696 aa  871    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  43.37 
 
 
2220 aa  1511    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  43.09 
 
 
1805 aa  835    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3125  beta-ketoacyl synthase  46.54 
 
 
1812 aa  682    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  40.89 
 
 
1828 aa  637    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3852  beta-ketoacyl synthase  42.18 
 
 
1744 aa  666    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.534518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  39.54 
 
 
2966 aa  644    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  35.24 
 
 
1876 aa  647    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  42.05 
 
 
1823 aa  650    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  33.86 
 
 
1966 aa  661    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  33.84 
 
 
3702 aa  922    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  35.1 
 
 
2604 aa  907    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2865  beta-ketoacyl synthase  46.31 
 
 
1190 aa  655    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  99.71 
 
 
2085 aa  4170    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3485  beta-ketoacyl synthase  42.04 
 
 
1704 aa  661    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19651  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  34.19 
 
 
4151 aa  879    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  37.23 
 
 
2090 aa  645    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  34.18 
 
 
3679 aa  890    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  37.67 
 
 
1789 aa  634  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  32.49 
 
 
1804 aa  634  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  45.56 
 
 
1580 aa  628  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  45.56 
 
 
1580 aa  628  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8815  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  42.4 
 
 
2111 aa  627  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39915  normal  0.217366 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  45.28 
 
 
1577 aa  626  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  45.43 
 
 
1580 aa  624  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  45.96 
 
 
1581 aa  622  1e-176  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  34.3 
 
 
3101 aa  617  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  37.65 
 
 
5255 aa  617  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  36.93 
 
 
3408 aa  614  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4853  Acyl transferase  39.96 
 
 
1819 aa  616  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.24 
 
 
1816 aa  614  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  32.37 
 
 
3111 aa  611  1e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  38.03 
 
 
4080 aa  612  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  38.39 
 
 
1144 aa  610  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  42.08 
 
 
1114 aa  603  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  38.76 
 
 
1587 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  37.85 
 
 
1831 aa  605  1.0000000000000001e-171  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  31.09 
 
 
2551 aa  606  1.0000000000000001e-171  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  34.94 
 
 
3645 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  32.17 
 
 
2462 aa  602  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  33.89 
 
 
4882 aa  598  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  39.79 
 
 
1656 aa  600  1e-169  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  38.3 
 
 
2846 aa  600  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.75 
 
 
1305 aa  598  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>