| Gene Information Plasmid Coverage information Fosmid Coverage information Sequence |
Gene Information |
| Locus tag | Sare_1248 |
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| Symbol | |
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| ID | 5704873 |
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| Type | CDS |
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| Is gene spliced | No |
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| Is pseudo gene | No |
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| Organism name | Salinispora arenicola CNS-205 |
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| Kingdom | Bacteria |
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| Replicon accession | NC_009953 |
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| Strand | + |
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| Start bp | 1427057 |
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| End bp | 1432552 |
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| Gene Length | 5496 bp |
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| Protein Length | 1831 aa |
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| Translation table | 11 |
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| GC content | 70% |
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| IMG OID | 641270763 |
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| Product | Beta-ketoacyl synthase |
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| Protein accession | YP_001536144 |
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| Protein GI | 159036891 |
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| COG category | [Q] Secondary metabolites biosynthesis, transport and catabolism |
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| COG ID | [COG3321] Polyketide synthase modules and related proteins |
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| TIGRFAM ID | |
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Plasmid Coverage information |
| Num covering plasmid clones | 1 |
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| Plasmid unclonability p-value | 0.238508 |
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| Plasmid hitchhiking | No |
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| Plasmid clonability | normal |
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Fosmid Coverage information |
| Num covering fosmid clones | 4 |
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| Fosmid unclonability p-value | 0.00102719 |
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| Fosmid Hitchhiker | Yes |
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| Fosmid clonability | hitchhiker |
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Sequence |
| Gene sequence | GTGAGTGCGT CGTATGAGAA GGTCGTCGAG GCGCTGCGCA GGTCGGTGGC CGAGGCCGGT
GAGCTGAGGA AGCGTAACCG CCAGCTCCTC GGCGCCTCCC GAGAGCCGAT CGCCATCGTC
GGGATGGCCT GCCGACTGCC AGGTGGCGTA GCCGGGCCGG CGGACCTGTG GCGGCTGGTG
TCCGAAGGCC GGGACGCGGT GTCGGGCTTC CCGACGGATC GTGGCTGGGA CCTGGTGGGT
CTGTTCGATC CGGACCCCGA TCGTCCGGGT ACCTCGTATG TCAGCCAGGG CGGTTTCCTG
TCCGAGGCGG GGCTGTTTGA TGCGGGGTTT TTCGGGATTT CGCCGCGGGA GGCGTTGGCG
ATGGACCCGC AGCAGCGGCT GTTGCTGGAA GCCGCGTGGG AGACCTTCGA GGACGCTGCC
GTCGACCCGA CGTCGCTGAA GGGCGACGAC GTCGGTGTGT TCGTCGGTGC GGCCCCGCAG
GGCTACGGAT CCGGCCCGAT CGGGCCCGAG ATGCAGAGCT TCGCGGGCAC CGGGCTGGCG
TCGAGCGTGG CCTCGGGCCG GGTGTCGTAC GTGTTCGGGT TCGAGGGACC TGCGGTCACC
ATCGACACCG CGTGTTCGTC GTCGTTGGTG GCGATTCACC TGGCCATGCA GGCGTTGCGG
CAGGGTGAGT GCTCGTTGGC GCTGGCGGGC GGCGCGATGG TGATGTCCAG CCCCAATTCC
TTCGTGGTGT TTTCCCGGCA GCGGGGGTTG GCTGCCGATG GGCGGTGTAA GGCGTATGCG
GACGGTGCGG ATGGGATGGG GTTGGCTGAG GGGGTTGGGT TGGTGTTGTT GGAGCGGTTG
TCGGTGGCTC GGGAGCGTGG GCATCGGGTT TTGGCGGTGT TGCGGGGTAG TGCGGTGAAT
CAGGATGGTG CGTCGAATGG GTTGACGGCG CCGAATGGTC CGTCGCAGCA GCGGGTGATT
CGTGCGGCGT TGGCGAGTGC GGGGTTGGCG CCGTCCGAGG TGGATGTTGT TGAGGGGCAT
GGTACGGGTA CGTCGTTGGG TGATCCGATC GAGGCGCAGG CGTTGCTGGC CACGTATGGC
CAGGGTCGTG GTTCTGGCCA GCCGCTGTGG TTGGGGTCGT TGAAGTCGAA CATCGGGCAC
GCGCAGGCGG CGGCGGGTGT GGCCAGCGTG ATCAAGATGG TGCAGGCACT ACGCCACGAG
GTCATGCCAC CGAGCCTGCA CATCGACGGT CCCAGCACCA GGGTGGACTG GTCGGCGGGG
GCGGTGCAGC TGCTGACCGA GGCGCGCCAG TGGCCACGCG ACGCACGACC GCGTCGAGTC
GGTGTGTCGT CGTTCGGAGT CAGTGGCACC AATGCTCATC TGATTCTCGA GGAGGCGCCG
GGGGAGCCCG AGGTGGCTGA GGTGCCGGCT GAGGAGGTTC CGGTTCAGGG TGTGGTGCCG
