More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2954 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11205  polyketide beta-ketoacyl synthase pks4  34.89 
 
 		 2101 aa  643    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  40.26 
 
 		 3711 aa  1298    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  47.6 
 
 		 2376 aa  746    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  40.72 
 
 		 2232 aa  786    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  44.52 
 
 		 3158 aa  2038    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  37.54 
 
 		 2230 aa  800    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  32.68 
 
 		 1876 aa  705    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11560  polyketide synthase pks5  34.52 
 
 		 2108 aa  640    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  46.77 
 
 		 1584 aa  1204    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  41.58 
 
 		 2367 aa  853    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  41.84 
 
 		 5255 aa  1382    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  40.46 
 
 		 2719 aa  1006    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  38.64 
 
 		 2066 aa  993    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  38.83 
 
 		 4575 aa  1012    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  36.72 
 
 		 3101 aa  660    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  44.55 
 
 		 2126 aa  1038    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  42.1 
 
 		 3494 aa  1385    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  43.33 
 
 		 7279 aa  1633    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  40.88 
 
 		 2024 aa  952    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.49 
 
 		 2551 aa  1133    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 		 1874 aa  940    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  40.85 
 
 		 1656 aa  707    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  43.17 
 
 		 1144 aa  702    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  42.49 
 
 		 1587 aa  714    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  40.44 
 
 		 4151 aa  1050    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  45.11 
 
 		 3408 aa  1200    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  44.17 
 
 		 2090 aa  1224    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  47.54 
 
 		 1071 aa  720    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  48.12 
 
 		 3148 aa  671    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  33.94 
 
 		 1537 aa  697    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  38.79 
 
 		 2880 aa  771    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  46.34 
 
 		 1548 aa  726    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  37.79 
 
 		 2333 aa  745    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  41.88 
 
 		 3176 aa  846    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  41.11 
 
 		 3463 aa  1336    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  46.33 
 
 		 3254 aa  1156    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  42.44 
 
 		 2081 aa  1073    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  31.34 
 
 		 3111 aa  800    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  40.7 
 
 		 3508 aa  1395    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  38.31 
 
 		 2060 aa  694    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  47.99 
 
 		 5154 aa  1268    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  40.46 
 
 		 4111 aa  1016    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.03 
 
 		 7110 aa  1511    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  36.62 
 
 		 3693 aa  1577    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  36.54 
 
 		 1520 aa  758    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  44.54 
 
 		 3355 aa  1155    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  33.62 
 
 		 3130 aa  1071    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  35.81 
 
 		 2085 aa  690    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3472  beta-ketoacyl synthase  34.06 
 
 		 1704 aa  684    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  32.5 
 
 		 2551 aa  639    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  43.71 
 
 		 1789 aa  1276    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  39.3 
 
 		 1354 aa  664    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  41.43 
 
 		 4930 aa  1228    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  44.76 
 
 		 3493 aa  2357    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  44.21 
 
 		 7210 aa  1546    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  36.99 
 
 		 1832 aa  845    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  49.69 
 
 		 1143 aa  805    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  46.8 
 
 		 2966 aa  958    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  40.75 
 
 		 2107 aa  976    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  37.46 
 
 		 4478 aa  880    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  36.7 
 
 		 3645 aa  808    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.62 
 
 		 3874 aa  1344    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  42.81 
 
 		 3033 aa  1628    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  36.62 
 
 		 3693 aa  1577    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  36.54 
 
 		 1520 aa  758    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.89 
 
 		 1816 aa  1196    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  34.78 
 
 		 1939 aa  930    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  35.81 
 
 		 2085 aa  690    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3535  beta-ketoacyl synthase  34.06 
 
 		 1704 aa  684    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  36.59 
 
 		 3676 aa  1535    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  39.18 
 
 		 1087 aa  679    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  36.95 
 
 		 3696 aa  1593    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  39.58 
 
 		 1602 aa  867    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  37.98 
 
 		 1805 aa  659    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  39.14 
 
 		 3670 aa  1105    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  33.91 
 
 		 1559 aa  862    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  32.28 
 
 		 1828 aa  692    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  42.55 
 
 		 1924 aa  1083    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  49.45 
 
 		 6768 aa  1256    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  47.04 
 
 		 1601 aa  1234    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.81 
 
 		 3092 aa  1795    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  37.84 
 
 		 1349 aa  720    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  36.04 
 
 		 2220 aa  660    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  43.15 
 
 		 1955 aa  1048    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.7 
 
 		 5400 aa  1314    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  36.72 
 
 		 3702 aa  1575    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  31.19 
 
 		 2762 aa  741    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  47.82 
 
 		 2374 aa  756    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  36.12 
 
 		 2085 aa  690    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3485  beta-ketoacyl synthase  33.74 
 
 		 1704 aa  681    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  31.71 
 
 		 2462 aa  788    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  39.53 
 
 		 4840 aa  1263    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  48.09 
 
 		 1593 aa  842    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  37.24 
 
 		 3679 aa  1536    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  42.99 
 
 		 1831 aa  1209    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2690  beta-ketoacyl synthase  33.5 
 
 		 1698 aa  654    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.588409  normal  0.25936 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4951  Beta-ketoacyl synthase  33.72 
 
 		 1835 aa  731    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  39.77 
 
 		 2847 aa  1050    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3392  acyl transferase domain-containing protein  44.87 
 
 		 1822 aa  641    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572453  normal  0.26547 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3963  Beta-ketoacyl synthase  32.67 
 
 		 3090 aa  903    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>