More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3086 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  50.2 
 
 
2376 aa  832    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  43.27 
 
 
1584 aa  965    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.45 
 
 
1349 aa  667    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  35.04 
 
 
1577 aa  654    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  51.93 
 
 
2374 aa  855    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  50.34 
 
 
3670 aa  820    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  53.57 
 
 
1101 aa  894    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  49.23 
 
 
3158 aa  1330    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  42.99 
 
 
3493 aa  965    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  47.37 
 
 
2847 aa  749    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  48.51 
 
 
1548 aa  1164    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  43.41 
 
 
2719 aa  721    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  51.17 
 
 
2066 aa  810    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  40.89 
 
 
1337 aa  646    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  45.88 
 
 
3033 aa  1139    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  54.4 
 
 
3463 aa  905    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  40.07 
 
 
2462 aa  642    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.56 
 
 
5400 aa  935    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  46.96 
 
 
4607 aa  664    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  46.35 
 
 
1867 aa  707    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.29 
 
 
2551 aa  730    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.37 
 
 
1874 aa  683    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  41.87 
 
 
1656 aa  736    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  50.39 
 
 
4882 aa  879    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  42.13 
 
 
1587 aa  687    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  45.07 
 
 
4930 aa  710    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  36.92 
 
 
2880 aa  768    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  48.12 
 
 
4111 aa  786    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  54 
 
 
1602 aa  850    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.35 
 
 
3874 aa  818    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  47.14 
 
 
1831 aa  697    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  45.21 
 
 
2020 aa  653    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  43.7 
 
 
1372 aa  651    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  55.08 
 
 
2024 aa  1874    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  54.04 
 
 
7210 aa  976    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  54.57 
 
 
2367 aa  826    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3392  acyl transferase domain-containing protein  36.82 
 
 
1822 aa  650    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572453  normal  0.26547 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  34.27 
 
 
1537 aa  641    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  61.47 
 
 
2081 aa  2241    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  42.79 
 
 
3508 aa  696    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  37.4 
 
 
3427 aa  736    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  49.55 
 
 
2966 aa  735    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  47.67 
 
 
2846 aa  713    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  54.91 
 
 
4840 aa  939    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  47.72 
 
 
2078 aa  705    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  37.89 
 
 
3693 aa  839    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  47.26 
 
 
3408 aa  746    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  47.88 
 
 
2090 aa  687    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  51.27 
 
 
3148 aa  807    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  35.1 
 
 
1580 aa  659    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  48.18 
 
 
4575 aa  724    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  47.87 
 
 
5255 aa  767    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  57.17 
 
 
1071 aa  860    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  40.78 
 
 
3281 aa  855    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  45.26 
 
 
3930 aa  757    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  39.85 
 
 
1354 aa  711    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  41.7 
 
 
1402 aa  669    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  53.52 
 
 
2113 aa  794    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  46.64 
 
 
1789 aa  728    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  54.43 
 
 
3494 aa  838    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.68 
 
 
1837 aa  817    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  44.43 
 
 
4478 aa  717    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  43.75 
 
 
6768 aa  1010    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  43.12 
 
 
3449 aa  998    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  37.89 
 
 
3693 aa  839    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  45.3 
 
 
7279 aa  1108    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3480  Mycocerosate synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  39.74 
 
 
4264 aa  828    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.94 
 
 
7110 aa  940    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  35.1 
 
 
1580 aa  659    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  44.28 
 
 
1114 aa  674    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  44.36 
 
 
1305 aa  690    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  37.01 
 
 
3676 aa  813    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  46.18 
 
 
2277 aa  752    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  38.25 
 
 
3696 aa  818    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  46.29 
 
 
1143 aa  654    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  54.35 
 
 
4080 aa  946    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  46.38 
 
 
2108 aa  706    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  35.76 
 
 
1581 aa  678    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  53.08 
 
 
2107 aa  753    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  43.2 
 
 
5154 aa  1045    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.7 
 
 
3092 aa  1226    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  39.01 
 
 
1087 aa  669    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  49.46 
 
 
2060 aa  696    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  51.71 
 
 
3711 aa  894    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  33.06 
 
 
1559 aa  820    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  38.45 
 
 
1349 aa  665    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  47.61 
 
 
3355 aa  671    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  51.08 
 
 
4151 aa  901    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  46.12 
 
 
3176 aa  676    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  37.89 
 
 
3702 aa  838    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
1955 aa  3860    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.63 
 
 
1816 aa  848    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  34.58 
 
 
1580 aa  640    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  32.82 
 
 
1559 aa  814    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  54.06 
 
 
1126 aa  828    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  48.05 
 
 
3254 aa  1247    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  49.28 
 
 
2126 aa  755    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  32 
 
 
2762 aa  830    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  38.63 
 
 
3679 aa  814    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  45.3 
 
 
1820 aa  639    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.132445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>