TTGGTGGTGT CGGCGCGTAG TGGGACGTCG TTGGTGGGGC AGGCTGCTCG GCTGGGGGCG
TTTCTTGAGG GGGTGGAGGT GCCGTTGGCG GGTGTGGCGG GTGGGTTGGT TTCTGGTCGG
GCGGTGTTTG GTGAGCGTGC TGTGGTGGTG GCGGGTTCCC GGGTTGAGGC GAGGGCGGGG
CTCGCGGCGT TGGCTGACGG TGTGGATGTG GCGGGTGTGG TTACGGGTCG GGTGGGTGTG
CGGGGTGGGG TGGTGTGGGT GTTTCCGGGT CAGGGGACGC AGTGGTTGGG GATGGGTCGG
GAGTTGTTGG ATTCGTCGTC GGTGTTTGCG GGGCGGGTTG CTGAGTGTGC GGTGGCGTTG
GGGCGGTGGG TGGATTGGTC GTTGGTGGAT GTGTTGCGTG GTGAGGTTGG TGGTGGGTTG
TTGGAGCGGG TTGATGTGGT GCAGCCGGCG TGTTTTGCGG TGATGGTTGG TTTGGCGGCG
GTGTGGGAGT CGGTGGGTGT GCGGCCTGAT GTGGTGGTGG GTCATTCGCA GGGTGAGATT
GCGGCGGCGT GTGTGGCGGG TGCGTTGTCG CTTGAGGATG CGGCGCGGGT GGTGGCGTTG
CGTAGTCGGG CGATTGGTTC GGTGTTGTCT GGTCGGGGTG GTATGGCGTC GGTGGCGTTG
GGTGAGGAGG AGGTGGTGGC GCGGTTGGGT CCGTGGGGGG GTCGGGTGGA GGTGGCTGCG
GTTAATGGTC CTTCTTCGGT GGTGGTTGCG GGTGATGGTG GGGCGTTGGA TGAGGTGTTG
GGGTTGTTGG TGGGTGAGGG TGTTCGGGTG CGGCGGGTGG CGGTGGATTA TGGGTCGCAT
TCGAGTCAGG TGGAGGCGCT TGAGGGTGTG CTTGCTGAGG CGTTGGTGGA TGTGCGGGGG
TTGGCGCCGA GGGTGCCGTT GTATTCGACG GTGACGGGTG AGTGGGTTCG GGATGCGGGG
GTTGTGGATG GTGGGTATTG GTATCGGAAT TTGCGTGGGC AGGTGCGGTT TGGGTCGGCG
GTGGCGGATT TGGTTGGGTT GGGGTATCGG ACGTTTGTGG AGGTGAGTGC TCATCCGGTG
TTGGTTCAGC CGATCAGTGA GGTTGTTGAG GGTTCTGAGG TGGTGGTTAC GGGGACGTTG
CGTCGGGATG AGGGTGGTTT GCGGCGGTTG TTTATGTCGA TGGCTGAGTT GTTTGTTCGG
GGTGTGTCGG TGGATTGGGC TGCGGTGGTG CCGTCGGTGG GTCCGCGGGT GGAGTTACCG
ACGTATGCCT TTGACCATCA GCACTACTGG CTGCAGACCG AGGAGACGAC CGATGCGGCC
TCGCTGGGTC AGTCCGTAAC GGACCACCCG TTGCTGGATG CCCTCGTGCC ATTGCCCCAG
TCGGACGGCG CGGTGTTCAC CTCGTACCTG TCGTTGCGGT CGCAGCCGTG GCTGGCCGAC
CACGCGATCG GCGAGGTCGT GCTCTTTCCC GGCACTGGTC TGGTGGAGCT GGCCCTACGG
GCCGGCGACG AGATCGGTTG TCCGGTGCTG AACGAACTCG TGACGGAGGC GCCGCTGGTG
GTGCCCGAGC ACGGCGGCGT TCGGCTCCAG GTCGCGGTCG GCGGACCGGA CGACACCGGT
GCGCGTCCGG TGGACGTGTA CTCGCTGCGC GAGGACGGCG CCGACGGATG GACGCGGCAC
GCCACCGGTG TGCTGTCGGC AGCCTCCGGT GACGCCGGCA CCGGGTTCGA CTTCACGGCG
TGGCCGCCCT CGGGCGCACA GCGGGTAGCG GTCGGGGATC TCTACCCCGA GCTGGCCGCG
CGTGGTTACG CCTACGGGCC CATGTTCCAG GGAGTGCGGT CGGTGTGGCA GCGCGGTGAG
GAGGTGTTCG CCGAGGTGGC CCTGCCCGAG GAACACCGAG GGGACGCCGC CGCGTACGGC
ATCCACCCCG CGTTGCTGGA CGCGGCCCTG CAGACGGGCA CGGTCGCAGC GGCCACAACG
