More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2953 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  51.89 
 
 
4575 aa  775    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  39.78 
 
 
1559 aa  644    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  46.93 
 
 
2113 aa  743    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  45.89 
 
 
2374 aa  699    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  52.46 
 
 
2966 aa  858    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  48.99 
 
 
1924 aa  751    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  53.59 
 
 
3493 aa  877    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  48.83 
 
 
3148 aa  701    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  53.44 
 
 
6768 aa  896    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  46.19 
 
 
3033 aa  727    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  49.49 
 
 
4607 aa  786    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3480  Mycocerosate synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  47.81 
 
 
4264 aa  735    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  49.84 
 
 
3254 aa  806    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  52.76 
 
 
4151 aa  902    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  48.98 
 
 
2719 aa  793    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  44.78 
 
 
2066 aa  699    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  44.28 
 
 
1955 aa  643    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.82 
 
 
5400 aa  737    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  53.07 
 
 
3494 aa  877    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.35 
 
 
2551 aa  684    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.26 
 
 
1874 aa  638    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  41.64 
 
 
1144 aa  687    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  40.44 
 
 
1587 aa  678    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  51.49 
 
 
3158 aa  842    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3479  Acyl transferase  43.99 
 
 
1077 aa  653    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  53.74 
 
 
5255 aa  866    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  36.13 
 
 
1087 aa  638    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  53.85 
 
 
3449 aa  1000    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  51.75 
 
 
3670 aa  825    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  46.94 
 
 
2367 aa  714    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  49.94 
 
 
4080 aa  756    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  44.57 
 
 
1126 aa  687    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  100 
 
 
1114 aa  2251    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  51.4 
 
 
2020 aa  818    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  43.65 
 
 
2081 aa  691    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  49.3 
 
 
4930 aa  784    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  43.32 
 
 
2230 aa  702    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  46.73 
 
 
1548 aa  741    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  43.11 
 
 
3424 aa  660    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.97 
 
 
7110 aa  894    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  42.35 
 
 
3693 aa  643    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  47.19 
 
 
3711 aa  754    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  50.6 
 
 
2108 aa  862    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  46.34 
 
 
1909 aa  692    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  53.36 
 
 
3408 aa  903    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3478  Acyl transferase  45.79 
 
 
1573 aa  678    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  45.4 
 
 
2136 aa  696    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  45.54 
 
 
2376 aa  698    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.67 
 
 
1559 aa  641    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  52.34 
 
 
3508 aa  872    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  35.51 
 
 
1354 aa  645    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.83 
 
 
3092 aa  755    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  51.68 
 
 
2126 aa  882    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  51.84 
 
 
1831 aa  872    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  49.03 
 
 
4111 aa  846    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  40.9 
 
 
1071 aa  667    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  47.76 
 
 
4840 aa  718    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  51.23 
 
 
1584 aa  912    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  49.46 
 
 
1601 aa  889    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  48.8 
 
 
1602 aa  766    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  42.35 
 
 
3693 aa  643    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  52.96 
 
 
7210 aa  883    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  47.97 
 
 
1305 aa  805    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  56.69 
 
 
1867 aa  994    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.41 
 
 
3874 aa  832    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  43.94 
 
 
2078 aa  654    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  42.67 
 
 
3176 aa  637    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  42.14 
 
 
3676 aa  639    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.22 
 
 
1837 aa  702    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  50.49 
 
 
2090 aa  832    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  54.9 
 
 
7279 aa  910    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  44.73 
 
 
4183 aa  694    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  45.53 
 
 
1101 aa  749    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  50.05 
 
 
1820 aa  832    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  45.04 
 
 
2890 aa  682    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  51.9 
 
 
1789 aa  890    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  53.24 
 
 
3355 aa  871    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  44.15 
 
 
2232 aa  713    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  41.6 
 
 
1939 aa  665    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  44.76 
 
 
1143 aa  777    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  47.71 
 
 
2107 aa  685    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  42.46 
 
 
3702 aa  644    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  47.66 
 
 
3463 aa  741    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  47.83 
 
 
4882 aa  756    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  49.43 
 
 
1593 aa  817    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  45.34 
 
 
3281 aa  749    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.95 
 
 
1816 aa  734    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  53.12 
 
 
5154 aa  913    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  50.11 
 
 
2846 aa  780    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  56.92 
 
 
3930 aa  984    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  49.35 
 
 
2277 aa  835    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  42.77 
 
 
2024 aa  633  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  40.04 
 
 
1656 aa  626  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  41.55 
 
 
1832 aa  627  1e-178  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  40.82 
 
 
3679 aa  626  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  40.72 
 
 
2225 aa  623  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  39.83 
 
 
1966 aa  624  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  43.74 
 
 
2847 aa  617  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  40.9 
 
 
4478 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  39.42 
 
 
2333 aa  612  1e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>