GCCAGCGACG CTACCGGCGC ACCCGCCCCC GACGGCCAGC CCCCCGCGGC GGCCGGAACG
GACGAGCAAC CCGGACGGGC GGTGATGCCG TTCGCGTGGA ACGGGCTTGT GCTGCACGCC
GTGGGCGCGT CGGCGTTGCG GGTCCGGGTC ACGCCAGCCG GTCCCGACGC GATGACCGTC
GAGGCAGCCG ACCAGACCGG CGGCCGGGTC CTGACCTTGG ACTCGCTGGT GTTGCGGGCC
GTGCCCACCG AACAGGCACC CGCGGCGGCC AGCTCGCTGT TCCAGGTCGA CTGGGTCGAA
CGTCCCGCGG ACGCGGGGCA GCCGTCGCCG CCGTGGGTGG CGGTGGCCAC GGCCGACGAC
GTGGCCGCGC TGACCGGTCC GCCCGCGGTG GCGGTGCTGA CGGCGATCGG CGACGGGGAC
GCGTTGGCCG TCACGTCGCG GGTCTTGGCG GTCGTGCGGC AGTGGCTGGC GGCAGCCGAA
CTGGACGGGT CGCGGCTCGT GGTAGCCACC CGGGGGGCGG TGCCCGCCGG CGACGGCGTG
GTGACCGATC CCGCCGCATC GGCCGTGTGG GGTCTGGTGC GTGCCGCGCA GGCTGAGAAC
CCGGACCGGA TCGTGCTGCT GGACTGCGAC CCCGTCGCCA CCGATGGACC CGAGGCGGTG
CTGGGTGCGG TGCTGGCCAG TGCCGAGCCT CAGGTCGCGG TACGTGGGCG GACCCTGTCC
GTGCCGCGCC TTGCCCGCGC CCCCCGGGCC ACGGACTCCC CGGCCGGATT CGGCCCGGAC
TCGACGGTGC TGGTCTCGGG CGCCGGGTCG TTGGGTGCCC TGGCGGCCCG CCGCCTGGTC
GCCCGGCACG GTGTGCGGCG CCTGGTGCTG GCCAGCCGCC GGGGCCGCGA CGCCGACGGG
GTGGCGGACC TGGTGGCCGA GTTGACCGGG CTGGGCGCTG ACGTGTCGGT CGTCGCCTGT
GACCTGTCCG ACCGGGACCA GGTGGCGGCG CTGCTGGCGG AGCAGGGTCC GACTGCCGTC
GTGCACACGG CGGGCGTGTT CGACGCCGGG GTGGTCGGGG CGTTGACCCC GGACAAACTA
GCCAGGGTGT TCGCACCGAA GGTCGATGCG GTACGGCACC TGGACGAGCT CACCCGTGCC
CTCGCCCTCG ATGCGTTCGT CGTCTACTCG TCCGCGTCGT CGATCTTCAT GGGTGCGGGT
AGTGGCGGCT ACGCGGCCGC CAACGCCTAC CTGGACGGCC TGATGGCCCA CCGCAGGGCG
GCGGGCCTGC CGGGGCTGTC GCTGGCCTGG GGGCCGTGGC AGCAGCTCAC CGGCATGGCG
GACACCATCG ACGACCTCAC CCTGGATCGG ATGAGCCGGC GCGAGGGGCG CGGGGGAGTG
CTGGGTCTCG GGTCCGAGGA CGGCATGGAT CTGTTCGACG CCGCTCTGGC GTGCGAGTCG
GCGCTGTTGG TTCCGGTCAG GCTGGACCTG CGGCAGGTGC GGGCAGAGGC CGCCATCGGC
GGCGTACCGC ACCTGCTGCG CGGTGTGGTC CGGTCGGGCC GGCAGTCGGC GCGGGCGGCG
TCCGGTGGGG ACGGTGGATT GGCCCGCCGA CTTGCCGAAC TCGCGCCGGC CGGCCGAGAG
GCACTGCTGC TGGACCTGGT ACGCGCTCAG GTCGCGGTCG TACTCGGGCA CTCCGACGCT
GGTGCCGTTC GGGCCGACGC GGCGTTCAGG GACGCTGGCT TCGACTCGCT CACATCGGTG
GAGCTGCGCA ACCGGCTGCG GGAGGCGACC GGCCTGAAGC TGCCGGCCAC CCTGGTGTTC
GACTATCCGA GCGCACAGGC CCTCGCCCGG TACCTGTGCG CCGAACTCAC CGTCGACGAG
ATGTCCCCGG TCGACTCCGT GCTGGCCGAT CTCACCGGCC TGGAGTCGGC GATCGGGTCC
GTGGCCGCCG ACGACGAGGC CCGCGAGCAG ATCACCGGGC GCCTGCGGGA CCTGCTGGCC
GTGGCCGAGG CGGCTGCTGA TCCGGACCCG TCCGACGACG ATCTCGACGC CGCCAGCGAC
GAGGAGCTTT TCGCGCTCGT CGACCGCTTC GCCTGA
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| Protein sequence | MSASYEKVVE ALRRSVAEAG ELRKRNRQLL GASREPIAIV GMACRLPGGV AGPADLWRLV
SEGRDAVSGF PTDRGWDLVG LFDPDPDRPG TSYVSQGGFL SEAGLFDAGF FGISPREALA
MDPQQRLLLE AAWETFEDAA VDPTSLKGDD VGVFVGAAPQ GYGSGPIGPE MQSFAGTGLA
SSVASGRVSY VFGFEGPAVT IDTACSSSLV AIHLAMQALR QGECSLALAG GAMVMSSPNS
FVVFSRQRGL AADGRCKAYA DGADGMGLAE GVGLVLLERL SVARERGHRV LAVLRGSAVN
QDGASNGLTA PNGPSQQRVI RAALASAGLA PSEVDVVEGH GTGTSLGDPI EAQALLATYG
QGRGSGQPLW LGSLKSNIGH AQAAAGVASV IKMVQALRHE VMPPSLHIDG PSTRVDWSAG
AVQLLTEARQ WPRDARPRRV GVSSFGVSGT NAHLILEEAP GEPEVAEVPA EEVPVQGVVP
LVVSARSGTS LVGQAARLGA FLEGVEVPLA GVAGGLVSGR AVFGERAVVV AGSRVEARAG
LAALADGVDV AGVVTGRVGV RGGVVWVFPG QGTQWLGMGR ELLDSSSVFA GRVAECAVAL
GRWVDWSLVD VLRGEVGGGL LERVDVVQPA CFAVMVGLAA VWESVGVRPD VVVGHSQGEI
AAACVAGALS LEDAARVVAL RSRAIGSVLS GRGGMASVAL GEEEVVARLG PWGGRVEVAA
VNGPSSVVVA GDGGALDEVL GLLVGEGVRV RRVAVDYGSH SSQVEALEGV LAEALVDVRG
LAPRVPLYST VTGEWVRDAG VVDGGYWYRN LRGQVRFGSA VADLVGLGYR TFVEVSAHPV
LVQPISEVVE GSEVVVTGTL RRDEGGLRRL FMSMAELFVR GVSVDWAAVV PSVGPRVELP
TYAFDHQHYW LQTEETTDAA SLGQSVTDHP LLDALVPLPQ SDGAVFTSYL SLRSQPWLAD
HAIGEVVLFP GTGLVELALR AGDEIGCPVL NELVTEAPLV VPEHGGVRLQ VAVGGPDDTG
ARPVDVYSLR EDGADGWTRH ATGVLSAASG DAGTGFDFTA WPPSGAQRVA VGDLYPELAA
RGYAYGPMFQ GVRSVWQRGE EVFAEVALPE EHRGDAAAYG IHPALLDAAL QTGTVAAATT
ASDATGAPAP DGQPPAAAGT DEQPGRAVMP FAWNGLVLHA VGASALRVRV TPAGPDAMTV
EAADQTGGRV LTLDSLVLRA VPTEQAPAAA SSLFQVDWVE RPADAGQPSP PWVAVATADD
VAALTGPPAV AVLTAIGDGD ALAVTSRVLA VVRQWLAAAE LDGSRLVVAT RGAVPAGDGV
VTDPAASAVW GLVRAAQAEN PDRIVLLDCD PVATDGPEAV LGAVLASAEP QVAVRGRTLS
VPRLARAPRA TDSPAGFGPD STVLVSGAGS LGALAARRLV ARHGVRRLVL ASRRGRDADG
VADLVAELTG LGADVSVVAC DLSDRDQVAA LLAEQGPTAV VHTAGVFDAG VVGALTPDKL
ARVFAPKVDA VRHLDELTRA LALDAFVVYS SASSIFMGAG SGGYAAANAY LDGLMAHRRA
AGLPGLSLAW GPWQQLTGMA DTIDDLTLDR MSRREGRGGV LGLGSEDGMD LFDAALACES
ALLVPVRLDL RQVRAEAAIG GVPHLLRGVV RSGRQSARAA SGGDGGLARR LAELAPAGRE
ALLLDLVRAQ VAVVLGHSDA GAVRADAAFR DAGFDSLTSV ELRNRLREAT GLKLPATLVF
DYPSAQALAR YLCAELTVDE MSPVDSVLAD LTGLESAIGS VAADDEAREQ ITGRLRDLLA
VAEAAADPDP SDDDLDAASD EELFALVDRF A
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